Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G084900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011325
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G193500 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GW8/OsPL16(Ortholog in rice:Wang et al., 2012)"(PubMedID : 31659910)@OsSPL16 - SBP-box gene family member, expressed -
2 Sobic.006G155600 CRP1 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
3 Sobic.001G121400 - -
4 Sobic.008G045232 - -
5 Sobic.007G071600 acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
6 Sobic.001G152500 OsFBX387 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G133300 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
8 Sobic.002G289701 - -
9 Sobic.005G085800 expressed protein -
10 Sobic.006G006600 - -
11 Sobic.005G030200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G069400 expressed protein -
13 Sobic.001G189800 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G021100 - -
15 Sobic.007G007650 - -
16 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
18 Sobic.008G172400 expressed protein -
19 Sobic.002G191300 expressed protein -
20 Sobic.004G346500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G084900 Sobic006G084900 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic006G084900--Sobic007G193500 Sobic006G155600 Sobic006G155600 Sobic006G084900--Sobic006G155600 Sobic001G121400 Sobic001G121400 Sobic006G084900--Sobic001G121400 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic006G084900--Sobic008G045232 Sobic007G071600 Sobic007G071600 Sobic006G084900--Sobic007G071600 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic006G084900--Sobic001G152500 Sobic010G133300 Sobic010G133300 Sobic006G084900--Sobic010G133300 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic006G084900--Sobic002G289701 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic006G084900--Sobic005G085800 Sobic007G193500--Sobic008G045232 Sobic007G193500--Sobic005G085800 Sobic007G193500--Sobic002G289701 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic007G193500--Sobic008G053000 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic007G193500--Sobic005G030200 Sobic007G193500--Sobic001G152500 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic007G193500--Sobic001G189800 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic007G193500--Sobic007G007650 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic007G193500--Sobic001G482500 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic006G155600--Sobic001G366000 Sobic003G006600 Sobic003G006600 Sobic006G155600--Sobic003G006600 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic006G155600--Sobic006G117900 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic006G155600--Sobic002G179200 Sobic002G165500 Sobic002G165500 Sobic006G155600--Sobic002G165500 Sobic006G006600 Sobic006G006600 Sobic006G155600--Sobic006G006600 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic006G155600--Sobic004G346500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic006G155600--Sobic004G227900 Sobic005G010600 Sobic005G010600 Sobic006G155600--Sobic005G010600 Sobic001G121400--Sobic004G346500 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic001G121400--Sobic006G184000 Sobic010G050500 Sobic010G050500 Sobic001G121400--Sobic010G050500 Sobic001G121400--Sobic006G155600 Sobic001G121400--Sobic006G084900 Sobic009G172000 Sobic009G172000 Sobic001G121400--Sobic009G172000 Sobic001G121400--Sobic010G133300 Sobic001G185000 Sobic001G185000 Sobic001G121400--Sobic001G185000 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic001G121400--Sobic009G153900 Sobic008G045232--Sobic002G289701 Sobic008G045232--Sobic005G030200 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic008G045232--Sobic002G191300 Sobic008G045232--Sobic001G189800 Sobic008G045232--Sobic005G085800 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic008G045232--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic008G045232--Sobic001G234700 Sobic007G071600--Sobic006G084900 Sobic007G071600--Sobic006G155600 Sobic005G035100 Sobic005G035100 Sobic007G071600--Sobic005G035100 Sobic007G071600--Sobic007G193500 Sobic007G071600--Sobic001G121400 Sobic003G212800 Sobic003G212800 Sobic007G071600--Sobic003G212800 Sobic007G071600--Sobic006G006600 Sobic007G071600--Sobic003G006600 Sobic002G025400 Sobic002G025400 Sobic007G071600--Sobic002G025400 Sobic001G152500--Sobic008G045232 Sobic002G267050 Sobic002G267050 Sobic001G152500--Sobic002G267050 Sobic001G152500--Sobic002G289701 Sobic001G152500--Sobic005G030200 Sobic001G152500--Sobic002G191300 Sobic001G152500--Sobic001G189800 Sobic001G152500--Sobic008G053000 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic001G152500--Sobic005G201800 Sobic010G212600 Sobic010G212600 Sobic001G152500--Sobic010G212600 Sobic010G133300--Sobic006G155600 Sobic010G133300--Sobic004G346500 Sobic010G133300--Sobic006G084900 Sobic010G133300--Sobic001G121400 Sobic010G133300--Sobic004G227900 Sobic010G133300--Sobic006G117900 Sobic010G133300--Sobic001G366000 Sobic010G133300--Sobic002G025400 Sobic010G133300--Sobic003G006600 Sobic002G289701--Sobic008G045232 Sobic002G289701--Sobic002G191300 Sobic002G289701--Sobic005G030200 Sobic002G289701--Sobic001G189800 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic002G289701--Sobic003G190701 Sobic009G125700 Sobic009G125700 Sobic002G289701--Sobic009G125700 Sobic002G289701--Sobic008G045100 Sobic002G289701--Sobic001G234700 Sobic005G085800--Sobic002G289701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G085800--Sobic002G067050 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic008G045232 Sobic005G085800--Sobic005G030200 Sobic005G085800--Sobic002G191300 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G085800--Sobic001G033701 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G085800--Sobic003G210701 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G085800--Sobic004G325150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.