Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G005800.1
Synonym Sb06g000670
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RBC0
Pfam -
Panther DB PTHR33994 PTHR33994:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g40590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G353100 expressed protein -
2 Sobic.003G090650 - -
3 Sobic.008G154900 expressed protein -
4 Sobic.005G110900 expressed protein -
5 Sobic.006G005900 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
6 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.003G382400 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
8 Sobic.005G218000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
9 Sobic.003G011700 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative, expressed K00606: 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase
10 Sobic.006G117900 brevis radix, putative, expressed -
11 Sobic.006G092300 ZOS4-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
13 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G049600 expressed protein -
15 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G491400 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.002G312200 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GLW7(Ortholog in rice:Si et al., 2016)"(PubMedID : 31659860)@SQUAMOSA promoter binding-like transcription factor(PubMedID : 27016024)@OsSPL13 - SBP-box gene family member, expressed -
18 Sobic.008G013400 nodulin, putative, expressed -
19 Sobic.005G006500 - -
20 Sobic.008G114200 AGAP002737-PA, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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