Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G260000.1
Synonym Sb06g032300
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YA33
Pfam PF12274
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G072400 protein kinase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G166600 expressed protein -
3 Sobic.005G210400 OsFBDUF22 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G037701 - -
5 Sobic.003G370800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K15849: PAT, bifunctional aspartate aminotransferase and glutamate/aspartate-prephenate aminotransferase
6 Sobic.004G330800 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.001G336450 - -
8 Sobic.003G244850 - -
9 Sobic.007G195900 expressed protein -
10 Sobic.001G330775 - -
11 Sobic.003G384750 - -
12 Sobic.009G020300 one zinc finger protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G375200 expressed protein -
14 Sobic.001G159500 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G212900 myosin head family protein, expressed K10357: myosin V
16 Sobic.007G048000 - -
17 Sobic.003G232500 - -
18 Sobic.003G106800 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
19 Sobic.007G059150 - -
20 Sobic.001G437050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G260000 Sobic006G260000 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic006G260000--Sobic008G072400 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic006G260000--Sobic004G166600 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic006G260000--Sobic005G210400 Sobic010G037701 Sobic010G037701 Sobic006G260000--Sobic010G037701 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic006G260000--Sobic003G370800 Sobic004G330800 Sobic004G330800 Sobic006G260000--Sobic004G330800 Sobic001G336450 Sobic001G336450 Sobic006G260000--Sobic001G336450 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic006G260000--Sobic003G244850 Sobic007G195900 Sobic007G195900 Sobic006G260000--Sobic007G195900 Sobic005G106700 Sobic005G106700 Sobic008G072400--Sobic005G106700 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic008G072400--Sobic010G093200 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic008G072400--Sobic003G106800 Sobic004G327900 Sobic004G327900 Sobic008G072400--Sobic004G327900 Sobic008G072400--Sobic004G166600 Sobic009G212900 Sobic009G212900 Sobic008G072400--Sobic009G212900 Sobic006G244200 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Octagon: transcription factors


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