Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G248300.1
Synonym PGIP2, Sb02g028440, ATPGIP2
Functional annotation polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed
UniProt C5X3Y0
Pfam PF08263 PF00560
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF154
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12145 : Leucine-rich repeat (LRR) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31450.1 : polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047457
Brachypodium KQJ90764
Barley HORVU5Hr1G073500.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic002G248300--Sobic005G006500 Sobic002G129800 Sobic002G129800 Sobic002G248300--Sobic002G129800 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic002G248300--Sobic005G164000 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic002G248300--Sobic003G090650 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic002G248300--Sobic002G353100 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic002G248300--Sobic006G005800 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic002G248300--Sobic004G309700 Sobic003G140100 Sobic003G140100 Sobic002G248300--Sobic003G140100 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic002G248300--Sobic005G110900 Sobic005G006500--Sobic002G248300 Sobic005G006500--Sobic005G164000 Sobic005G006500--Sobic002G129800 Sobic005G006500--Sobic002G353100 Sobic005G006500--Sobic003G090650 Sobic005G006500--Sobic003G140100 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic006G005800 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic005G006500--Sobic001G266100 Sobic002G129800--Sobic002G248300 Sobic002G129800--Sobic005G006500 Sobic002G129800--Sobic005G164000 Sobic002G129800--Sobic002G353100 Sobic002G129800--Sobic003G140100 Sobic002G129800--Sobic001G266100 Sobic002G129800--Sobic003G090650 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic002G129800--Sobic001G152400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic002G129800--Sobic010G049600 Sobic005G164000--Sobic005G006500 Sobic005G164000--Sobic002G248300 Sobic005G164000--Sobic003G140100 Sobic005G164000--Sobic002G129800 Sobic002G157400 Sobic002G157400 Sobic005G164000--Sobic002G157400 Sobic004G223100 Sobic004G223100 Sobic005G164000--Sobic004G223100 Sobic010G053500 Sobic010G053500 Sobic005G164000--Sobic010G053500 Sobic005G226600 Sobic005G226600 Sobic005G164000--Sobic005G226600 Sobic005G164000--Sobic001G152400 Sobic003G090650--Sobic002G353100 Sobic003G090650--Sobic006G005800 Sobic003G090650--Sobic002G248300 Sobic003G090650--Sobic005G110900 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic003G090650--Sobic006G042500 Sobic003G090650--Sobic004G309700 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic005G006500 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic003G090650--Sobic002G183800 Sobic002G353100--Sobic003G090650 Sobic002G353100--Sobic006G005800 Sobic002G353100--Sobic005G110900 Sobic002G353100--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic002G248300 Sobic002G353100--Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic005G006500 Sobic002G353100--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic004G309700--Sobic003G090650 Sobic009G146000 Sobic009G146000 Sobic004G309700--Sobic009G146000 Sobic006G281132 Sobic006G281132 Sobic004G309700--Sobic006G281132 Sobic002G028201 Sobic002G028201 Sobic004G309700--Sobic002G028201 Sobic008G156100 Sobic008G156100 Sobic004G309700--Sobic008G156100 Sobic004G309700--Sobic002G353100 Sobic004G309700--Sobic002G248300 Sobic005G006000 Sobic005G006000 Sobic004G309700--Sobic005G006000 Sobic004G309700--Sobic006G005800 Sobic003G140100--Sobic002G157400 Sobic003G140100--Sobic010G053500 Sobic007G049600 Sobic007G049600 Sobic003G140100--Sobic007G049600 Sobic001G428300 Sobic001G428300 Sobic003G140100--Sobic001G428300 Sobic003G140100--Sobic005G164000 Sobic002G360801 Sobic002G360801 Sobic003G140100--Sobic002G360801 Sobic003G140100--Sobic005G226600 Sobic008G016500 Sobic008G016500 Sobic003G140100--Sobic008G016500 Sobic003G140100--Sobic004G223100 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic001G266100 Sobic005G110900--Sobic003G382400 Sobic005G110900--Sobic002G353100 Sobic005G110900--Sobic005G218000 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic005G110900--Sobic006G160800 Sobic005G110900--Sobic006G005800 Sobic005G110900--Sobic003G090650 Sobic005G110900--Sobic002G183800
Octagon: transcription factors


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