Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G016500.1,Sobic.002G016500.2
Synonym Sb02g001616
Functional annotation OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W1X5
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF74
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03360 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g18510.1 : OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1A02G085700 , TraesCS1B02G102800 , TraesCS7D02G505800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
2 Sobic.001G053500 expressed protein -
3 Sobic.009G060000 WD40-like domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G308800 expressed protein -
5 Sobic.009G158300 - -
6 Sobic.010G179600 - -
7 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G103650 - -
9 Sobic.001G117100 - -
10 Sobic.006G070032 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
11 Sobic.002G406801 - -
12 Sobic.006G018701 - -
13 Sobic.007G133800 - -
14 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
16 Sobic.005G198800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G036100 expressed protein -
18 Sobic.008G138400 expressed protein -
19 Sobic.005G148000 - -
20 Sobic.007G122600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G016500 Sobic002G016500 Sobic004G095100 Sobic004G095100 Sobic002G016500--Sobic004G095100 Sobic001G053500 Sobic001G053500 Sobic002G016500--Sobic001G053500 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic002G016500--Sobic009G060000 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic002G016500--Sobic004G308800 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic002G016500--Sobic009G158300 Sobic010G179600 Sobic010G179600 Sobic002G016500--Sobic010G179600 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic002G016500--Sobic003G245300 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic002G016500--Sobic009G103650 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic002G016500--Sobic001G117100 Sobic004G095100--Sobic001G053500 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic004G095100--Sobic010G121700 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic004G095100--Sobic009G110700 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic004G095100--Sobic009G234900 Sobic004G095100--Sobic009G060000 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic004G095100--Sobic001G167300 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic004G095100--Sobic008G024200 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic004G095100--Sobic003G004000 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic004G095100--Sobic005G189100 Sobic001G053500--Sobic009G110700 Sobic001G053500--Sobic003G245300 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic001G053500--Sobic001G192300 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic001G053500--Sobic007G122600 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic001G053500--Sobic005G006100 Sobic001G053500--Sobic009G060000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic001G053500--Sobic010G216100 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G053500--Sobic002G049700 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic001G053500--Sobic010G207800 Sobic009G060000--Sobic009G158300 Sobic009G060000--Sobic002G049700 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G060000--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic009G060000--Sobic007G001800 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic009G060000--Sobic003G445600 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic009G060000--Sobic003G160600 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic009G060000--Sobic006G164800 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic009G060000--Sobic007G145500 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic009G060000--Sobic009G016900 Sobic004G308800--Sobic009G110700 Sobic004G308800--Sobic003G245300 Sobic004G308800--Sobic007G145500 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G308800--Sobic002G194300 Sobic004G308800--Sobic010G216100 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G308800--Sobic003G351100 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic004G308800--Sobic007G095333 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic004G308800--Sobic010G215000 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic004G308800--Sobic007G160501 Sobic009G158300--Sobic009G060000 Sobic009G158300--Sobic002G049700 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic003G160600 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic009G158300--Sobic001G392650 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic003G445600 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic009G158300--Sobic008G134600 Sobic009G158300--Sobic001G409000 Sobic010G179600--Sobic001G117100 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic010G179600--Sobic005G040100 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic010G179600--Sobic007G134501 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic010G179600--Sobic005G148000 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic010G179600--Sobic002G194201 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic010G179600--Sobic003G007650 Sobic010G179600--Sobic007G122600 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic010G179600--Sobic001G143700 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic010G179600--Sobic008G036100 Sobic003G245300--Sobic007G122600 Sobic003G245300--Sobic002G194201 Sobic003G245300--Sobic007G134501 Sobic003G245300--Sobic005G040100 Sobic003G245300--Sobic003G007650 Sobic003G245300--Sobic005G006100 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic003G245300--Sobic007G035200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic003G245300--Sobic005G006400 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic003G245300--Sobic008G086500 Sobic009G103650--Sobic009G060000 Sobic009G103650--Sobic001G053500 Sobic009G103650--Sobic004G308800 Sobic009G103650--Sobic002G049700 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic009G103650--Sobic009G244100 Sobic009G103650--Sobic001G409000 Sobic009G103650--Sobic001G392650 Sobic009G103650--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic009G103650--Sobic002G406801 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic001G117100--Sobic002G097300 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic001G117100--Sobic008G138400 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic001G117100--Sobic005G140900 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic001G117100--Sobic002G006200 Sobic001G117100--Sobic001G143700 Sobic001G117100--Sobic005G148000 Sobic001G117100--Sobic005G189100 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic001G117100--Sobic002G156400 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic001G117100--Sobic001G089300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.