Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G202100.2,Sobic.007G202100.1
Synonym Sb07g026950
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PJ27 , A0A1B6PIY9
Pfam -
Panther DB PTHR33115 PTHR33115:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18980 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G111700 glutathione S-transferase, C-terminal domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G419600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
3 Sobic.008G170400 expressed protein -
4 Sobic.005G110600 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
5 Sobic.010G007000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.005G130700 expressed protein -
7 Sobic.006G062300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.005G130600 expressed protein -
9 Sobic.002G034301 - -
10 Sobic.010G116100 expressed protein -
11 Sobic.005G112000 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G057000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
13 Sobic.007G208100 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G231400 cyclin, putative, expressed K18813: cyclin D7, plant
15 Sobic.002G064600 expressed protein -
16 Sobic.004G297950 - -
17 Sobic.001G140800 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G182000 expressed protein -
19 Sobic.003G270400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G402400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G202100 Sobic007G202100 Sobic007G111700 Sobic007G111700 Sobic007G202100--Sobic007G111700 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic007G202100--Sobic003G419600 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic007G202100--Sobic008G170400 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic007G202100--Sobic005G110600 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic007G202100--Sobic010G007000 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic007G202100--Sobic005G130700 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic007G202100--Sobic006G062300 Sobic005G130600 Sobic005G130600 Sobic007G202100--Sobic005G130600 Sobic002G034301 Sobic002G034301 Sobic007G202100--Sobic002G034301 Sobic007G111700--Sobic008G170400 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic007G111700--Sobic002G016400 Sobic005G098400 Sobic005G098400 Sobic007G111700--Sobic005G098400 Sobic007G050500 Sobic007G050500 Sobic007G111700--Sobic007G050500 Sobic005G025900 Sobic005G025900 Sobic007G111700--Sobic005G025900 Sobic001G345200 Sobic001G345200 Sobic007G111700--Sobic001G345200 Sobic007G111700--Sobic002G034301 Sobic007G111700--Sobic007G202100 Sobic007G111700--Sobic003G419600 Sobic003G419600--Sobic005G130700 Sobic003G419600--Sobic010G007000 Sobic003G419600--Sobic005G110600 Sobic003G419600--Sobic006G062300 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G419600--Sobic001G037400 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic003G419600--Sobic003G277200 Sobic003G419600--Sobic007G111700 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic003G419600--Sobic003G006100 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic003G419600--Sobic010G116100 Sobic008G170400--Sobic007G111700 Sobic008G170400--Sobic002G016400 Sobic008G170400--Sobic005G098400 Sobic005G231400 Sobic005G231400 Sobic008G170400--Sobic005G231400 Sobic003G418300 Sobic003G418300 Sobic008G170400--Sobic003G418300 Sobic008G170400--Sobic010G007000 Sobic008G170400--Sobic005G110600 Sobic002G064600 Sobic002G064600 Sobic008G170400--Sobic002G064600 Sobic008G170400--Sobic006G062300 Sobic005G110600--Sobic005G130700 Sobic005G110600--Sobic006G062300 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic005G110600--Sobic004G297950 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic005G110600--Sobic001G140800 Sobic005G110600--Sobic003G419600 Sobic010G133932 Sobic010G133932 Sobic005G110600--Sobic010G133932 Sobic005G110600--Sobic010G007000 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic005G110600--Sobic003G269100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic005G110600--Sobic001G484000 Sobic010G007000--Sobic002G064600 Sobic010G007000--Sobic003G419600 Sobic010G007000--Sobic005G110600 Sobic010G007000--Sobic008G170400 Sobic010G007000--Sobic006G062300 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic010G007000--Sobic003G296500 Sobic005G112000 Sobic005G112000 Sobic010G007000--Sobic005G112000 Sobic001G402400 Sobic001G402400 Sobic010G007000--Sobic001G402400 Sobic002G062600 Sobic002G062600 Sobic010G007000--Sobic002G062600 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic005G130700--Sobic003G272900 Sobic006G062300--Sobic005G130700 Sobic006G062300--Sobic005G110600 Sobic006G062300--Sobic010G116100 Sobic006G062300--Sobic003G419600 Sobic006G062300--Sobic010G007000 Sobic006G062300--Sobic001G140800 Sobic006G062300--Sobic008G170400 Sobic006G062300--Sobic004G297950 Sobic006G062300--Sobic007G202100 Sobic005G130600--Sobic004G297950 Sobic003G321400 Sobic003G321400 Sobic005G130600--Sobic003G321400 Sobic005G130600--Sobic003G269100 Sobic005G130600--Sobic005G110600 Sobic005G130600--Sobic001G140800 Sobic003G115200 Sobic003G115200 Sobic005G130600--Sobic003G115200 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic005G130600--Sobic006G096500 Sobic001G046800 Sobic001G046800 Sobic005G130600--Sobic001G046800 Sobic001G099600 Sobic001G099600 Sobic005G130600--Sobic001G099600 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic002G034301--Sobic007G208100 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic002G034301--Sobic005G231300 Sobic005G057000 Sobic005G057000 Sobic002G034301--Sobic005G057000 Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic002G034301--Sobic005G121700 Sobic002G034301--Sobic007G111700 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic002G034301--Sobic008G077300 Sobic002G034301--Sobic002G016400 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic002G034301--Sobic003G420100 Sobic003G052100 Sobic003G052100 Sobic002G034301--Sobic003G052100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.