Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G152100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PM54
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.006G152100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G541232 - -
2 Sobic.005G048300 - -
3 Sobic.001G019601 - -
4 Sobic.008G067700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G120066 - -
6 Sobic.005G084850 - -
7 Sobic.006G269300 - -
8 Sobic.002G322100 - -
9 Sobic.009G005750 - -
10 Sobic.007G084400 - -
11 Sobic.003G139100 - -
12 Sobic.007G114401 - -
13 Sobic.009G192933 - -
14 Sobic.002G085600 - -
15 Sobic.010G069000 - -
16 Sobic.003G068700 expressed protein -
17 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -
18 Sobic.001G410300 - -
19 Sobic.001G113400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@seed maturation protein PM41, putative, expressed -
20 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase


Gene co-expression network
sample Sobic006G152100 Sobic006G152100 Sobic001G541232 Sobic001G541232 Sobic006G152100--Sobic001G541232 Sobic005G048300 Sobic005G048300 Sobic006G152100--Sobic005G048300 Sobic001G019601 Sobic001G019601 Sobic006G152100--Sobic001G019601 Sobic008G067700 Sobic008G067700 Sobic006G152100--Sobic008G067700 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic006G152100--Sobic008G120066 Sobic005G084850 Sobic005G084850 Sobic006G152100--Sobic005G084850 Sobic006G269300 Sobic006G269300 Sobic006G152100--Sobic006G269300 Sobic002G322100 Sobic002G322100 Sobic006G152100--Sobic002G322100 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic006G152100--Sobic009G005750 Sobic001G541232--Sobic006G152100 Sobic001G541232--Sobic008G067700 Sobic001G541232--Sobic001G019601 Sobic001G541232--Sobic005G048300 Sobic001G541232--Sobic005G084850 Sobic001G332900 Sobic001G332900 Sobic001G541232--Sobic001G332900 Sobic001G541232--Sobic006G269300 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic001G541232--Sobic003G017300 Sobic002G085600 Sobic002G085600 Sobic001G541232--Sobic002G085600 Sobic005G048300--Sobic006G152100 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic005G048300--Sobic007G084400 Sobic005G048300--Sobic005G084850 Sobic005G048300--Sobic001G541232 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic005G048300--Sobic006G247400 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic005G048300--Sobic007G114401 Sobic005G048300--Sobic002G322100 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic005G048300--Sobic001G163000 Sobic008G024550 Sobic008G024550 Sobic005G048300--Sobic008G024550 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic001G019601--Sobic009G192933 Sobic001G019601--Sobic002G085600 Sobic001G019601--Sobic001G541232 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic001G019601--Sobic001G113400 Sobic001G019601--Sobic006G152100 Sobic001G019601--Sobic008G067700 Sobic009G080000 Sobic009G080000 Sobic001G019601--Sobic009G080000 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic001G019601--Sobic004G144300 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic001G019601--Sobic002G001500 Sobic008G067700--Sobic001G541232 Sobic008G067700--Sobic001G019601 Sobic008G067700--Sobic006G152100 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic008G067700--Sobic009G036366 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic008G067700--Sobic010G249600 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic008G067700--Sobic001G503700 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic008G067700--Sobic002G288500 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic008G067700--Sobic009G149600 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic008G067700--Sobic001G350300 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic008G120066--Sobic001G344450 Sobic009G039300 Sobic009G039300 Sobic008G120066--Sobic009G039300 Sobic001G300750 Sobic001G300750 Sobic008G120066--Sobic001G300750 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic008G120066--Sobic001G096800 Sobic008G120066--Sobic001G163000 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic008G120066--Sobic005G002500 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic008G120066--Sobic009G114900 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic008G120066--Sobic009G236000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic008G120066--Sobic002G038200 Sobic005G084850--Sobic005G048300 Sobic005G084850--Sobic006G152100 Sobic005G084850--Sobic001G541232 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic005G084850--Sobic001G410300 Sobic005G084850--Sobic007G084400 Sobic003G068700 Sobic003G068700 Sobic005G084850--Sobic003G068700 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic005G084850--Sobic009G215350 Sobic010G069000 Sobic010G069000 Sobic005G084850--Sobic010G069000 Sobic005G084850--Sobic001G019601 Sobic006G269300--Sobic003G017300 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic006G269300--Sobic001G456650 Sobic006G269300--Sobic009G114900 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic006G269300--Sobic002G252700 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic006G269300--Sobic009G106300 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic006G269300--Sobic001G033200 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic009G005750 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic006G269300--Sobic007G061500 Sobic002G322100--Sobic007G084400 Sobic002G322100--Sobic005G048300 Sobic002G322100--Sobic006G152100 Sobic002G322100--Sobic006G247400 Sobic002G322100--Sobic008G120066 Sobic002G322100--Sobic005G084850 Sobic005G161000 Sobic005G161000 Sobic002G322100--Sobic005G161000 Sobic002G322100--Sobic001G300750 Sobic002G322100--Sobic003G068700 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic009G005750--Sobic002G375600 Sobic004G087900 Sobic004G087900 Sobic009G005750--Sobic004G087900 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic006G269300 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic009G005750--Sobic007G031000 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic009G005750--Sobic001G227601 Sobic009G005750--Sobic009G106300 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic009G005750--Sobic002G429200 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic009G005750--Sobic002G295550
Octagon: transcription factors


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