Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G015700.1
Synonym Sb07g001410, RPS3, RPM1
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YM04
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF485
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g43390.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035998 , Zm00025a054560
Brachypodium KQJ91708 , KQJ91707 , KQK03630 , KQK03353 , KQK20879
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G397400 thiol protease SEN102 precursor, putative, expressed -
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14 Sobic.001G435600 - -
15 Sobic.002G415300 - -
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17 Sobic.007G142300 expressed protein -
18 Sobic.002G415400 - -
19 Sobic.009G115050 - -
20 Sobic.005G110436 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G015700 Sobic007G015700 Sobic002G397400 Sobic002G397400 Sobic007G015700--Sobic002G397400 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic007G015700--Sobic005G212400 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic007G015700--Sobic001G127700 Sobic005G147800 Sobic005G147800 Sobic007G015700--Sobic005G147800 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic007G015700--Sobic006G172700 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic007G015700--Sobic010G124200 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic007G015700--Sobic009G059100 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic007G015700--Sobic007G009600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic007G015700--Sobic002G329500 Sobic002G397400--Sobic005G147800 Sobic002G397400--Sobic005G212400 Sobic007G142300 Sobic007G142300 Sobic002G397400--Sobic007G142300 Sobic002G397400--Sobic010G124200 Sobic001G265900 Sobic001G265900 Sobic002G397400--Sobic001G265900 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic002G397400--Sobic010G107200 Sobic002G397400--Sobic001G127700 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic002G397400--Sobic005G209900 Sobic001G307300 Sobic001G307300 Sobic002G397400--Sobic001G307300 Sobic005G212400--Sobic001G127700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic005G212400--Sobic002G415400 Sobic005G212400--Sobic010G124200 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic005G212400--Sobic002G415300 Sobic005G212400--Sobic006G172700 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic005G212400--Sobic009G115050 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic005G212400--Sobic001G435600 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic005G212400--Sobic004G060700 Sobic005G212400--Sobic002G329500 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic001G127700--Sobic002G415400 Sobic005G147800--Sobic007G142300 Sobic005G147800--Sobic001G265900 Sobic005G147800--Sobic002G397400 Sobic005G147800--Sobic010G107200 Sobic005G147800--Sobic010G124200 Sobic005G147800--Sobic005G209900 Sobic010G096200 Sobic010G096200 Sobic005G147800--Sobic010G096200 Sobic005G147800--Sobic005G212400 Sobic005G147800--Sobic001G127700 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic010G124200--Sobic005G212400 Sobic010G124200--Sobic006G172700 Sobic010G124200--Sobic001G127700 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic010G124200--Sobic006G001400 Sobic010G124200--Sobic002G397400 Sobic010G124200--Sobic005G147800 Sobic010G124200--Sobic009G059100 Sobic010G124200--Sobic002G020100 Sobic010G124200--Sobic007G142300 Sobic009G059100--Sobic006G172700 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic009G059100--Sobic003G157500 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic009G059100--Sobic006G025700 Sobic009G059100--Sobic001G003600 Sobic009G059100--Sobic002G020100 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic009G059100--Sobic005G200600 Sobic009G059100--Sobic005G056201 Sobic009G059100--Sobic003G096100 Sobic009G059100--Sobic001G435600 Sobic007G009600--Sobic004G060700 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic007G170800 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic007G009600--Sobic001G379300 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic007G009600--Sobic006G238100 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic002G415300 Sobic007G009600--Sobic001G435600 Sobic007G009600--Sobic002G415400 Sobic002G329500--Sobic009G115050 Sobic002G329500--Sobic002G415400 Sobic002G329500--Sobic001G435600 Sobic002G329500--Sobic002G415300 Sobic002G329500--Sobic001G003600 Sobic002G329500--Sobic004G060700 Sobic002G329500--Sobic001G127700 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic002G329500--Sobic003G058600 Sobic002G329500--Sobic004G076000
Octagon: transcription factors


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