Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G007300.2
Synonym Sb09g000850
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P5Q6
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G080700 CSLH1 - cellulose synthase-like family H, expressed -
2 Sobic.001G225800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT motif family protein, expressed -
3 Sobic.008G078200 EDM2, putative, expressed -
4 Sobic.004G064200 STE_PAK_Ste20_STLK.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
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7 Sobic.010G179600 - -
8 Sobic.002G060000 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G114200 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
10 Sobic.001G117100 - -
11 Sobic.007G133800 - -
12 Sobic.005G202901 - -
13 Sobic.009G152000 Yip1 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G016500 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G290600 beige/BEACH domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G189100 transcription factor Dp, putative, expressed -
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19 Sobic.010G121700 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G138400 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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