Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G274000.1
Synonym ATOFP13, OFP13, Sb06g033540
Functional annotation ATOFP18/OFP18, putative, expressed
UniProt A0A1B6PP90
Pfam PF04844
Panther DB PTHR33057 PTHR33057:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04820 : ovate family protein 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58820.1 : ATOFP18/OFP18, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057430 , Zm00025a057432
Brachypodium PNT73240 , KQJ94761
Barley HORVU0Hr1G040330.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G375300 galactosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.008G154900 expressed protein -
3 Sobic.006G005800 expressed protein -
4 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G382400 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
6 Sobic.004G346500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G160800 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G353100 expressed protein -
9 Sobic.003G090650 - -
10 Sobic.006G117900 brevis radix, putative, expressed -
11 Sobic.010G038400 expressed protein -
12 Sobic.007G043300 monocopper oxidase, putative, expressed -
13 Sobic.005G110900 expressed protein -
14 Sobic.002G179200 DUF623 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
16 Sobic.005G006500 - -
17 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.003G090700 expressed protein -
19 Sobic.006G005900 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
20 Sobic.010G050100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G274000 Sobic006G274000 Sobic003G375300 Sobic003G375300 Sobic006G274000--Sobic003G375300 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G274000--Sobic008G154900 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic006G274000--Sobic006G005800 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic006G274000--Sobic009G153900 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic006G274000--Sobic003G382400 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic006G274000--Sobic004G346500 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic006G274000--Sobic006G160800 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic006G274000--Sobic002G353100 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic006G274000--Sobic003G090650 Sobic003G375300--Sobic006G274000 Sobic010G038400 Sobic010G038400 Sobic003G375300--Sobic010G038400 Sobic007G043300 Sobic007G043300 Sobic003G375300--Sobic007G043300 Sobic010G050100 Sobic010G050100 Sobic003G375300--Sobic010G050100 Sobic003G375300--Sobic006G160800 Sobic003G375300--Sobic003G382400 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic003G375300--Sobic001G266100 Sobic003G375300--Sobic009G153900 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic003G375300--Sobic008G012600 Sobic008G154900--Sobic006G005800 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic008G154900--Sobic003G011700 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic008G154900--Sobic002G179200 Sobic008G154900--Sobic006G274000 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic008G154900--Sobic004G234400 Sobic008G154900--Sobic001G266100 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic008G154900--Sobic008G013500 Sobic008G154900--Sobic002G353100 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic008G154900--Sobic001G472301 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic002G165500 Sobic002G165500 Sobic009G153900--Sobic002G165500 Sobic009G153900--Sobic001G266100 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic009G153900--Sobic001G491400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic009G153900--Sobic010G049600 Sobic007G029900 Sobic007G029900 Sobic009G153900--Sobic007G029900 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic009G153900--Sobic001G366000 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic009G153900--Sobic005G054800 Sobic004G041700 Sobic004G041700 Sobic009G153900--Sobic004G041700 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic009G153900--Sobic001G152400 Sobic003G382400--Sobic001G266100 Sobic003G382400--Sobic005G110900 Sobic003G382400--Sobic005G218000 Sobic004G118100 Sobic004G118100 Sobic003G382400--Sobic004G118100 Sobic003G382400--Sobic010G049600 Sobic003G382400--Sobic001G491400 Sobic008G013400 Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G012600 Sobic003G382400--Sobic006G160800 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic004G346500--Sobic005G006500 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic004G346500--Sobic006G117900 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G005800 Sobic004G346500--Sobic009G153900 Sobic004G346500--Sobic001G152400 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic004G346500--Sobic005G164000 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic004G346500--Sobic002G248300 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G346500--Sobic007G115400 Sobic006G160800--Sobic008G012600 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic006G160800--Sobic010G215700 Sobic006G160800--Sobic010G049600 Sobic006G160800--Sobic001G266100 Sobic006G160800--Sobic001G491400 Sobic006G160800--Sobic010G050100 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic006G160800--Sobic006G151800 Sobic006G160800--Sobic007G029900 Sobic006G160800--Sobic001G152400 Sobic002G353100--Sobic003G090650 Sobic002G353100--Sobic006G005800 Sobic002G353100--Sobic005G110900 Sobic002G353100--Sobic001G266100 Sobic002G353100--Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic002G248300 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic005G006500 Sobic002G353100--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic002G353100 Sobic003G090650--Sobic006G005800 Sobic003G090650--Sobic002G248300 Sobic003G090650--Sobic005G110900 Sobic003G090650--Sobic006G042500 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic005G006500 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic003G090650--Sobic002G183800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.