Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G080700.2,Sobic.006G080700.1
Synonym ATCSLB04, ATCSLB4, CSLB04, Sb06g016760
Functional annotation CSLH1 - cellulose synthase-like family H, expressed
UniProt A0A1Z5RCV8 , A0A1Z5RDB9
Pfam PF03552
Panther DB PTHR13301 PTHR13301:SF53
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016760; cellulose synthase (UDP-forming) activity GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G32540 : cellulose synthase-like B4
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g20090.1 : CSLH1 - cellulose synthase-like family H, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011400
Brachypodium KQJ82632
Barley HORVU2Hr1G074960.12 , HORVU2Hr1G074960.13 , HORVU2Hr1G074960.10 , HORVU2Hr1G074960.14 , HORVU2Hr1G074960.8 , HORVU2Hr1G074960.9 , HORVU2Hr1G074960.1 , HORVU2Hr1G074960.2 , HORVU2Hr1G074960.3 , HORVU2Hr1G074960.4 , HORVU2Hr1G074960.5 , HORVU2Hr1G074960.6 , HORVU2Hr1G074960.7
Wheat TraesCS2D02G301000 , TraesCS2B02G318100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G007300 expressed protein -
2 Sobic.004G064200 STE_PAK_Ste20_STLK.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
3 Sobic.001G225800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT motif family protein, expressed -
4 Sobic.008G078200 EDM2, putative, expressed -
5 Sobic.010G114200 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
6 Sobic.005G110460 - -
7 Sobic.009G068400 SSRP1-like FACT complex subunit, putative, expressed K09272: structure-specific recognition protein 1
8 Sobic.009G152000 Yip1 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G179600 - -
10 Sobic.001G117100 - -
11 Sobic.007G198900 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.002G060000 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G133800 - -
14 Sobic.008G036100 expressed protein -
15 Sobic.001G367301 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
16 Sobic.004G290600 beige/BEACH domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G138400 expressed protein -
20 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G080700 Sobic006G080700 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic006G080700--Sobic009G007300 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic006G080700--Sobic004G064200 Sobic001G225800 Sobic001G225800 Sobic006G080700--Sobic001G225800 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic006G080700--Sobic008G078200 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic006G080700--Sobic010G114200 Sobic005G110460 Sobic005G110460 Sobic006G080700--Sobic005G110460 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic006G080700--Sobic009G068400 Sobic009G152000 Sobic009G152000 Sobic006G080700--Sobic009G152000 Sobic010G179600 Sobic010G179600 Sobic006G080700--Sobic010G179600 Sobic009G007300--Sobic006G080700 Sobic009G007300--Sobic001G225800 Sobic009G007300--Sobic008G078200 Sobic009G007300--Sobic004G064200 Sobic009G007300--Sobic009G068400 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic009G007300--Sobic007G198900 Sobic009G007300--Sobic010G179600 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic009G007300--Sobic002G060000 Sobic009G007300--Sobic010G114200 Sobic004G064200--Sobic010G114200 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic004G064200--Sobic003G014200 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic004G064200--Sobic006G143900 Sobic004G064200--Sobic010G179600 Sobic004G064200--Sobic009G068400 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G064200--Sobic001G117100 Sobic004G064200--Sobic001G225800 Sobic004G064200--Sobic009G152000 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic004G064200--Sobic008G036100 Sobic001G225800--Sobic005G110460 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic001G225800--Sobic010G276100 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic001G225800--Sobic004G002800 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic001G225800--Sobic003G335200 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic001G225800--Sobic001G252900 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic001G225800--Sobic005G025600 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic001G225800--Sobic009G075400 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic001G225800--Sobic005G023700 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic001G225800--Sobic010G006900 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic008G078200--Sobic005G058300 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic008G078200--Sobic007G167950 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic008G078200--Sobic005G087732 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic008G078200--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G078200--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G078200--Sobic004G046700 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G078200--Sobic007G110800 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G078200--Sobic004G086900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic008G078200--Sobic006G224400 Sobic005G055700 Sobic005G055700 Sobic010G114200--Sobic005G055700 Sobic010G114200--Sobic003G014200 Sobic006G150300 Sobic006G150300 Sobic010G114200--Sobic006G150300 Sobic001G241401 Sobic001G241401 Sobic010G114200--Sobic001G241401 Sobic010G114200--Sobic001G225800 Sobic010G114200--Sobic002G060000 Sobic007G133800 Sobic007G133800 Sobic010G114200--Sobic007G133800 Sobic002G126400 Sobic002G126400 Sobic010G114200--Sobic002G126400 Sobic010G114200--Sobic006G143900 Sobic007G223400 Sobic007G223400 Sobic005G110460--Sobic007G223400 Sobic001G488950 Sobic001G488950 Sobic005G110460--Sobic001G488950 Sobic005G110460--Sobic009G152000 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic005G110460--Sobic005G009500 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic005G110460--Sobic009G169500 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic005G110460--Sobic001G306200 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic005G110460--Sobic002G414150 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic005G110460--Sobic005G006300 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic005G110460--Sobic006G142200 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic009G068400--Sobic003G070400 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic009G068400--Sobic007G197000 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic009G068400--Sobic005G037700 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic009G068400--Sobic007G204200 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic009G068400--Sobic003G004000 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic009G068400--Sobic004G192600 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic009G068400--Sobic001G089400 Sobic008G074100 Sobic008G074100 Sobic009G068400--Sobic008G074100 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic009G068400--Sobic010G121700 Sobic009G152000--Sobic001G488950 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic009G152000--Sobic006G043101 Sobic005G054401 Sobic005G054401 Sobic009G152000--Sobic005G054401 Sobic009G152000--Sobic007G223400 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic009G152000--Sobic010G107800 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic009G152000--Sobic001G269200 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic009G152000--Sobic007G129800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic009G152000--Sobic002G414000 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic009G152000--Sobic005G220500 Sobic010G179600--Sobic001G117100 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic010G179600--Sobic005G040100 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic010G179600--Sobic007G134501 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic010G179600--Sobic005G148000 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic010G179600--Sobic002G194201 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic010G179600--Sobic003G007650 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic010G179600--Sobic007G122600 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic010G179600--Sobic001G143700 Sobic010G179600--Sobic008G036100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.