Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G121400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QIL3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G346500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G184000 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.010G050500 OsMADS5 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
4 Sobic.006G155600 CRP1 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
5 Sobic.006G084900 - -
6 Sobic.009G172000 FAR1 family protein, expressed -
7 Sobic.010G133300 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
8 Sobic.001G185000 NBS-LRR type disease resistance protein Rps1-k-1, putative, expressed -
9 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G117900 brevis radix, putative, expressed -
11 Sobic.006G274000 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
12 Sobic.001G447800 OsFBO13 - F-box and other domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G006500 - -
14 Sobic.003G006600 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
15 Sobic.001G366000 LTPL1 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.006G006600 - -
17 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G005800 expressed protein -
19 Sobic.008G114200 AGAP002737-PA, putative, expressed -
20 Sobic.001G152400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G121400 Sobic001G121400 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic001G121400--Sobic004G346500 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic001G121400--Sobic006G184000 Sobic010G050500 Sobic010G050500 Sobic001G121400--Sobic010G050500 Sobic006G155600 Sobic006G155600 Sobic001G121400--Sobic006G155600 Sobic006G084900 Sobic006G084900 Sobic001G121400--Sobic006G084900 Sobic009G172000 Sobic009G172000 Sobic001G121400--Sobic009G172000 Sobic010G133300 Sobic010G133300 Sobic001G121400--Sobic010G133300 Sobic001G185000 Sobic001G185000 Sobic001G121400--Sobic001G185000 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic001G121400--Sobic009G153900 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic004G346500--Sobic005G006500 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic004G346500--Sobic006G117900 Sobic004G346500--Sobic006G184000 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic004G346500--Sobic006G005800 Sobic004G346500--Sobic009G153900 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic004G346500--Sobic001G152400 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic004G346500--Sobic005G164000 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic004G346500--Sobic002G248300 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G346500--Sobic007G115400 Sobic006G184000--Sobic010G050500 Sobic006G184000--Sobic001G185000 Sobic001G447800 Sobic001G447800 Sobic006G184000--Sobic001G447800 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic006G184000--Sobic003G090650 Sobic006G184000--Sobic004G346500 Sobic006G281132 Sobic006G281132 Sobic006G184000--Sobic006G281132 Sobic002G028201 Sobic002G028201 Sobic006G184000--Sobic002G028201 Sobic008G156100 Sobic008G156100 Sobic006G184000--Sobic008G156100 Sobic009G146000 Sobic009G146000 Sobic006G184000--Sobic009G146000 Sobic010G050500--Sobic006G184000 Sobic010G050500--Sobic001G185000 Sobic010G050500--Sobic006G281132 Sobic010G050500--Sobic002G028201 Sobic010G050500--Sobic008G156100 Sobic005G006000 Sobic005G006000 Sobic010G050500--Sobic005G006000 Sobic010G050500--Sobic009G146000 Sobic010G050500--Sobic004G346500 Sobic010G050500--Sobic001G121400 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic006G155600--Sobic001G366000 Sobic003G006600 Sobic003G006600 Sobic006G155600--Sobic003G006600 Sobic006G155600--Sobic006G117900 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic006G155600--Sobic002G179200 Sobic002G165500 Sobic002G165500 Sobic006G155600--Sobic002G165500 Sobic006G006600 Sobic006G006600 Sobic006G155600--Sobic006G006600 Sobic006G155600--Sobic004G346500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic006G155600--Sobic004G227900 Sobic005G010600 Sobic005G010600 Sobic006G155600--Sobic005G010600 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic006G084900--Sobic007G193500 Sobic006G084900--Sobic006G155600 Sobic006G084900--Sobic001G121400 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic006G084900--Sobic008G045232 Sobic007G071600 Sobic007G071600 Sobic006G084900--Sobic007G071600 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic006G084900--Sobic001G152500 Sobic006G084900--Sobic010G133300 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic006G084900--Sobic002G289701 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic006G084900--Sobic005G085800 Sobic007G170100 Sobic007G170100 Sobic009G172000--Sobic007G170100 Sobic006G273600 Sobic006G273600 Sobic009G172000--Sobic006G273600 Sobic002G363300 Sobic002G363300 Sobic009G172000--Sobic002G363300 Sobic009G172000--Sobic006G117900 Sobic005G009600 Sobic005G009600 Sobic009G172000--Sobic005G009600 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic009G172000--Sobic006G005900 Sobic009G023900 Sobic009G023900 Sobic009G172000--Sobic009G023900 Sobic003G027100 Sobic003G027100 Sobic009G172000--Sobic003G027100 Sobic004G274600 Sobic004G274600 Sobic009G172000--Sobic004G274600 Sobic010G133300--Sobic006G155600 Sobic010G133300--Sobic004G346500 Sobic010G133300--Sobic006G084900 Sobic010G133300--Sobic001G121400 Sobic010G133300--Sobic004G227900 Sobic010G133300--Sobic006G117900 Sobic010G133300--Sobic001G366000 Sobic002G025400 Sobic002G025400 Sobic010G133300--Sobic002G025400 Sobic010G133300--Sobic003G006600 Sobic001G185000--Sobic006G184000 Sobic001G185000--Sobic010G050500 Sobic001G185000--Sobic001G447800 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic001G185000--Sobic006G042500 Sobic001G185000--Sobic003G090650 Sobic003G367100 Sobic003G367100 Sobic001G185000--Sobic003G367100 Sobic009G052300 Sobic009G052300 Sobic001G185000--Sobic009G052300 Sobic001G185000--Sobic005G006500 Sobic001G185000--Sobic006G281132 Sobic009G153900--Sobic002G165500 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic009G153900--Sobic001G266100 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic009G153900--Sobic001G491400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic009G153900--Sobic010G049600 Sobic007G029900 Sobic007G029900 Sobic009G153900--Sobic007G029900 Sobic009G153900--Sobic001G366000 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic009G153900--Sobic005G054800 Sobic004G041700 Sobic004G041700 Sobic009G153900--Sobic004G041700 Sobic009G153900--Sobic001G152400
Octagon: transcription factors


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