Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G009800.2,Sobic.008G009800.1
Synonym Sb08g000920
Functional annotation OsFBX185 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R4A8 , A0A1B6PAV3
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF122
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58940 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g04980.1,LOC_Os06g04690.1 : OsFBX185 - F-box domain containing protein, expressed,OsFBX184 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK16921 , KQK16922 , PNT75389 , PNT75388
Barley -
Wheat TraesCS5A02G293200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G172000 - -
2 Sobic.003G191400 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G228300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
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5 Sobic.005G023400 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
6 Sobic.001G068000 - -
7 Sobic.001G139400 - -
8 Sobic.005G035250 - -
9 Sobic.001G539880 - -
10 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
11 Sobic.007G148233 - -
12 Sobic.009G167201 - -
13 Sobic.003G195400 - -
14 Sobic.005G035200 - -
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16 Sobic.009G091000 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.11 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
17 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
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19 Sobic.002G128700 expressed protein -
20 Sobic.007G221932 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G009800 Sobic008G009800 Sobic005G172000 Sobic005G172000 Sobic008G009800--Sobic005G172000 Sobic003G191400 Sobic003G191400 Sobic008G009800--Sobic003G191400 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic008G009800--Sobic004G228300 Sobic010G191900 Sobic010G191900 Sobic008G009800--Sobic010G191900 Sobic005G023400 Sobic005G023400 Sobic008G009800--Sobic005G023400 Sobic001G068000 Sobic001G068000 Sobic008G009800--Sobic001G068000 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic008G009800--Sobic001G139400 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic008G009800--Sobic005G035250 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic008G009800--Sobic001G539880 Sobic005G172000--Sobic003G191400 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic005G172000--Sobic002G128700 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G172000--Sobic010G257800 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic005G172000--Sobic010G190500 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic005G172000--Sobic006G173400 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic005G172000--Sobic010G271600 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic005G172000--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic005G172000--Sobic001G539820 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G172000--Sobic008G102850 Sobic003G191400--Sobic005G172000 Sobic003G191400--Sobic010G191900 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191400--Sobic008G168932 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191400--Sobic004G289900 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G191400--Sobic004G024800 Sobic003G191400--Sobic001G539880 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191400--Sobic005G185750 Sobic003G191400--Sobic010G257800 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic003G191400--Sobic008G097800 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic004G228300--Sobic006G143900 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic004G228300--Sobic005G214700 Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic004G228300--Sobic002G104801 Sobic004G228300--Sobic010G190500 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic004G228300--Sobic002G157900 Sobic003G145300 Sobic003G145300 Sobic004G228300--Sobic003G145300 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic004G228300--Sobic009G090400 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic004G228300--Sobic001G332200 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic004G228300--Sobic007G222200 Sobic010G191900--Sobic003G191400 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic010G191900--Sobic008G181900 Sobic001G539600 Sobic001G539600 Sobic010G191900--Sobic001G539600 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic010G191900--Sobic004G222400 Sobic010G141001 Sobic010G141001 Sobic010G191900--Sobic010G141001 Sobic003G255400 Sobic003G255400 Sobic010G191900--Sobic003G255400 Sobic010G276200 Sobic010G276200 Sobic010G191900--Sobic010G276200 Sobic003G329600 Sobic003G329600 Sobic010G191900--Sobic003G329600 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic010G191900--Sobic010G176400 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic005G023400--Sobic007G221932 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic005G023400--Sobic005G035200 Sobic005G023400--Sobic008G097800 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic005G023400--Sobic009G091000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic005G023400--Sobic004G336401 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic005G023400--Sobic009G252000 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic005G023400--Sobic002G145400 Sobic005G023400--Sobic004G024800 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic005G023400--Sobic010G254100 Sobic001G068000--Sobic005G023400 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic001G068000--Sobic008G057800 Sobic001G068000--Sobic004G024800 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic001G068000--Sobic008G011901 Sobic001G068000--Sobic007G221932 Sobic001G068000--Sobic008G097800 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic001G068000--Sobic007G080100 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic001G068000--Sobic002G323000 Sobic001G068000--Sobic002G145400 Sobic001G139400--Sobic005G009700 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic005G000200 Sobic001G139400--Sobic001G539820 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G139400--Sobic002G225800 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic004G158100 Sobic001G139400--Sobic002G128700 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic001G139400--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G139400--Sobic003G114800 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic001G139400--Sobic007G148233 Sobic005G035250--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic005G035250--Sobic003G195400 Sobic005G035250--Sobic002G225800 Sobic005G035250--Sobic001G539880 Sobic005G035250--Sobic005G035200 Sobic005G035250--Sobic004G024800 Sobic005G035250--Sobic007G080100 Sobic005G035250--Sobic002G145400 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic005G035250--Sobic007G222700 Sobic001G539880--Sobic007G148233 Sobic001G539880--Sobic003G195400 Sobic001G539880--Sobic004G024800 Sobic001G539880--Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic005G035200 Sobic001G539880--Sobic007G080100 Sobic001G539880--Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G145400
Octagon: transcription factors


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