Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G346500.1
Synonym Sb04g037340
Functional annotation heavy metal-associated domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RRD9
Pfam PF00403
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF100
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60800 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57360.1 : heavy metal-associated domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032790 , Zm00025a032791
Brachypodium KQK01380 , KQK11982
Barley HORVU5Hr1G125030.4 , HORVU5Hr1G125030.5 , HORVU6Hr1G091170.2 , HORVU6Hr1G091170.3 , HORVU6Hr1G091170.1 , HORVU6Hr1G091170.6 , HORVU6Hr1G091170.4 , HORVU6Hr1G091170.5 , HORVU5Hr1G125030.2 , HORVU5Hr1G125030.6 , HORVU5Hr1G125030.1 , HORVU5Hr1G125030.3
Wheat TraesCS6A02G393700 , TraesCS4A02G316200 , TraesCS5D02G566500 , TraesCS5B02G563300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G006500 - -
2 Sobic.006G117900 brevis radix, putative, expressed -
3 Sobic.006G184000 cytochrome P450, putative, expressed -
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20 Sobic.003G090650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic004G346500--Sobic005G006500 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic004G346500--Sobic006G117900 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G184000 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic004G346500--Sobic006G005800 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic004G346500--Sobic009G153900 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic004G346500--Sobic001G152400 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic004G346500--Sobic005G164000 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic004G346500--Sobic002G248300 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G346500--Sobic007G115400 Sobic005G006500--Sobic002G248300 Sobic005G006500--Sobic005G164000 Sobic002G129800 Sobic002G129800 Sobic005G006500--Sobic002G129800 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic005G006500--Sobic002G353100 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic005G006500--Sobic003G090650 Sobic003G140100 Sobic003G140100 Sobic005G006500--Sobic003G140100 Sobic005G006500--Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic006G005800 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic005G006500--Sobic001G266100 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic006G117900--Sobic006G092300 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G117900--Sobic005G218000 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic006G117900--Sobic002G179200 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic006G117900--Sobic001G366000 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic006G117900--Sobic007G076100 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic006G117900--Sobic001G341700 Sobic002G312200 Sobic002G312200 Sobic006G117900--Sobic002G312200 Sobic004G318800 Sobic004G318800 Sobic006G117900--Sobic004G318800 Sobic006G117900--Sobic006G005800 Sobic010G050500 Sobic010G050500 Sobic006G184000--Sobic010G050500 Sobic001G185000 Sobic001G185000 Sobic006G184000--Sobic001G185000 Sobic001G447800 Sobic001G447800 Sobic006G184000--Sobic001G447800 Sobic006G184000--Sobic003G090650 Sobic006G184000--Sobic004G346500 Sobic006G281132 Sobic006G281132 Sobic006G184000--Sobic006G281132 Sobic002G028201 Sobic002G028201 Sobic006G184000--Sobic002G028201 Sobic008G156100 Sobic008G156100 Sobic006G184000--Sobic008G156100 Sobic009G146000 Sobic009G146000 Sobic006G184000--Sobic009G146000 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic002G165500 Sobic002G165500 Sobic009G153900--Sobic002G165500 Sobic009G153900--Sobic001G266100 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic009G153900--Sobic001G491400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic009G153900--Sobic010G049600 Sobic007G029900 Sobic007G029900 Sobic009G153900--Sobic007G029900 Sobic009G153900--Sobic001G366000 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic009G153900--Sobic005G054800 Sobic004G041700 Sobic004G041700 Sobic009G153900--Sobic004G041700 Sobic009G153900--Sobic001G152400 Sobic009G046000 Sobic009G046000 Sobic001G152400--Sobic009G046000 Sobic001G152400--Sobic010G049600 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic001G152400--Sobic005G200700 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic001G152400--Sobic010G215700 Sobic001G152400--Sobic001G491400 Sobic001G152400--Sobic001G366000 Sobic001G152400--Sobic007G029900 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic001G152400--Sobic007G000600 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic001G152400--Sobic002G399600 Sobic005G164000--Sobic005G006500 Sobic005G164000--Sobic002G248300 Sobic005G164000--Sobic003G140100 Sobic005G164000--Sobic002G129800 Sobic002G157400 Sobic002G157400 Sobic005G164000--Sobic002G157400 Sobic004G223100 Sobic004G223100 Sobic005G164000--Sobic004G223100 Sobic010G053500 Sobic010G053500 Sobic005G164000--Sobic010G053500 Sobic005G226600 Sobic005G226600 Sobic005G164000--Sobic005G226600 Sobic005G164000--Sobic001G152400 Sobic002G248300--Sobic005G006500 Sobic002G248300--Sobic002G129800 Sobic002G248300--Sobic005G164000 Sobic002G248300--Sobic003G090650 Sobic002G248300--Sobic002G353100 Sobic002G248300--Sobic006G005800 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic002G248300--Sobic004G309700 Sobic002G248300--Sobic003G140100 Sobic002G248300--Sobic005G110900 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic007G115400--Sobic004G211700 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic007G115400--Sobic004G302700 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic007G115400--Sobic001G046400 Sobic009G023900 Sobic009G023900 Sobic007G115400--Sobic009G023900 Sobic007G115400--Sobic006G117900 Sobic007G115400--Sobic005G110900 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic007G115400--Sobic003G283900 Sobic004G211800 Sobic004G211800 Sobic007G115400--Sobic004G211800 Sobic007G115400--Sobic001G341700
Octagon: transcription factors


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