Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G182000.2
Synonym Sb08g022386
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R7J2
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45530 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G119900 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.007G202100 expressed protein -
4 Sobic.001G170900 expressed protein -
5 Sobic.003G419600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
6 Sobic.004G150800 expressed protein -
7 Sobic.005G112000 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G116100 expressed protein -
9 Sobic.005G130700 expressed protein -
10 Sobic.001G099500 ankyrin repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G023900 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G228100 "DEP3(Ortholog in rice:Qiao et al., 2011)"(PubMedID : 31659937)@PLA IIIA/PLP7, putative, expressed -
13 Sobic.010G007000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.006G096500 glutamate decarboxylase, putative, expressed K01580: E4.1.1.15, gadB, gadA, glutamate decarboxylase
15 Sobic.007G090424 - K01061: carboxymethylenebutenolidase
16 Sobic.006G062300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.002G062600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
18 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.001G037400 expressed protein -
20 Sobic.005G130600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G182000 Sobic008G182000 Sobic010G119900 Sobic010G119900 Sobic008G182000--Sobic010G119900 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic008G182000--Sobic003G006100 Sobic007G202100 Sobic007G202100 Sobic008G182000--Sobic007G202100 Sobic001G170900 Sobic001G170900 Sobic008G182000--Sobic001G170900 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic008G182000--Sobic003G419600 Sobic004G150800 Sobic004G150800 Sobic008G182000--Sobic004G150800 Sobic005G112000 Sobic005G112000 Sobic008G182000--Sobic005G112000 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic008G182000--Sobic010G116100 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic008G182000--Sobic005G130700 Sobic010G119900--Sobic003G006100 Sobic010G119900--Sobic005G130700 Sobic010G119900--Sobic010G116100 Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic010G119900--Sobic003G272900 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic010G119900--Sobic005G056201 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic010G119900--Sobic009G134000 Sobic010G119900--Sobic008G182000 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic010G119900--Sobic006G001400 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic010G119900--Sobic005G110600 Sobic003G006100--Sobic010G119900 Sobic003G006100--Sobic003G419600 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic003G006100--Sobic001G140800 Sobic003G006100--Sobic004G150800 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic003G006100--Sobic010G124200 Sobic007G090424 Sobic007G090424 Sobic003G006100--Sobic007G090424 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic003G006100--Sobic006G096500 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic003G006100--Sobic010G228100 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G006100--Sobic001G037400 Sobic007G111700 Sobic007G111700 Sobic007G202100--Sobic007G111700 Sobic007G202100--Sobic003G419600 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic007G202100--Sobic008G170400 Sobic007G202100--Sobic005G110600 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic007G202100--Sobic010G007000 Sobic007G202100--Sobic005G130700 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic007G202100--Sobic006G062300 Sobic005G130600 Sobic005G130600 Sobic007G202100--Sobic005G130600 Sobic002G034301 Sobic002G034301 Sobic007G202100--Sobic002G034301 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G170900--Sobic003G058600 Sobic001G170900--Sobic005G056201 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic001G170900--Sobic001G003600 Sobic003G191000 Sobic003G191000 Sobic001G170900--Sobic003G191000 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic001G170900--Sobic006G172700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic001G170900--Sobic007G009600 Sobic001G394250 Sobic001G394250 Sobic001G170900--Sobic001G394250 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G170900--Sobic005G110436 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic001G170900--Sobic001G127700 Sobic003G419600--Sobic005G130700 Sobic003G419600--Sobic010G007000 Sobic003G419600--Sobic005G110600 Sobic003G419600--Sobic006G062300 Sobic003G419600--Sobic001G037400 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic003G419600--Sobic003G277200 Sobic003G419600--Sobic007G111700 Sobic003G419600--Sobic003G006100 Sobic003G419600--Sobic010G116100 Sobic004G150800--Sobic006G096500 Sobic005G087400 Sobic005G087400 Sobic004G150800--Sobic005G087400 Sobic004G150800--Sobic003G006100 Sobic004G150800--Sobic001G037400 Sobic004G150800--Sobic005G110600 Sobic004G150800--Sobic001G140800 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic004G150800--Sobic004G297950 Sobic004G150800--Sobic005G130600 Sobic004G150800--Sobic003G419600 Sobic003G371400 Sobic003G371400 Sobic005G112000--Sobic003G371400 Sobic003G082700 Sobic003G082700 Sobic005G112000--Sobic003G082700 Sobic001G388000 Sobic001G388000 Sobic005G112000--Sobic001G388000 Sobic010G133932 Sobic010G133932 Sobic005G112000--Sobic010G133932 Sobic003G270400 Sobic003G270400 Sobic005G112000--Sobic003G270400 Sobic003G366300 Sobic003G366300 Sobic005G112000--Sobic003G366300 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic005G112000--Sobic001G208600 Sobic005G112000--Sobic010G007000 Sobic006G160900 Sobic006G160900 Sobic005G112000--Sobic006G160900 Sobic010G116100--Sobic005G130700 Sobic010G116100--Sobic006G062300 Sobic005G130550 Sobic005G130550 Sobic010G116100--Sobic005G130550 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic010G116100--Sobic007G012800 Sobic010G116100--Sobic005G110600 Sobic010G116100--Sobic003G419600 Sobic010G116100--Sobic004G297950 Sobic010G116100--Sobic003G277200 Sobic010G116100--Sobic009G134000 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic003G272900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.