Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G090424.1,Sobic.007G090424.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8Z1 , A0A1Z5R9W5
Pfam PF12695 PF01738
Panther DB PTHR17630 PTHR17630:SF56
NCBI CDD KOG3043; Predicted hydrolase related to dienelactone hydrolase
KEGG Orthology K01061; carboxymethylenebutenolidase
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23600 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14109.1 : retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030907 , Zm00025a030908
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G127700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
2 Sobic.006G084500 expressed protein -
3 Sobic.006G172700 LTPL122 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
4 Sobic.008G123600 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
5 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.005G056201 - -
7 Sobic.007G009600 expressed protein -
8 Sobic.001G003600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
10 Sobic.009G059100 Cupin domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G110436 - -
12 Sobic.009G115050 - -
13 Sobic.007G170800 Fatty acyl CoA reductase 1 FAR1 (At)(PubMedID : 27208977)@male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
14 Sobic.001G435600 - -
15 Sobic.002G415300 - -
16 Sobic.002G415400 - -
17 Sobic.005G200600 dirigent, putative, expressed -
18 Sobic.005G212400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.004G263000 expressed protein -
20 Sobic.005G165400 OsSub17 - Putative Subtilisin homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G090424 Sobic007G090424 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic007G090424--Sobic001G127700 Sobic006G084500 Sobic006G084500 Sobic007G090424--Sobic006G084500 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic007G090424--Sobic006G172700 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic007G090424--Sobic008G123600 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic007G090424--Sobic003G006100 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic007G090424--Sobic005G056201 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic007G090424--Sobic007G009600 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic007G090424--Sobic001G003600 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic007G090424--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic001G127700--Sobic002G415400 Sobic006G084500--Sobic008G123600 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G084500--Sobic002G020100 Sobic006G084500--Sobic001G003600 Sobic006G084500--Sobic006G172700 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic006G084500--Sobic001G069500 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic006G084500--Sobic004G076000 Sobic006G084500--Sobic007G090424 Sobic006G084500--Sobic005G056201 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic006G084500--Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic008G123600--Sobic004G076000 Sobic003G383600 Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic001G003600 Sobic001G323801 Sobic001G323801 Sobic008G123600--Sobic001G323801 Sobic008G123600--Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G435600 Sobic008G123600--Sobic009G115050 Sobic003G295800 Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic006G172700 Sobic010G119900 Sobic010G119900 Sobic003G006100--Sobic010G119900 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic003G006100--Sobic003G419600 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic003G006100--Sobic001G140800 Sobic004G150800 Sobic004G150800 Sobic003G006100--Sobic004G150800 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic003G006100--Sobic010G124200 Sobic003G006100--Sobic007G090424 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic003G006100--Sobic006G096500 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic003G006100--Sobic010G228100 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G006100--Sobic001G037400 Sobic005G056201--Sobic006G172700 Sobic005G056201--Sobic002G020100 Sobic005G056201--Sobic001G003600 Sobic005G056201--Sobic009G059100 Sobic005G056201--Sobic004G076000 Sobic003G157500 Sobic003G157500 Sobic005G056201--Sobic003G157500 Sobic005G056201--Sobic003G096100 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic005G056201--Sobic005G020200 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic005G056201--Sobic006G025700 Sobic007G009600--Sobic004G060700 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic007G170800 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic007G009600--Sobic001G379300 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic007G009600--Sobic006G238100 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic008G163200 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic007G009600--Sobic002G415300 Sobic007G009600--Sobic001G435600 Sobic007G009600--Sobic002G415400 Sobic001G003600--Sobic006G172700 Sobic001G003600--Sobic002G020100 Sobic001G003600--Sobic009G115050 Sobic001G003600--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic004G076000 Sobic001G003600--Sobic001G435600 Sobic001G003600--Sobic002G329500 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G003600--Sobic003G058600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G003600--Sobic005G110436 Sobic004G060700--Sobic002G416950 Sobic004G060700--Sobic002G415300 Sobic004G060700--Sobic007G170800 Sobic004G060700--Sobic007G009600 Sobic004G060700--Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic002G415400 Sobic004G060700--Sobic001G435600 Sobic004G060700--Sobic006G238100 Sobic004G060700--Sobic001G379300
Octagon: transcription factors


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