Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G195500.2,Sobic.009G195500.1
Synonym Sb09g025390
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R3D6 , A0A1B6P9B1
Pfam PF03407
Panther DB PTHR10994 PTHR10994:SF83
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G70630 : Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044214 , Zm00025a020578
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G076940.4 , HORVU1Hr1G076940.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G149400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.006G232100 expressed protein -
6 Sobic.004G332200 - -
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9 Sobic.004G224733 - -
10 Sobic.003G163000 - -
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14 Sobic.006G216150 - -
15 Sobic.004G310350 - -
16 Sobic.005G154600 - -
17 Sobic.001G395600 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G276600 expressed protein -
19 Sobic.004G310800 zinc finger protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G119200 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G195500 Sobic009G195500 Sobic008G149400 Sobic008G149400 Sobic009G195500--Sobic008G149400 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic009G195500--Sobic004G291300 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic009G195500--Sobic003G142800 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic009G195500--Sobic010G132400 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic009G195500--Sobic006G232100 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic009G195500--Sobic004G332200 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic009G195500--Sobic002G214000 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic009G195500--Sobic003G416200 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic009G195500--Sobic004G224733 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic008G149400--Sobic005G168200 Sobic008G149400--Sobic009G195500 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic008G149400--Sobic009G247200 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic008G149400--Sobic001G145550 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic008G149400--Sobic002G398300 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic008G149400--Sobic002G297100 Sobic002G212900 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Octagon: transcription factors


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