Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G155600.1
Synonym Sb06g023270
Functional annotation CRP1 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed
UniProt C5YCJ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44600.1 : CRP1 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010480
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G366000 LTPL1 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.003G006600 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
3 Sobic.006G117900 brevis radix, putative, expressed -
4 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G165500 LTPL4 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.006G006600 - -
7 Sobic.004G346500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.005G010600 LTPL58 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.002G025400 expressed protein -
11 Sobic.006G084900 - -
12 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G046000 desiccation-related protein PCC13-62 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.008G004200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.001G152400 expressed protein -
16 Sobic.007G000600 CRP2 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
17 Sobic.001G121400 - -
18 Sobic.010G133300 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
19 Sobic.005G201900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G032400 LTPL58 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G155600 Sobic006G155600 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic006G155600--Sobic001G366000 Sobic003G006600 Sobic003G006600 Sobic006G155600--Sobic003G006600 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic006G155600--Sobic006G117900 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic006G155600--Sobic002G179200 Sobic002G165500 Sobic002G165500 Sobic006G155600--Sobic002G165500 Sobic006G006600 Sobic006G006600 Sobic006G155600--Sobic006G006600 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic006G155600--Sobic004G346500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic006G155600--Sobic004G227900 Sobic005G010600 Sobic005G010600 Sobic006G155600--Sobic005G010600 Sobic001G366000--Sobic002G165500 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic001G366000--Sobic007G000600 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic001G366000--Sobic005G200700 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic001G366000--Sobic008G032400 Sobic009G046000 Sobic009G046000 Sobic001G366000--Sobic009G046000 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic001G366000--Sobic002G399600 Sobic010G187400 Sobic010G187400 Sobic001G366000--Sobic010G187400 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic001G366000--Sobic004G349150 Sobic002G270400 Sobic002G270400 Sobic001G366000--Sobic002G270400 Sobic003G006600--Sobic002G179200 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic003G006600--Sobic008G013500 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic003G006600--Sobic001G472301 Sobic003G006600--Sobic006G117900 Sobic003G006600--Sobic001G366000 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic003G006600--Sobic001G511600 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic003G006600--Sobic007G153100 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic003G006600--Sobic005G090000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic003G006600--Sobic003G011700 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic006G117900--Sobic006G092300 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G117900--Sobic005G218000 Sobic006G117900--Sobic002G179200 Sobic006G117900--Sobic001G366000 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic006G117900--Sobic007G076100 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic006G117900--Sobic001G341700 Sobic002G312200 Sobic002G312200 Sobic006G117900--Sobic002G312200 Sobic004G318800 Sobic004G318800 Sobic006G117900--Sobic004G318800 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic006G117900--Sobic006G005800 Sobic002G179200--Sobic001G366000 Sobic002G179200--Sobic003G011700 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic002G179200--Sobic001G102600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic002G179200--Sobic008G004200 Sobic002G179200--Sobic001G511600 Sobic002G179200--Sobic006G092300 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic002G179200--Sobic010G189366 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic002G179200--Sobic003G004900 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic002G179200--Sobic001G472400 Sobic002G165500--Sobic001G366000 Sobic007G180700 Sobic007G180700 Sobic002G165500--Sobic007G180700 Sobic002G165500--Sobic007G000600 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic002G165500--Sobic006G098300 Sobic007G029900 Sobic007G029900 Sobic002G165500--Sobic007G029900 Sobic002G165500--Sobic005G200700 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic002G165500--Sobic006G267400 Sobic002G165500--Sobic002G399600 Sobic002G165500--Sobic002G270400 Sobic006G006600--Sobic006G155600 Sobic002G025400 Sobic002G025400 Sobic006G006600--Sobic002G025400 Sobic006G006600--Sobic001G366000 Sobic006G006600--Sobic003G006600 Sobic006G006600--Sobic002G179200 Sobic006G006600--Sobic006G117900 Sobic006G187300 Sobic006G187300 Sobic006G006600--Sobic006G187300 Sobic006G006600--Sobic002G165500 Sobic006G006600--Sobic005G010600 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic004G346500--Sobic005G006500 Sobic004G346500--Sobic006G117900 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G005800 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic004G346500--Sobic009G153900 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic004G346500--Sobic001G152400 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic004G346500--Sobic005G164000 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic004G346500--Sobic002G248300 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G346500--Sobic007G115400 Sobic004G227900--Sobic008G004200 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic004G227900--Sobic001G334501 Sobic010G053300 Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic010G053300 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic004G227900--Sobic005G089700 Sobic004G227900--Sobic007G000600 Sobic004G227900--Sobic001G366000 Sobic004G227900--Sobic005G200700 Sobic003G016000 Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic008G032400 Sobic005G010600--Sobic002G165500 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic005G010600--Sobic005G054800 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic005G010600--Sobic006G137000 Sobic005G010600--Sobic003G004900 Sobic005G010600--Sobic006G267400 Sobic005G010600--Sobic007G180700 Sobic005G010600--Sobic006G098300 Sobic002G173300 Sobic002G173300 Sobic005G010600--Sobic002G173300 Sobic005G010600--Sobic007G000600
Octagon: transcription factors


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