Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G272900.1
Synonym Sb03g032490
Functional annotation -
UniProt C5XHN1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G56540 : arabinogalactan protein 14
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110600 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
2 Sobic.005G130700 expressed protein -
3 Sobic.001G140800 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G087400 alpha-N-arabinofuranosidase A, putative, expressed K01209: alpha-L-arabinofuranosidase
5 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.009G134000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
7 Sobic.010G119900 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G245600 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G150800 expressed protein -
10 Sobic.010G133932 - -
11 Sobic.006G062300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.001G388000 GTPase-activating protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G129600 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed K14611: SLC23A1, solute carrier family 23 (nucleobase transporter), member 1
14 Sobic.003G277200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G297950 - -
16 Sobic.010G116100 expressed protein -
17 Sobic.005G145100 phospholipase A2, putative, expressed -
18 Sobic.007G130900 expressed protein -
19 Sobic.001G037400 expressed protein -
20 Sobic.001G099600 ankyrin repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic003G272900--Sobic005G110600 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic003G272900--Sobic005G130700 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic003G272900--Sobic001G140800 Sobic005G087400 Sobic005G087400 Sobic003G272900--Sobic005G087400 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic003G272900--Sobic003G006100 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic003G272900--Sobic009G134000 Sobic010G119900 Sobic010G119900 Sobic003G272900--Sobic010G119900 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic003G272900--Sobic006G245600 Sobic004G150800 Sobic004G150800 Sobic003G272900--Sobic004G150800 Sobic005G110600--Sobic005G130700 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic005G110600--Sobic006G062300 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic005G110600--Sobic004G297950 Sobic005G110600--Sobic001G140800 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic005G110600--Sobic003G419600 Sobic010G133932 Sobic010G133932 Sobic005G110600--Sobic010G133932 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic005G110600--Sobic010G007000 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic005G110600--Sobic003G269100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic005G110600--Sobic001G484000 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic003G272900 Sobic001G140800--Sobic005G110600 Sobic001G388000 Sobic001G388000 Sobic001G140800--Sobic001G388000 Sobic005G145100 Sobic005G145100 Sobic001G140800--Sobic005G145100 Sobic001G140800--Sobic010G133932 Sobic001G140800--Sobic005G087400 Sobic001G129600 Sobic001G129600 Sobic001G140800--Sobic001G129600 Sobic001G140800--Sobic005G130700 Sobic001G140800--Sobic001G484000 Sobic001G140800--Sobic006G062300 Sobic005G087400--Sobic001G140800 Sobic005G087400--Sobic004G150800 Sobic006G096500 Sobic006G096500 Sobic005G087400--Sobic006G096500 Sobic005G087400--Sobic001G388000 Sobic005G087400--Sobic001G129600 Sobic005G087400--Sobic003G272900 Sobic005G087400--Sobic005G145100 Sobic005G087400--Sobic005G110600 Sobic005G087400--Sobic003G006100 Sobic003G006100--Sobic010G119900 Sobic003G006100--Sobic003G419600 Sobic003G006100--Sobic001G140800 Sobic003G006100--Sobic004G150800 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic003G006100--Sobic010G124200 Sobic007G090424 Sobic007G090424 Sobic003G006100--Sobic007G090424 Sobic003G006100--Sobic006G096500 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic003G006100--Sobic010G228100 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G006100--Sobic001G037400 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic009G134000--Sobic007G012800 Sobic010G143300 Sobic010G143300 Sobic009G134000--Sobic010G143300 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic009G134000--Sobic009G154100 Sobic009G134000--Sobic003G277200 Sobic006G178800 Sobic006G178800 Sobic009G134000--Sobic006G178800 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic009G134000--Sobic010G107200 Sobic001G389600 Sobic001G389600 Sobic009G134000--Sobic001G389600 Sobic001G478100 Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic005G130700 Sobic010G119900--Sobic003G006100 Sobic010G119900--Sobic005G130700 Sobic010G119900--Sobic010G116100 Sobic010G119900--Sobic003G272900 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic010G119900--Sobic005G056201 Sobic010G119900--Sobic009G134000 Sobic008G182000 Sobic008G182000 Sobic010G119900--Sobic008G182000 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic010G119900--Sobic006G001400 Sobic010G119900--Sobic005G110600 Sobic007G130900 Sobic007G130900 Sobic006G245600--Sobic007G130900 Sobic004G170900 Sobic004G170900 Sobic006G245600--Sobic004G170900 Sobic005G047100 Sobic005G047100 Sobic006G245600--Sobic005G047100 Sobic006G245600--Sobic005G130700 Sobic006G245600--Sobic005G110600 Sobic006G245600--Sobic003G277200 Sobic006G245600--Sobic004G297950 Sobic008G039800 Sobic008G039800 Sobic006G245600--Sobic008G039800 Sobic006G218400 Sobic006G218400 Sobic006G245600--Sobic006G218400 Sobic004G150800--Sobic006G096500 Sobic004G150800--Sobic005G087400 Sobic004G150800--Sobic003G006100 Sobic004G150800--Sobic001G037400 Sobic004G150800--Sobic005G110600 Sobic004G150800--Sobic001G140800 Sobic004G150800--Sobic004G297950 Sobic005G130600 Sobic005G130600 Sobic004G150800--Sobic005G130600 Sobic004G150800--Sobic003G419600
Octagon: transcription factors


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