Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G170900.2,Sobic.001G170900.3
Synonym Sb01g014950
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WT71
Pfam -
Panther DB PTHR33167
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G67390 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39100.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007223
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G058600 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.005G056201 - -
3 Sobic.001G003600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.003G191000 FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K03146: THI4, cysteine-dependent adenosine diphosphate thiazole synthase
5 Sobic.006G172700 LTPL122 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.007G009600 expressed protein -
7 Sobic.001G394250 - -
8 Sobic.005G110436 - -
9 Sobic.001G127700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
10 Sobic.003G096100 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
11 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.009G115050 - -
13 Sobic.002G020100 chalcone synthase, putative, expressed -
14 Sobic.003G074600 Lecithin: cholesterol acyltransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@lecithin:cholesterol acyltransferase, putative, expressed K06129: lysophospholipase III
15 Sobic.002G329500 Beta amylase BAM (Zm)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
16 Sobic.010G240600 - -
17 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
18 Sobic.004G076000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Protein peroxiredoxin-5 (Os)(PubMedID : 27208977)@peroxiredoxin, putative, expressed -
19 Sobic.002G020000 wax synthase, putative, expressed -
20 Sobic.007G090424 - K01061: carboxymethylenebutenolidase


Gene co-expression network
sample Sobic001G170900 Sobic001G170900 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G170900--Sobic003G058600 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic001G170900--Sobic005G056201 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic001G170900--Sobic001G003600 Sobic003G191000 Sobic003G191000 Sobic001G170900--Sobic003G191000 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic001G170900--Sobic006G172700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic001G170900--Sobic007G009600 Sobic001G394250 Sobic001G394250 Sobic001G170900--Sobic001G394250 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G170900--Sobic005G110436 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic001G170900--Sobic001G127700 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic003G058600--Sobic004G060700 Sobic003G058600--Sobic001G003600 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic003G058600--Sobic001G435600 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic003G058600--Sobic009G115050 Sobic003G058600--Sobic007G009600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic003G058600--Sobic002G329500 Sobic003G058600--Sobic006G172700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic003G058600--Sobic002G415400 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic003G058600--Sobic002G415300 Sobic005G056201--Sobic006G172700 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic005G056201--Sobic002G020100 Sobic005G056201--Sobic001G003600 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic005G056201--Sobic009G059100 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic005G056201--Sobic004G076000 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic005G056201--Sobic003G157500 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic005G056201--Sobic003G096100 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic005G056201--Sobic005G020200 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic005G056201--Sobic006G025700 Sobic001G003600--Sobic006G172700 Sobic001G003600--Sobic002G020100 Sobic001G003600--Sobic009G115050 Sobic001G003600--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic004G076000 Sobic001G003600--Sobic001G435600 Sobic001G003600--Sobic002G329500 Sobic001G003600--Sobic003G058600 Sobic001G003600--Sobic005G110436 Sobic007G075700 Sobic007G075700 Sobic003G191000--Sobic007G075700 Sobic003G191000--Sobic001G170900 Sobic003G191000--Sobic005G056201 Sobic003G234101 Sobic003G234101 Sobic003G191000--Sobic003G234101 Sobic003G191000--Sobic007G009600 Sobic009G161100 Sobic009G161100 Sobic003G191000--Sobic009G161100 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic003G191000--Sobic008G123600 Sobic003G110100 Sobic003G110100 Sobic003G191000--Sobic003G110100 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic003G191000--Sobic005G200600 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic007G009600--Sobic004G060700 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic002G416950 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic007G009600--Sobic007G170800 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic007G009600--Sobic001G379300 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic007G009600--Sobic006G238100 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic002G415300 Sobic007G009600--Sobic001G435600 Sobic007G009600--Sobic002G415400 Sobic004G105800 Sobic004G105800 Sobic001G394250--Sobic004G105800 Sobic001G519400 Sobic001G519400 Sobic001G394250--Sobic001G519400 Sobic001G394250--Sobic005G110436 Sobic001G394250--Sobic003G096100 Sobic001G394250--Sobic001G003600 Sobic002G020000 Sobic002G020000 Sobic001G394250--Sobic002G020000 Sobic001G394250--Sobic001G127700 Sobic001G394250--Sobic006G172700 Sobic003G074600 Sobic003G074600 Sobic001G394250--Sobic003G074600 Sobic005G110436--Sobic009G115050 Sobic005G110436--Sobic001G003600 Sobic005G110436--Sobic004G076000 Sobic005G110436--Sobic002G329500 Sobic002G351000 Sobic002G351000 Sobic005G110436--Sobic002G351000 Sobic005G110436--Sobic001G127700 Sobic005G110436--Sobic002G020000 Sobic005G110436--Sobic001G394250 Sobic005G110436--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic001G127700--Sobic002G415400
Octagon: transcription factors


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