Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G541232.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SC57
Pfam -
Panther DB PTHR34948
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20400.1 : adenylate cyclase family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G152100 - -
2 Sobic.008G067700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G019601 - -
4 Sobic.005G048300 - -
5 Sobic.005G084850 - -
6 Sobic.001G332900 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
7 Sobic.006G269300 - -
8 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
9 Sobic.002G085600 - -
10 Sobic.009G192933 - -
11 Sobic.001G410300 - -
12 Sobic.008G120066 - -
13 Sobic.009G005750 - -
14 Sobic.001G350300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G174200 carrier, putative, expressed -
16 Sobic.006G170800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed K00025: malate dehydrogenase
17 Sobic.009G181900 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
18 Sobic.006G260101 - -
19 Sobic.001G113400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@seed maturation protein PM41, putative, expressed -
20 Sobic.008G005800 PMR5, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G541232 Sobic001G541232 Sobic006G152100 Sobic006G152100 Sobic001G541232--Sobic006G152100 Sobic008G067700 Sobic008G067700 Sobic001G541232--Sobic008G067700 Sobic001G019601 Sobic001G019601 Sobic001G541232--Sobic001G019601 Sobic005G048300 Sobic005G048300 Sobic001G541232--Sobic005G048300 Sobic005G084850 Sobic005G084850 Sobic001G541232--Sobic005G084850 Sobic001G332900 Sobic001G332900 Sobic001G541232--Sobic001G332900 Sobic006G269300 Sobic006G269300 Sobic001G541232--Sobic006G269300 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic001G541232--Sobic003G017300 Sobic002G085600 Sobic002G085600 Sobic001G541232--Sobic002G085600 Sobic006G152100--Sobic001G541232 Sobic006G152100--Sobic005G048300 Sobic006G152100--Sobic001G019601 Sobic006G152100--Sobic008G067700 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic006G152100--Sobic008G120066 Sobic006G152100--Sobic005G084850 Sobic006G152100--Sobic006G269300 Sobic002G322100 Sobic002G322100 Sobic006G152100--Sobic002G322100 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic006G152100--Sobic009G005750 Sobic008G067700--Sobic001G541232 Sobic008G067700--Sobic001G019601 Sobic008G067700--Sobic006G152100 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic008G067700--Sobic009G036366 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic008G067700--Sobic010G249600 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic008G067700--Sobic001G503700 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic008G067700--Sobic002G288500 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic008G067700--Sobic009G149600 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic008G067700--Sobic001G350300 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic001G019601--Sobic009G192933 Sobic001G019601--Sobic002G085600 Sobic001G019601--Sobic001G541232 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic001G019601--Sobic001G113400 Sobic001G019601--Sobic006G152100 Sobic001G019601--Sobic008G067700 Sobic009G080000 Sobic009G080000 Sobic001G019601--Sobic009G080000 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic001G019601--Sobic004G144300 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic001G019601--Sobic002G001500 Sobic005G048300--Sobic006G152100 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic005G048300--Sobic007G084400 Sobic005G048300--Sobic005G084850 Sobic005G048300--Sobic001G541232 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic005G048300--Sobic006G247400 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic005G048300--Sobic007G114401 Sobic005G048300--Sobic002G322100 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic005G048300--Sobic001G163000 Sobic008G024550 Sobic008G024550 Sobic005G048300--Sobic008G024550 Sobic005G084850--Sobic005G048300 Sobic005G084850--Sobic006G152100 Sobic005G084850--Sobic001G541232 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic005G084850--Sobic001G410300 Sobic005G084850--Sobic007G084400 Sobic003G068700 Sobic003G068700 Sobic005G084850--Sobic003G068700 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic005G084850--Sobic009G215350 Sobic010G069000 Sobic010G069000 Sobic005G084850--Sobic010G069000 Sobic005G084850--Sobic001G019601 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic001G332900--Sobic007G114650 Sobic001G332900--Sobic001G541232 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic001G332900--Sobic010G278400 Sobic001G332900--Sobic008G067700 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic001G332900--Sobic003G250340 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic001G332900--Sobic003G440500 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic001G332900--Sobic009G181900 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic001G332900--Sobic006G260101 Sobic008G134500 Sobic008G134500 Sobic001G332900--Sobic008G134500 Sobic006G269300--Sobic003G017300 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic006G269300--Sobic001G456650 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic006G269300--Sobic009G114900 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic006G269300--Sobic002G252700 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic006G269300--Sobic009G106300 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic006G269300--Sobic001G033200 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic009G005750 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic006G269300--Sobic007G061500 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic006G269300 Sobic003G017300--Sobic009G106300 Sobic003G017300--Sobic001G410300 Sobic003G017300--Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic006G260101 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic009G005750 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic003G017300--Sobic003G159400 Sobic002G085600--Sobic001G113400 Sobic002G085600--Sobic002G001500 Sobic002G085600--Sobic009G192933 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic002G085600--Sobic003G362800 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic002G085600--Sobic001G191300 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic002G085600--Sobic004G305300 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic002G085600--Sobic009G223900 Sobic002G085600--Sobic004G144300 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic002G085600--Sobic002G398600
Octagon: transcription factors


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