Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G069766.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCR2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207700 - -
2 Sobic.009G110800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G166000 expressed protein -
4 Sobic.001G041600 clathrin adaptor complex small chain domain containing protein, expressed K12394: AP-1 complex subunit sigma 1/2
5 Sobic.005G214800 - -
6 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.002G414000 - -
8 Sobic.006G043101 - -
9 Sobic.001G269200 "GDSL-like lipase/acylhydrolase, is the most likely gene associated with epicuticular wax deposition."(PubMedID : 28702690)@GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.010G107800 - -
11 Sobic.005G220500 pollen allergen, putative, expressed -
12 Sobic.003G445300 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
13 Sobic.007G160501 - -
14 Sobic.005G220400 pollen allergen, putative, expressed -
15 Sobic.007G129800 expressed protein -
16 Sobic.002G082400 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G167000 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
18 Sobic.008G125801 - -
19 Sobic.002G414300 - -
20 Sobic.003G175600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G069766 Sobic006G069766 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic006G069766--Sobic005G207700 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic006G069766--Sobic009G110800 Sobic002G166000 Sobic002G166000 Sobic006G069766--Sobic002G166000 Sobic001G041600 Sobic001G041600 Sobic006G069766--Sobic001G041600 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic006G069766--Sobic005G214800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic006G069766--Sobic001G246001 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic006G069766--Sobic002G414000 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic006G069766--Sobic006G043101 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic006G069766--Sobic001G269200 Sobic005G207700--Sobic009G110800 Sobic005G207700--Sobic006G043101 Sobic005G207700--Sobic002G414000 Sobic005G207700--Sobic005G214800 Sobic005G207700--Sobic001G246001 Sobic005G207700--Sobic001G269200 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic005G207700--Sobic005G220500 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic005G207700--Sobic010G107800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G207700--Sobic003G445300 Sobic009G110800--Sobic001G246001 Sobic009G110800--Sobic005G214800 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic009G110800--Sobic007G160501 Sobic009G110800--Sobic002G414000 Sobic009G110800--Sobic006G043101 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G445300 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic009G110800--Sobic005G220400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic009G110800--Sobic008G125801 Sobic002G166000--Sobic005G207700 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic002G166000--Sobic005G114201 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic002G166000--Sobic007G129800 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G166000--Sobic007G095333 Sobic002G166000--Sobic010G107800 Sobic002G166000--Sobic005G220400 Sobic002G166000--Sobic009G110800 Sobic002G166000--Sobic001G269200 Sobic002G166000--Sobic002G414000 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic001G041600--Sobic002G082400 Sobic001G041600--Sobic005G220500 Sobic001G041600--Sobic003G445300 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic001G041600--Sobic003G175600 Sobic001G041600--Sobic005G220400 Sobic001G041600--Sobic001G269200 Sobic009G203900 Sobic009G203900 Sobic001G041600--Sobic009G203900 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic001G041600--Sobic004G293300 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic001G041600--Sobic002G053800 Sobic005G214800--Sobic001G246001 Sobic005G214800--Sobic002G414000 Sobic005G214800--Sobic007G160501 Sobic005G214800--Sobic006G043101 Sobic005G214800--Sobic009G110800 Sobic005G214800--Sobic003G445300 Sobic005G214800--Sobic005G220400 Sobic005G214800--Sobic005G220500 Sobic005G214800--Sobic001G269200 Sobic001G246001--Sobic001G246001 Sobic001G246001--Sobic002G414000 Sobic001G246001--Sobic007G160501 Sobic001G246001--Sobic006G043101 Sobic001G246001--Sobic009G110800 Sobic001G246001--Sobic003G445300 Sobic001G246001--Sobic005G220400 Sobic001G246001--Sobic005G220500 Sobic001G246001--Sobic001G269200 Sobic002G414000--Sobic006G043101 Sobic002G414000--Sobic005G214800 Sobic002G414000--Sobic001G246001 Sobic002G414000--Sobic005G220400 Sobic002G414000--Sobic001G269200 Sobic002G414000--Sobic003G445300 Sobic002G414000--Sobic005G220500 Sobic002G414000--Sobic010G107800 Sobic002G414000--Sobic002G082400 Sobic006G043101--Sobic002G414000 Sobic006G043101--Sobic005G214800 Sobic006G043101--Sobic001G246001 Sobic006G043101--Sobic001G269200 Sobic006G043101--Sobic005G220400 Sobic006G043101--Sobic003G445300 Sobic006G043101--Sobic005G220500 Sobic006G043101--Sobic010G107800 Sobic006G043101--Sobic002G082400 Sobic001G269200--Sobic005G220500 Sobic001G269200--Sobic010G107800 Sobic001G269200--Sobic007G129800 Sobic001G269200--Sobic002G414000 Sobic001G269200--Sobic002G082400 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic001G269200--Sobic007G167000 Sobic001G269200--Sobic003G445300 Sobic001G269200--Sobic006G043101 Sobic001G269200--Sobic005G220400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.