Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G088740.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RD18
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF75
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G56440 : F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35990.1 : OsFBX136 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G118000 Glutaredoxin family protein (At)(PubMedID : 27208977)@OsGrx_C11 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
2 Sobic.006G214400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
3 Sobic.007G112900 - -
4 Sobic.007G076700 coproporphyrinogen III oxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K00228: CPOX, coproporphyrinogen III oxidase
5 Sobic.008G000900 - -
6 Sobic.003G159450 - -
7 Sobic.008G125600 - -
8 Sobic.002G212800 - -
9 Sobic.009G103500 - -
10 Sobic.001G031300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
12 Sobic.005G077933 - -
13 Sobic.008G101500 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
14 Sobic.005G046500 protein kinase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G136900 - -
16 Sobic.006G046000 - -
17 Sobic.004G083700 expressed protein -
18 Sobic.010G143200 - -
19 Sobic.005G084400 la domain containing protein, expressed K15191: La-related protein 7
20 Sobic.006G263000 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G088740 Sobic006G088740 Sobic008G118000 Sobic008G118000 Sobic006G088740--Sobic008G118000 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic006G088740--Sobic006G214400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic006G088740--Sobic007G112900 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic006G088740--Sobic007G076700 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic006G088740--Sobic008G000900 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic006G088740--Sobic003G159450 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic006G088740--Sobic008G125600 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic006G088740--Sobic002G212800 Sobic009G103500 Sobic009G103500 Sobic006G088740--Sobic009G103500 Sobic008G118000--Sobic006G214400 Sobic008G101500 Sobic008G101500 Sobic008G118000--Sobic008G101500 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic008G118000--Sobic003G178700 Sobic001G491200 Sobic001G491200 Sobic008G118000--Sobic001G491200 Sobic001G217700 Sobic001G217700 Sobic008G118000--Sobic001G217700 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic008G118000--Sobic002G114700 Sobic008G118000--Sobic007G076700 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic008G118000--Sobic009G085400 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic008G118000--Sobic004G315800 Sobic006G214400--Sobic002G114700 Sobic006G214400--Sobic009G085400 Sobic006G214400--Sobic008G118000 Sobic001G076200 Sobic001G076200 Sobic006G214400--Sobic001G076200 Sobic004G147200 Sobic004G147200 Sobic006G214400--Sobic004G147200 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic006G214400--Sobic005G046500 Sobic006G214400--Sobic007G076700 Sobic003G174800 Sobic003G174800 Sobic006G214400--Sobic003G174800 Sobic006G214400--Sobic008G000900 Sobic007G112900--Sobic002G212800 Sobic007G112900--Sobic003G159450 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic007G112900--Sobic010G143200 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic007G112900--Sobic004G291800 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic007G112900--Sobic006G046000 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic007G112900--Sobic001G394400 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic007G112900--Sobic008G091671 Sobic007G112900--Sobic008G125600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G112900--Sobic009G104300 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic007G076700--Sobic004G035000 Sobic001G031300 Sobic001G031300 Sobic007G076700--Sobic001G031300 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic007G076700--Sobic002G209600 Sobic003G040000 Sobic003G040000 Sobic007G076700--Sobic003G040000 Sobic009G127400 Sobic009G127400 Sobic007G076700--Sobic009G127400 Sobic004G142700 Sobic004G142700 Sobic007G076700--Sobic004G142700 Sobic003G112700 Sobic003G112700 Sobic007G076700--Sobic003G112700 Sobic007G076700--Sobic002G114700 Sobic001G354501 Sobic001G354501 Sobic007G076700--Sobic001G354501 Sobic008G000900--Sobic003G174800 Sobic008G000900--Sobic008G125600 Sobic008G000900--Sobic010G143200 Sobic004G062800 Sobic004G062800 Sobic008G000900--Sobic004G062800 Sobic008G125501 Sobic008G125501 Sobic008G000900--Sobic008G125501 Sobic008G000900--Sobic006G214400 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic008G000900--Sobic001G087100 Sobic008G000900--Sobic003G159450 Sobic008G000900--Sobic008G091671 Sobic003G159450--Sobic007G112900 Sobic003G159450--Sobic010G143200 Sobic003G159450--Sobic002G212800 Sobic003G159450--Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G091671 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic004G291800 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic003G159450--Sobic002G095900 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic003G159450--Sobic005G007700 Sobic008G125600--Sobic008G125501 Sobic008G125600--Sobic008G000900 Sobic008G125600--Sobic003G159450 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic008G125600--Sobic001G111900 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic008G125600--Sobic003G088700 Sobic008G125600--Sobic007G112900 Sobic008G125600--Sobic004G062800 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic008G125600--Sobic010G056000 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic008G125600--Sobic001G454401 Sobic002G212800--Sobic007G112900 Sobic002G212800--Sobic004G291800 Sobic002G212800--Sobic006G046000 Sobic002G212800--Sobic003G159450 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic002G212800--Sobic006G048775 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic002G212800--Sobic009G197200 Sobic002G212800--Sobic008G091671 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic002G212800--Sobic009G110366 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic002G212800--Sobic004G020401 Sobic001G429300 Sobic001G429300 Sobic009G103500--Sobic001G429300 Sobic005G077933 Sobic005G077933 Sobic009G103500--Sobic005G077933 Sobic003G309900 Sobic003G309900 Sobic009G103500--Sobic003G309900 Sobic001G284800 Sobic001G284800 Sobic009G103500--Sobic001G284800 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic009G103500--Sobic008G189400 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic009G103500--Sobic004G083700 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic009G103500--Sobic010G280100 Sobic006G273200 Sobic006G273200 Sobic009G103500--Sobic006G273200 Sobic002G136900 Sobic002G136900 Sobic009G103500--Sobic002G136900
Octagon: transcription factors


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