Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G041900.6,Sobic.007G041900.8,Sobic.007G041900.5,Sobic.007G041900.1,Sobic.007G041900.4,Sobic.007G041900.7,Sobic.007G041900.2
Synonym Sb07g003480
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1B6PFH0 , A0A1Z5R8W4
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF498
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45200 : Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08390.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92820 , PNT60485
Barley -
Wheat TraesCS7D02G454400 , TraesCS2A02G001000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G042200 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
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6 Sobic.005G227050 - -
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9 Sobic.003G176200 - -
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14 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.010G116100 expressed protein -
16 Sobic.007G210900 expressed protein -
17 Sobic.004G154600 expressed protein -
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19 Sobic.002G179700 3-ketoacyl-CoA synthase precursor, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
20 Sobic.008G130700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G041900 Sobic007G041900 Sobic007G042200 Sobic007G042200 Sobic007G041900--Sobic007G042200 Sobic007G103800 Sobic007G103800 Sobic007G041900--Sobic007G103800 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic007G041900--Sobic001G275800 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic007G041900--Sobic007G123200 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic007G041900--Sobic006G001400 Sobic005G227050 Sobic005G227050 Sobic007G041900--Sobic005G227050 Sobic007G151200 Sobic007G151200 Sobic007G041900--Sobic007G151200 Sobic001G442800 Sobic001G442800 Sobic007G041900--Sobic001G442800 Sobic003G176200 Sobic003G176200 Sobic007G041900--Sobic003G176200 Sobic007G042200--Sobic007G041900 Sobic007G042200--Sobic007G103800 Sobic007G042200--Sobic001G275800 Sobic007G042200--Sobic003G176200 Sobic007G042200--Sobic006G001400 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic007G042200--Sobic008G130700 Sobic005G142900 Sobic005G142900 Sobic007G042200--Sobic005G142900 Sobic001G229500 Sobic001G229500 Sobic007G042200--Sobic001G229500 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic007G042200--Sobic005G218100 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic007G103800--Sobic007G012800 Sobic007G103800--Sobic005G227050 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic007G103800--Sobic009G134000 Sobic002G179700 Sobic002G179700 Sobic007G103800--Sobic002G179700 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic007G103800--Sobic009G154100 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic007G103800--Sobic005G130700 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic007G103800--Sobic005G196500 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic007G103800--Sobic003G420800 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G103800--Sobic005G209900 Sobic005G203600 Sobic005G203600 Sobic001G275800--Sobic005G203600 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic001G275800--Sobic007G090415 Sobic001G275800--Sobic007G123200 Sobic001G275800--Sobic001G229500 Sobic001G275800--Sobic008G130700 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic001G275800--Sobic005G020200 Sobic001G275800--Sobic005G218100 Sobic001G275800--Sobic003G176200 Sobic001G275800--Sobic006G001400 Sobic003G029300 Sobic003G029300 Sobic007G123200--Sobic003G029300 Sobic007G123200--Sobic003G176200 Sobic007G123200--Sobic001G275800 Sobic008G008500 Sobic008G008500 Sobic007G123200--Sobic008G008500 Sobic007G123200--Sobic007G090415 Sobic007G123200--Sobic005G227050 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic007G123200--Sobic004G151900 Sobic007G123200--Sobic008G130700 Sobic001G358900 Sobic001G358900 Sobic007G123200--Sobic001G358900 Sobic006G001400--Sobic005G196500 Sobic004G001200 Sobic004G001200 Sobic006G001400--Sobic004G001200 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic006G001400--Sobic009G059100 Sobic006G001400--Sobic005G020200 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic006G001400--Sobic010G124200 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic006G001400--Sobic003G157500 Sobic006G233600 Sobic006G233600 Sobic006G001400--Sobic006G233600 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic006G001400--Sobic006G172700 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic006G001400--Sobic005G056201 Sobic005G227050--Sobic005G209900 Sobic005G227050--Sobic005G196500 Sobic005G227050--Sobic009G154100 Sobic005G227050--Sobic002G179700 Sobic001G356400 Sobic001G356400 Sobic005G227050--Sobic001G356400 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic005G227050--Sobic010G107200 Sobic005G227050--Sobic006G001400 Sobic005G227050--Sobic007G103800 Sobic005G227050--Sobic007G123200 Sobic007G151200--Sobic001G275800 Sobic007G151200--Sobic007G123200 Sobic005G121500 Sobic005G121500 Sobic007G151200--Sobic005G121500 Sobic002G201100 Sobic002G201100 Sobic007G151200--Sobic002G201100 Sobic007G151200--Sobic003G176200 Sobic007G151200--Sobic001G358900 Sobic007G151200--Sobic005G020200 Sobic007G151200--Sobic006G001400 Sobic005G218400 Sobic005G218400 Sobic007G151200--Sobic005G218400 Sobic006G197500 Sobic006G197500 Sobic001G442800--Sobic006G197500 Sobic008G076900 Sobic008G076900 Sobic001G442800--Sobic008G076900 Sobic008G182500 Sobic008G182500 Sobic001G442800--Sobic008G182500 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic001G442800--Sobic009G175200 Sobic003G158100 Sobic003G158100 Sobic001G442800--Sobic003G158100 Sobic009G099700 Sobic009G099700 Sobic001G442800--Sobic009G099700 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic001G442800--Sobic007G099500 Sobic009G036500 Sobic009G036500 Sobic001G442800--Sobic009G036500 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic001G442800--Sobic004G154600 Sobic003G176200--Sobic008G130700 Sobic003G176200--Sobic007G123200 Sobic003G176200--Sobic001G275800 Sobic003G176200--Sobic007G090415 Sobic003G176200--Sobic005G121500 Sobic009G102800 Sobic009G102800 Sobic003G176200--Sobic009G102800 Sobic003G176200--Sobic003G029300 Sobic003G176200--Sobic008G008500 Sobic003G176200--Sobic004G151900
Octagon: transcription factors


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