Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G119900.1
Synonym Sb10g010560
Functional annotation embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed
UniProt C5Z8X9
Pfam PF13962
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF53
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11000 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g17600.1 : cadmium tolerance factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050500
Brachypodium PNT76062
Barley -
Wheat TraesCS7D02G216100 , TraesCS7A02G214000 , TraesCS7B02G121300 , TraesCS7B02G121300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.005G130700 expressed protein -
3 Sobic.010G116100 expressed protein -
4 Sobic.003G272900 - -
5 Sobic.005G056201 - -
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10 Sobic.001G170900 expressed protein -
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14 Sobic.005G196500 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G150800 expressed protein -
16 Sobic.007G021000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G130600 expressed protein -
18 Sobic.006G096500 glutamate decarboxylase, putative, expressed K01580: E4.1.1.15, gadB, gadA, glutamate decarboxylase
19 Sobic.001G037400 expressed protein -
20 Sobic.010G124200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G119900 Sobic010G119900 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic010G119900--Sobic003G006100 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic010G119900--Sobic005G130700 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic010G119900--Sobic010G116100 Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic010G119900--Sobic003G272900 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic010G119900--Sobic005G056201 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic010G119900--Sobic009G134000 Sobic008G182000 Sobic008G182000 Sobic010G119900--Sobic008G182000 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic010G119900--Sobic006G001400 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic010G119900--Sobic005G110600 Sobic003G006100--Sobic010G119900 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic003G006100--Sobic003G419600 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic003G006100--Sobic001G140800 Sobic004G150800 Sobic004G150800 Sobic003G006100--Sobic004G150800 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic003G006100--Sobic010G124200 Sobic007G090424 Sobic007G090424 Sobic003G006100--Sobic007G090424 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic003G006100--Sobic006G096500 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic003G006100--Sobic010G228100 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G006100--Sobic001G037400 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic003G272900 Sobic010G116100--Sobic005G130700 Sobic010G116100--Sobic006G062300 Sobic005G130550 Sobic005G130550 Sobic010G116100--Sobic005G130550 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic010G116100--Sobic007G012800 Sobic010G116100--Sobic005G110600 Sobic010G116100--Sobic003G419600 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic010G116100--Sobic004G297950 Sobic010G116100--Sobic003G277200 Sobic010G116100--Sobic009G134000 Sobic003G272900--Sobic005G110600 Sobic003G272900--Sobic005G130700 Sobic003G272900--Sobic001G140800 Sobic005G087400 Sobic005G087400 Sobic003G272900--Sobic005G087400 Sobic003G272900--Sobic003G006100 Sobic003G272900--Sobic009G134000 Sobic003G272900--Sobic010G119900 Sobic003G272900--Sobic006G245600 Sobic003G272900--Sobic004G150800 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic005G056201--Sobic006G172700 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic005G056201--Sobic002G020100 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic005G056201--Sobic001G003600 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic005G056201--Sobic009G059100 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic005G056201--Sobic004G076000 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic005G056201--Sobic003G157500 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic005G056201--Sobic003G096100 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic005G056201--Sobic005G020200 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic005G056201--Sobic006G025700 Sobic009G134000--Sobic007G012800 Sobic010G143300 Sobic010G143300 Sobic009G134000--Sobic010G143300 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic009G134000--Sobic009G154100 Sobic009G134000--Sobic003G277200 Sobic006G178800 Sobic006G178800 Sobic009G134000--Sobic006G178800 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic009G134000--Sobic010G107200 Sobic001G389600 Sobic001G389600 Sobic009G134000--Sobic001G389600 Sobic001G478100 Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic005G130700 Sobic008G182000--Sobic010G119900 Sobic008G182000--Sobic003G006100 Sobic007G202100 Sobic007G202100 Sobic008G182000--Sobic007G202100 Sobic001G170900 Sobic001G170900 Sobic008G182000--Sobic001G170900 Sobic008G182000--Sobic003G419600 Sobic008G182000--Sobic004G150800 Sobic005G112000 Sobic005G112000 Sobic008G182000--Sobic005G112000 Sobic008G182000--Sobic010G116100 Sobic008G182000--Sobic005G130700 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic006G001400--Sobic005G196500 Sobic004G001200 Sobic004G001200 Sobic006G001400--Sobic004G001200 Sobic006G001400--Sobic009G059100 Sobic006G001400--Sobic005G020200 Sobic006G001400--Sobic010G124200 Sobic006G001400--Sobic003G157500 Sobic006G233600 Sobic006G233600 Sobic006G001400--Sobic006G233600 Sobic006G001400--Sobic006G172700 Sobic006G001400--Sobic005G056201 Sobic005G110600--Sobic005G130700 Sobic005G110600--Sobic006G062300 Sobic005G110600--Sobic004G297950 Sobic005G110600--Sobic001G140800 Sobic005G110600--Sobic003G419600 Sobic010G133932 Sobic010G133932 Sobic005G110600--Sobic010G133932 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic005G110600--Sobic010G007000 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic005G110600--Sobic003G269100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic005G110600--Sobic001G484000
Octagon: transcription factors


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