Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G263000.1
Synonym Sb04g030130
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XZY3
Pfam -
Panther DB PTHR33237 PTHR33237:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49000 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48150.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021773 , Zm00025a021775
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G127700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
2 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
3 Sobic.007G009600 expressed protein -
4 Sobic.007G170800 Fatty acyl CoA reductase 1 FAR1 (At)(PubMedID : 27208977)@male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
5 Sobic.008G123600 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
6 Sobic.006G172700 LTPL122 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.001G003600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
8 Sobic.002G329500 Beta amylase BAM (Zm)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
9 Sobic.009G115050 - -
10 Sobic.002G415400 - -
11 Sobic.001G435600 - -
12 Sobic.001G519400 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G415300 - -
14 Sobic.002G416950 - -
15 Sobic.005G212400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
16 Sobic.006G238100 LTPL126 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.008G066700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
18 Sobic.003G058600 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.004G076000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Protein peroxiredoxin-5 (Os)(PubMedID : 27208977)@peroxiredoxin, putative, expressed -
20 Sobic.002G033000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G263000 Sobic004G263000 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic004G263000--Sobic001G127700 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic004G263000--Sobic004G060700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic004G263000--Sobic007G009600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic004G263000--Sobic007G170800 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic004G263000--Sobic008G123600 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic004G263000--Sobic006G172700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic004G263000--Sobic001G003600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic004G263000--Sobic002G329500 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic004G263000--Sobic009G115050 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic001G127700--Sobic002G415400 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic004G060700--Sobic002G416950 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic004G060700--Sobic002G415300 Sobic004G060700--Sobic007G170800 Sobic004G060700--Sobic007G009600 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic002G415400 Sobic004G060700--Sobic001G435600 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic004G060700--Sobic006G238100 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic004G060700--Sobic001G379300 Sobic007G009600--Sobic004G060700 Sobic007G009600--Sobic002G416950 Sobic007G009600--Sobic007G170800 Sobic007G009600--Sobic001G379300 Sobic007G009600--Sobic006G238100 Sobic007G009600--Sobic008G163200 Sobic007G009600--Sobic002G415300 Sobic007G009600--Sobic001G435600 Sobic007G009600--Sobic002G415400 Sobic007G170800--Sobic004G060700 Sobic003G114200 Sobic003G114200 Sobic007G170800--Sobic003G114200 Sobic007G170800--Sobic007G009600 Sobic007G170800--Sobic002G416950 Sobic007G170800--Sobic008G163200 Sobic007G170800--Sobic001G435600 Sobic007G170800--Sobic002G415300 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic007G170800--Sobic001G541300 Sobic007G170800--Sobic001G379300 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic008G123600--Sobic004G076000 Sobic003G383600 Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic001G003600 Sobic001G323801 Sobic001G323801 Sobic008G123600--Sobic001G323801 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G435600 Sobic008G123600--Sobic009G115050 Sobic003G295800 Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic006G172700 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic006G172700 Sobic001G003600--Sobic002G020100 Sobic001G003600--Sobic009G115050 Sobic001G003600--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic004G076000 Sobic001G003600--Sobic001G435600 Sobic001G003600--Sobic002G329500 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G003600--Sobic003G058600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G003600--Sobic005G110436 Sobic002G329500--Sobic009G115050 Sobic002G329500--Sobic002G415400 Sobic002G329500--Sobic001G435600 Sobic002G329500--Sobic002G415300 Sobic002G329500--Sobic001G003600 Sobic002G329500--Sobic004G060700 Sobic002G329500--Sobic001G127700 Sobic002G329500--Sobic003G058600 Sobic002G329500--Sobic004G076000 Sobic009G115050--Sobic002G329500 Sobic009G115050--Sobic001G003600 Sobic009G115050--Sobic002G415400 Sobic009G115050--Sobic001G435600 Sobic009G115050--Sobic002G415300 Sobic009G115050--Sobic004G076000 Sobic009G115050--Sobic005G110436 Sobic009G115050--Sobic001G127700 Sobic009G115050--Sobic002G020100
Octagon: transcription factors


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