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Transcriptome id Sobic.005G118000.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI53
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G329600 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
2 Sobic.001G110950 - -
3 Sobic.001G164800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G174400 cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G238400 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G049900 - -
7 Sobic.002G350000 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
8 Sobic.003G434300 expressed protein -
9 Sobic.001G292500 - -
10 Sobic.002G204350 - -
11 Sobic.002G027401 - -
12 Sobic.003G329500 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
13 Sobic.009G119800 GASR5 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
14 Sobic.005G054900 acyl-CoA synthetase protein, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
15 Sobic.004G248700 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
16 Sobic.001G352666 - -
17 Sobic.001G298032 - -
18 Sobic.001G534200 - -
19 Sobic.010G110100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@"A transcription factor(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)"(PubMedID : 31659933)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
20 Sobic.008G018100 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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