Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G076600.1
Synonym Sb07g006150, SDE1, RDR6, SGS2
Functional annotation RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed
UniProt C5YIV2
Pfam PF05183
Panther DB PTHR23079 PTHR23079:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11699; RDR, RNA-dependent RNA polymerase
Gene Ontology GO:0003968; RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49500 : RNA-dependent RNA polymerase 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g34350.1 : RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051648 , Zm00025a024823
Brachypodium KQK20560 , KQK20561 , KQK20562 , KQK20563 , KQK20559 , PNT76887 , PNT76889
Barley HORVU3Hr1G107690.2 , HORVU3Hr1G107690.3
Wheat TraesCS3D02G489400 , TraesCS3B02G543300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G165850 - -
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4 Sobic.003G098650 - -
5 Sobic.008G046100 - -
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7 Sobic.006G076100 - -
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13 Sobic.002G040201 - -
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20 Sobic.003G013950 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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