Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G149400.1
Synonym Sb08g019930
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PDS9
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31920 PTHR31920:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33280 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40120.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004493
Brachypodium PNT62415 , PNT62416 , KQJ86030
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G168200 -(PubMedID : 34525227)@expressed protein K17911: beta-carotene isomerase
2 Sobic.009G195500 expressed protein -
3 Sobic.009G247200 - -
4 Sobic.001G145550 - -
5 Sobic.002G398300 expressed protein -
6 Sobic.002G297100 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G212900 expressed protein -
8 Sobic.002G375500 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
10 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
11 Sobic.009G213150 - -
12 Sobic.004G310350 - -
13 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
14 Sobic.002G046150 - -
15 Sobic.007G149500 expressed protein -
16 Sobic.001G422001 - -
17 Sobic.003G085533 - -
18 Sobic.007G175100 carrier, putative, expressed -
19 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
20 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G149400 Sobic008G149400 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic008G149400--Sobic005G168200 Sobic009G195500 Sobic009G195500 Sobic008G149400--Sobic009G195500 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic008G149400--Sobic009G247200 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic008G149400--Sobic001G145550 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic008G149400--Sobic002G398300 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic008G149400--Sobic002G297100 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic008G149400--Sobic002G212900 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic008G149400--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic008G149400--Sobic002G208500 Sobic005G168200--Sobic009G247200 Sobic005G168200--Sobic001G145550 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic005G168200--Sobic001G174100 Sobic005G168200--Sobic002G375500 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic005G168200--Sobic001G422001 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic005G168200--Sobic002G046150 Sobic005G168200--Sobic002G208500 Sobic005G168200--Sobic002G212900 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G168200--Sobic009G213150 Sobic009G195500--Sobic008G149400 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic009G195500--Sobic004G291300 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic009G195500--Sobic003G142800 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic009G195500--Sobic010G132400 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic009G195500--Sobic006G232100 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic009G195500--Sobic004G332200 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic009G195500--Sobic002G214000 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic009G195500--Sobic003G416200 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic009G195500--Sobic004G224733 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic009G247200--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic009G247200--Sobic004G310350 Sobic009G247200--Sobic005G168200 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic009G247200--Sobic008G129500 Sobic009G247200--Sobic002G212900 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic009G247200--Sobic001G497400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G247200--Sobic007G042700 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic009G247200--Sobic002G000350 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic009G247200--Sobic004G252300 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic001G145550--Sobic009G037500 Sobic001G145550--Sobic001G422001 Sobic001G145550--Sobic009G213150 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic001G145550--Sobic007G149500 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G145550--Sobic006G094900 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G145550--Sobic002G094000 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic001G145550--Sobic004G278800 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic001G145550--Sobic003G142500 Sobic001G145550--Sobic002G375500 Sobic002G398300--Sobic002G297100 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic002G398300--Sobic003G312800 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic002G398300--Sobic007G133733 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic002G398300--Sobic003G312600 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic002G398300--Sobic003G312900 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G398300--Sobic004G209100 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic002G398300--Sobic001G239000 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic002G398300--Sobic005G027350 Sobic010G160850 Sobic010G160850 Sobic002G398300--Sobic010G160850 Sobic002G297100--Sobic002G398300 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic003G232600 Sobic002G297100--Sobic005G027350 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G297100--Sobic005G180850 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G297100--Sobic005G090800 Sobic001G455466 Sobic001G455466 Sobic002G297100--Sobic001G455466 Sobic002G297100--Sobic004G209100 Sobic002G297100--Sobic003G312800 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic002G297100--Sobic009G030501 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic004G310350 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic002G375500--Sobic007G175100 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic002G375500--Sobic007G038100 Sobic002G375500--Sobic002G208500 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic002G375500--Sobic007G174500 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic002G375500--Sobic010G274700 Sobic002G375500--Sobic001G145550 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic002G375500--Sobic006G054200 Sobic002G375500--Sobic005G168200 Sobic002G375500--Sobic001G174100 Sobic002G208500--Sobic002G375500 Sobic002G208500--Sobic007G174500 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic002G208500--Sobic002G226200 Sobic002G208500--Sobic009G247200 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G208500--Sobic003G230800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic002G208500--Sobic010G142501 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic002G208500--Sobic003G219300 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic005G168200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.