Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G165850.1,Sobic.005G165850.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIZ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G082400 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
2 Sobic.007G076600 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
3 Sobic.006G076100 - -
4 Sobic.001G366600 OsFBX51 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G098650 - -
6 Sobic.010G111450 - -
7 Sobic.002G040201 - -
8 Sobic.001G463600 - -
9 Sobic.002G394466 - -
10 Sobic.001G366300 telomerase reverse transcriptase, putative, expressed K11126: TERT, telomerase reverse transcriptase
11 Sobic.003G061500 small hydrophilic plant seed protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G013950 - -
13 Sobic.007G191300 serine/threonine-protein kinase NAK, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
14 Sobic.008G046100 - -
15 Sobic.001G510100 - -
16 Sobic.003G243900 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
17 Sobic.002G327600 ethylene receptor, putative, expressed K14509: ETR, ethylene receptor
18 Sobic.001G532501 - -
19 Sobic.004G349550 - K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
20 Sobic.002G119200 MBTB11 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic005G165850 Sobic005G165850 Sobic010G082400 Sobic010G082400 Sobic005G165850--Sobic010G082400 Sobic007G076600 Sobic007G076600 Sobic005G165850--Sobic007G076600 Sobic006G076100 Sobic006G076100 Sobic005G165850--Sobic006G076100 Sobic001G366600 Sobic001G366600 Sobic005G165850--Sobic001G366600 Sobic003G098650 Sobic003G098650 Sobic005G165850--Sobic003G098650 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic005G165850--Sobic010G111450 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic005G165850--Sobic002G040201 Sobic001G463600 Sobic001G463600 Sobic005G165850--Sobic001G463600 Sobic002G394466 Sobic002G394466 Sobic005G165850--Sobic002G394466 Sobic010G082400--Sobic005G165850 Sobic010G082400--Sobic003G098650 Sobic007G191300 Sobic007G191300 Sobic010G082400--Sobic007G191300 Sobic010G082400--Sobic001G366600 Sobic008G046100 Sobic008G046100 Sobic010G082400--Sobic008G046100 Sobic010G082400--Sobic007G076600 Sobic008G014900 Sobic008G014900 Sobic010G082400--Sobic008G014900 Sobic010G180350 Sobic010G180350 Sobic010G082400--Sobic010G180350 Sobic001G532501 Sobic001G532501 Sobic010G082400--Sobic001G532501 Sobic007G076600--Sobic005G165850 Sobic007G076600--Sobic010G082400 Sobic007G076600--Sobic001G366600 Sobic007G076600--Sobic003G098650 Sobic007G076600--Sobic008G046100 Sobic007G076600--Sobic007G191300 Sobic007G076600--Sobic006G076100 Sobic007G076600--Sobic010G111450 Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic007G076600--Sobic001G499800 Sobic006G076100--Sobic010G111450 Sobic006G076100--Sobic002G040201 Sobic003G013950 Sobic003G013950 Sobic006G076100--Sobic003G013950 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic006G076100--Sobic002G251050 Sobic006G076100--Sobic001G463600 Sobic006G076100--Sobic002G394466 Sobic004G138600 Sobic004G138600 Sobic006G076100--Sobic004G138600 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic006G076100--Sobic003G407950 Sobic009G187150 Sobic009G187150 Sobic006G076100--Sobic009G187150 Sobic001G366600--Sobic001G499800 Sobic001G366600--Sobic005G165850 Sobic001G366600--Sobic010G082400 Sobic001G366600--Sobic006G076100 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic001G366600--Sobic001G366300 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic001G366600--Sobic002G055800 Sobic001G366600--Sobic007G076600 Sobic001G320000 Sobic001G320000 Sobic001G366600--Sobic001G320000 Sobic001G366600--Sobic010G111450 Sobic008G175966 Sobic008G175966 Sobic003G098650--Sobic008G175966 Sobic003G098650--Sobic010G180350 Sobic006G221900 Sobic006G221900 Sobic003G098650--Sobic006G221900 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic003G098650--Sobic006G029250 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic003G098650--Sobic005G035850 Sobic003G098650--Sobic010G082400 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic003G098650--Sobic003G003900 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic003G098650--Sobic002G113066 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic003G098650--Sobic009G034250 Sobic010G111450--Sobic002G040201 Sobic010G111450--Sobic003G013950 Sobic010G111450--Sobic006G076100 Sobic010G111450--Sobic002G394466 Sobic010G111450--Sobic001G463600 Sobic010G111450--Sobic002G251050 Sobic010G111450--Sobic001G366300 Sobic010G111450--Sobic004G138600 Sobic003G243900 Sobic003G243900 Sobic010G111450--Sobic003G243900 Sobic002G040201--Sobic003G013950 Sobic002G040201--Sobic010G111450 Sobic002G040201--Sobic001G463600 Sobic002G040201--Sobic002G394466 Sobic002G040201--Sobic003G243900 Sobic002G040201--Sobic001G366300 Sobic002G040201--Sobic006G076100 Sobic009G230000 Sobic009G230000 Sobic002G040201--Sobic009G230000 Sobic002G040201--Sobic004G138600 Sobic001G463600--Sobic002G394466 Sobic001G463600--Sobic002G040201 Sobic001G463600--Sobic003G243900 Sobic001G463600--Sobic001G366300 Sobic001G463600--Sobic010G111450 Sobic003G372600 Sobic003G372600 Sobic001G463600--Sobic003G372600 Sobic001G208500 Sobic001G208500 Sobic001G463600--Sobic001G208500 Sobic004G349550 Sobic004G349550 Sobic001G463600--Sobic004G349550 Sobic002G211300 Sobic002G211300 Sobic001G463600--Sobic002G211300 Sobic002G394466--Sobic001G463600 Sobic002G394466--Sobic002G040201 Sobic002G394466--Sobic004G349550 Sobic002G394466--Sobic001G366300 Sobic008G149300 Sobic008G149300 Sobic002G394466--Sobic008G149300 Sobic001G122600 Sobic001G122600 Sobic002G394466--Sobic001G122600
Octagon: transcription factors


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