Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G160300.3,Sobic.005G160300.1,Sobic.005G160300.2
Synonym GSTT3, GST10C, ATGSTT3, Sb05g022220
Functional annotation DNA binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RJF2 , A0A1B6PSU6 , C5Y4W0
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF248
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41220 : glutathione S-transferase THETA 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g13960.2 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015784
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G307200 - -
2 Sobic.006G123650 - -
3 Sobic.004G312000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
4 Sobic.006G124100 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G010100 expressed protein -
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10 Sobic.007G192900 OsMADS37 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
11 Sobic.005G100500 RNA polymerase subunit, putative, expressed K03020: RPC19, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2
12 Sobic.003G409500 - -
13 Sobic.004G083250 - -
14 Sobic.007G148266 - -
15 Sobic.009G239101 - -
16 Sobic.001G221601 - -
17 Sobic.004G312400 Peptidase family C50, putative, expressed K02365: separase
18 Sobic.002G317900 expressed protein -
19 Sobic.009G186001 - -
20 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin


Gene co-expression network
sample Sobic005G160300 Sobic005G160300 Sobic004G307200 Sobic004G307200 Sobic005G160300--Sobic004G307200 Sobic006G123650 Sobic006G123650 Sobic005G160300--Sobic006G123650 Sobic004G312000 Sobic004G312000 Sobic005G160300--Sobic004G312000 Sobic006G124100 Sobic006G124100 Sobic005G160300--Sobic006G124100 Sobic007G010100 Sobic007G010100 Sobic005G160300--Sobic007G010100 Sobic007G052201 Sobic007G052201 Sobic005G160300--Sobic007G052201 Sobic008G147000 Sobic008G147000 Sobic005G160300--Sobic008G147000 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic005G160300--Sobic003G047400 Sobic005G149300 Sobic005G149300 Sobic005G160300--Sobic005G149300 Sobic004G307200--Sobic005G160300 Sobic004G083250 Sobic004G083250 Sobic004G307200--Sobic004G083250 Sobic002G317900 Sobic002G317900 Sobic004G307200--Sobic002G317900 Sobic001G222100 Sobic001G222100 Sobic004G307200--Sobic001G222100 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic004G307200--Sobic001G062066 Sobic008G106100 Sobic008G106100 Sobic004G307200--Sobic008G106100 Sobic001G185200 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Octagon: transcription factors


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