Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G172700.1
Synonym Sb06g024800
Functional annotation LTPL122 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5YDJ5
Pfam PF14547
Panther DB PTHR31731 PTHR31731:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12520 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46830.1 : LTPL122 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052000 , Zm00025a056848 , Zm00025a021415 , Zm00025a010289 , Zm00025a052004
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G087780.9 , HORVU1Hr1G053590.1 , HORVU1Hr1G053740.1 , HORVU4Hr1G087780.10 , HORVU4Hr1G087800.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G172700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.002G415300 - -
20 Sobic.009G098100 T-complex protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic006G172700 Sobic001G003600--Sobic002G020100 Sobic001G003600--Sobic009G115050 Sobic001G003600--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic004G076000 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic001G003600--Sobic001G435600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic001G003600--Sobic002G329500 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G003600--Sobic003G058600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G003600--Sobic005G110436 Sobic009G059100--Sobic006G172700 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic009G059100--Sobic003G157500 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic009G059100--Sobic006G025700 Sobic009G059100--Sobic001G003600 Sobic009G059100--Sobic002G020100 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic009G059100--Sobic005G200600 Sobic009G059100--Sobic005G056201 Sobic009G059100--Sobic003G096100 Sobic009G059100--Sobic001G435600 Sobic002G020100--Sobic001G003600 Sobic002G020100--Sobic006G172700 Sobic002G020100--Sobic005G056201 Sobic002G020100--Sobic004G076000 Sobic002G020100--Sobic009G115050 Sobic002G020100--Sobic009G059100 Sobic002G020100--Sobic002G329500 Sobic009G098100 Sobic009G098100 Sobic002G020100--Sobic009G098100 Sobic002G020100--Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic001G127700--Sobic002G415400 Sobic005G056201--Sobic006G172700 Sobic005G056201--Sobic002G020100 Sobic005G056201--Sobic001G003600 Sobic005G056201--Sobic009G059100 Sobic005G056201--Sobic004G076000 Sobic005G056201--Sobic003G157500 Sobic005G056201--Sobic003G096100 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic005G056201--Sobic005G020200 Sobic005G056201--Sobic006G025700 Sobic001G323801 Sobic001G323801 Sobic004G076000--Sobic001G323801 Sobic004G076000--Sobic009G115050 Sobic004G076000--Sobic001G003600 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic004G076000--Sobic008G123600 Sobic001G017000 Sobic001G017000 Sobic004G076000--Sobic001G017000 Sobic004G076000--Sobic002G020100 Sobic004G076000--Sobic005G110436 Sobic004G076000--Sobic006G172700 Sobic003G295800 Sobic003G295800 Sobic004G076000--Sobic003G295800 Sobic009G115050--Sobic002G329500 Sobic009G115050--Sobic001G003600 Sobic009G115050--Sobic002G415400 Sobic009G115050--Sobic001G435600 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic009G115050--Sobic002G415300 Sobic009G115050--Sobic004G076000 Sobic009G115050--Sobic005G110436 Sobic009G115050--Sobic001G127700 Sobic009G115050--Sobic002G020100 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic004G060700--Sobic002G416950 Sobic004G060700--Sobic002G415300 Sobic004G060700--Sobic007G170800 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic004G060700--Sobic007G009600 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic002G415400 Sobic004G060700--Sobic001G435600 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic004G060700--Sobic006G238100 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic004G060700--Sobic001G379300 Sobic003G096100--Sobic001G003600 Sobic003G096100--Sobic006G172700 Sobic001G366500 Sobic001G366500 Sobic003G096100--Sobic001G366500 Sobic003G096100--Sobic009G059100 Sobic003G096100--Sobic001G435600 Sobic003G096100--Sobic003G058600 Sobic003G074600 Sobic003G074600 Sobic003G096100--Sobic003G074600 Sobic003G096100--Sobic002G020100 Sobic003G096100--Sobic005G110436
Octagon: transcription factors


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