Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G104200.1
Synonym Sb06g018730
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y9S2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g36530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G104200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G111400 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G126800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
3 Sobic.007G089400 - -
4 Sobic.003G255800 expressed protein -
5 Sobic.004G238400 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G312300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@homocysteine S-methyltransferase protein, putative, expressed K00547: mmuM, homocysteine S-methyltransferase
7 Sobic.001G352666 - -
8 Sobic.009G152800 transporter family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G329600 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
10 Sobic.010G191750 - -
11 Sobic.001G518050 - -
12 Sobic.001G319000 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.003G256000 Candidate orthologue to the genomic region of wheat Hessian fy resistance gene H32(PubMedID : 28624908)@expressed protein -
14 Sobic.010G278900 expressed protein -
15 Sobic.005G103100 AP2 domain containing protein, expressed K14516: ethylene-responsive transcription factor 1
16 Sobic.002G027401 - -
17 Sobic.008G061300 - -
18 Sobic.003G409150 - -
19 Sobic.005G118000 - -
20 Sobic.006G030500 protein phosphatase 2C, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G104200 Sobic006G104200 Sobic004G111400 Sobic004G111400 Sobic006G104200--Sobic004G111400 Sobic008G126800 Sobic008G126800 Sobic006G104200--Sobic008G126800 Sobic007G089400 Sobic007G089400 Sobic006G104200--Sobic007G089400 Sobic003G255800 Sobic003G255800 Sobic006G104200--Sobic003G255800 Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic006G104200--Sobic004G238400 Sobic003G312300 Sobic003G312300 Sobic006G104200--Sobic003G312300 Sobic001G352666 Sobic001G352666 Sobic006G104200--Sobic001G352666 Sobic009G152800 Sobic009G152800 Sobic006G104200--Sobic009G152800 Sobic004G329600 Sobic004G329600 Sobic006G104200--Sobic004G329600 Sobic004G111400--Sobic007G089400 Sobic004G111400--Sobic003G255800 Sobic004G111400--Sobic008G126800 Sobic001G319000 Sobic001G319000 Sobic004G111400--Sobic001G319000 Sobic010G278900 Sobic010G278900 Sobic004G111400--Sobic010G278900 Sobic008G081500 Sobic008G081500 Sobic004G111400--Sobic008G081500 Sobic005G097500 Sobic005G097500 Sobic004G111400--Sobic005G097500 Sobic006G113950 Sobic006G113950 Sobic004G111400--Sobic006G113950 Sobic004G129201 Sobic004G129201 Sobic004G111400--Sobic004G129201 Sobic008G126800--Sobic001G319000 Sobic008G126800--Sobic007G089400 Sobic008G126800--Sobic005G097500 Sobic008G126800--Sobic004G111400 Sobic003G403600 Sobic003G403600 Sobic008G126800--Sobic003G403600 Sobic008G126800--Sobic003G255800 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic008G126800--Sobic005G065050 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic008G126800--Sobic010G193100 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic008G126800--Sobic001G505066 Sobic003G069300 Sobic003G069300 Sobic007G089400--Sobic003G069300 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic007G089400--Sobic004G230000 Sobic003G255800--Sobic001G319000 Sobic003G255800--Sobic004G111400 Sobic003G255800--Sobic005G097500 Sobic010G046900 Sobic010G046900 Sobic003G255800--Sobic010G046900 Sobic003G255800--Sobic003G403600 Sobic003G255800--Sobic008G126800 Sobic003G255800--Sobic010G278900 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic003G255800--Sobic001G321700 Sobic003G255800--Sobic010G193100 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic004G238400--Sobic010G081950 Sobic003G409150 Sobic003G409150 Sobic004G238400--Sobic003G409150 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic004G238400--Sobic004G104250 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic004G238400--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic004G238400--Sobic006G210233 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic004G238400--Sobic009G124100 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic004G238400--Sobic006G089350 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic004G238400--Sobic005G165950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic004G238400--Sobic002G310400 Sobic003G367650 Sobic003G367650 Sobic003G312300--Sobic003G367650 Sobic001G518050 Sobic001G518050 Sobic003G312300--Sobic001G518050 Sobic009G168800 Sobic009G168800 Sobic003G312300--Sobic009G168800 Sobic004G047900 Sobic004G047900 Sobic003G312300--Sobic004G047900 Sobic003G312300--Sobic006G104200 Sobic010G092500 Sobic010G092500 Sobic003G312300--Sobic010G092500 Sobic006G050600 Sobic006G050600 Sobic003G312300--Sobic006G050600 Sobic001G237100 Sobic001G237100 Sobic003G312300--Sobic001G237100 Sobic003G435700 Sobic003G435700 Sobic003G312300--Sobic003G435700 Sobic007G179700 Sobic007G179700 Sobic001G352666--Sobic007G179700 Sobic004G322500 Sobic004G322500 Sobic001G352666--Sobic004G322500 Sobic004G155000 Sobic004G155000 Sobic001G352666--Sobic004G155000 Sobic002G191400 Sobic002G191400 Sobic001G352666--Sobic002G191400 Sobic004G019000 Sobic004G019000 Sobic001G352666--Sobic004G019000 Sobic007G208700 Sobic007G208700 Sobic001G352666--Sobic007G208700 Sobic006G155300 Sobic006G155300 Sobic001G352666--Sobic006G155300 Sobic001G469300 Sobic001G469300 Sobic001G352666--Sobic001G469300 Sobic007G218900 Sobic007G218900 Sobic001G352666--Sobic007G218900 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic009G152800--Sobic002G190600 Sobic009G152800--Sobic001G505066 Sobic009G152800--Sobic010G193100 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic009G152800--Sobic003G192500 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic009G152800--Sobic002G087700 Sobic009G152800--Sobic005G065050 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic009G152800--Sobic005G119250 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic009G152800--Sobic009G147450 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic009G152800--Sobic010G172633 Sobic001G164800 Sobic001G164800 Sobic004G329600--Sobic001G164800 Sobic005G054900 Sobic005G054900 Sobic004G329600--Sobic005G054900 Sobic010G256100 Sobic010G256100 Sobic004G329600--Sobic010G256100 Sobic004G000900 Sobic004G000900 Sobic004G329600--Sobic004G000900 Sobic004G349550 Sobic004G349550 Sobic004G329600--Sobic004G349550 Sobic010G110100 Sobic010G110100 Sobic004G329600--Sobic010G110100 Sobic003G061500 Sobic003G061500 Sobic004G329600--Sobic003G061500 Sobic005G184700 Sobic005G184700 Sobic004G329600--Sobic005G184700 Sobic005G184800 Sobic005G184800 Sobic004G329600--Sobic005G184800
Octagon: transcription factors


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