Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G076401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R594
Pfam PF07993
Panther DB PTHR11011 PTHR11011:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G44550 : fatty acid reductase 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g44360.1 : male sterility protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034039
Brachypodium KQJ95970
Barley HORVU7Hr1G092230.9 , HORVU7Hr1G092230.8 , HORVU7Hr1G092230.1 , HORVU7Hr1G092230.2 , HORVU7Hr1G092230.5 , HORVU7Hr1G092230.4 , HORVU7Hr1G092230.7 , HORVU3Hr1G002170.3 , HORVU3Hr1G002170.2 , HORVU3Hr1G002170.1 , HORVU3Hr1G002120.1 , HORVU3Hr1G002120.2 , HORVU3Hr1G002120.3 , HORVU3Hr1G002120.4 , HORVU7Hr1G092230.10
Wheat TraesCS3D02G012700 , TraesCS6B02G012900 , TraesCS3A02G014900 , TraesCS3B02G016500 , TraesCS3B02G016500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G315200 expressed protein -
2 Sobic.005G099500 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase
3 Sobic.007G029000 TKL_IRAK_DUF26-lc.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
4 Sobic.009G070800 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
5 Sobic.003G068300 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G080050 - -
7 Sobic.009G115050 - -
8 Sobic.002G415400 - -
9 Sobic.008G123600 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
10 Sobic.002G415300 - -
11 Sobic.001G472000 Polyamine oxidase 1("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K13366: MPAO, polyamine oxidase
12 Sobic.009G206000 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.001G435600 - -
14 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
15 Sobic.002G297900 CDGSH iron sulfur domain-containing protein 1, putative, expressed -
16 Sobic.002G329500 Beta amylase BAM (Zm)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
17 Sobic.008G163200 OsSCP9 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
18 Sobic.001G003600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.007G009600 expressed protein -
20 Sobic.001G127700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase


Gene co-expression network
sample Sobic008G076401 Sobic008G076401 Sobic001G315200 Sobic001G315200 Sobic008G076401--Sobic001G315200 Sobic005G099500 Sobic005G099500 Sobic008G076401--Sobic005G099500 Sobic007G029000 Sobic007G029000 Sobic008G076401--Sobic007G029000 Sobic009G070800 Sobic009G070800 Sobic008G076401--Sobic009G070800 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic008G076401--Sobic003G068300 Sobic005G080050 Sobic005G080050 Sobic008G076401--Sobic005G080050 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic008G076401--Sobic009G115050 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic008G076401--Sobic002G415400 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic008G076401--Sobic008G123600 Sobic001G472000 Sobic001G472000 Sobic001G315200--Sobic001G472000 Sobic001G315200--Sobic009G070800 Sobic009G161100 Sobic009G161100 Sobic001G315200--Sobic009G161100 Sobic009G009500 Sobic009G009500 Sobic001G315200--Sobic009G009500 Sobic008G189500 Sobic008G189500 Sobic001G315200--Sobic008G189500 Sobic002G107000 Sobic002G107000 Sobic001G315200--Sobic002G107000 Sobic009G000900 Sobic009G000900 Sobic001G315200--Sobic009G000900 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic001G315200--Sobic003G007800 Sobic004G007500 Sobic004G007500 Sobic001G315200--Sobic004G007500 Sobic010G074600 Sobic010G074600 Sobic005G099500--Sobic010G074600 Sobic005G099500--Sobic009G070800 Sobic005G099500--Sobic001G315200 Sobic006G103900 Sobic006G103900 Sobic005G099500--Sobic006G103900 Sobic005G099500--Sobic009G009500 Sobic005G168700 Sobic005G168700 Sobic005G099500--Sobic005G168700 Sobic005G099500--Sobic008G076401 Sobic008G049200 Sobic008G049200 Sobic005G099500--Sobic008G049200 Sobic001G012600 Sobic001G012600 Sobic005G099500--Sobic001G012600 Sobic007G029000--Sobic004G007500 Sobic007G029000--Sobic009G070800 Sobic009G136300 Sobic009G136300 Sobic007G029000--Sobic009G136300 Sobic007G029000--Sobic009G000900 Sobic001G161300 Sobic001G161300 Sobic007G029000--Sobic001G161300 Sobic009G075100 Sobic009G075100 Sobic007G029000--Sobic009G075100 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic007G029000--Sobic003G106500 Sobic009G197300 Sobic009G197300 Sobic007G029000--Sobic009G197300 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic007G029000--Sobic001G198700 Sobic009G070800--Sobic009G009500 Sobic009G070800--Sobic009G000900 Sobic009G070800--Sobic007G029000 Sobic009G070800--Sobic004G007500 Sobic009G070800--Sobic001G315200 Sobic009G070800--Sobic009G197300 Sobic007G168000 Sobic007G168000 Sobic009G070800--Sobic007G168000 Sobic009G070800--Sobic009G075100 Sobic009G070800--Sobic008G049200 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic003G068300--Sobic002G415300 Sobic003G068300--Sobic002G415400 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic003G068300--Sobic008G163200 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic003G068300--Sobic001G255300 Sobic009G206000 Sobic009G206000 Sobic003G068300--Sobic009G206000 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic003G068300--Sobic004G060700 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic003G068300--Sobic006G238100 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic003G068300--Sobic002G416950 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic003G068300--Sobic004G328900 Sobic005G080050--Sobic008G123600 Sobic001G357200 Sobic001G357200 Sobic005G080050--Sobic001G357200 Sobic005G080050--Sobic009G161100 Sobic005G080050--Sobic003G068300 Sobic002G033000 Sobic002G033000 Sobic005G080050--Sobic002G033000 Sobic005G165400 Sobic005G165400 Sobic005G080050--Sobic005G165400 Sobic005G080050--Sobic001G472000 Sobic001G323801 Sobic001G323801 Sobic005G080050--Sobic001G323801 Sobic005G080050--Sobic002G415400 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic009G115050--Sobic002G329500 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic009G115050--Sobic001G003600 Sobic009G115050--Sobic002G415400 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic009G115050--Sobic001G435600 Sobic009G115050--Sobic002G415300 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic009G115050--Sobic004G076000 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic009G115050--Sobic005G110436 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic009G115050--Sobic001G127700 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic009G115050--Sobic002G020100 Sobic002G415400--Sobic002G415300 Sobic002G415400--Sobic001G435600 Sobic002G415400--Sobic004G060700 Sobic002G415400--Sobic003G068300 Sobic002G415400--Sobic008G163200 Sobic002G415400--Sobic009G115050 Sobic002G415400--Sobic002G416950 Sobic002G415400--Sobic002G329500 Sobic002G415400--Sobic006G238100 Sobic008G123600--Sobic004G076000 Sobic003G383600 Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic003G383600 Sobic008G123600--Sobic001G003600 Sobic008G123600--Sobic001G323801 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G069500 Sobic008G123600--Sobic001G435600 Sobic008G123600--Sobic009G115050 Sobic003G295800 Sobic003G295800 Sobic008G123600--Sobic003G295800 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic008G123600--Sobic006G172700
Octagon: transcription factors


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