Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G158000.1
Synonym Sb08g020680
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R6X4
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45530 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ89499
Barley -
Wheat TraesCS3B02G592700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G488400 "PGL1(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012)"(PubMedID : 31659850)@bHLH family protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G188500 expressed protein -
3 Sobic.007G189400 BEE 1, putative, expressed -
4 Sobic.006G044200 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
5 Sobic.002G072700 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
6 Sobic.001G228100 gene responsible for epi-cuticular wax accumulation in sorghum.(PubMedID : 29379518)@GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.008G187400 - -
9 Sobic.008G043100 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G139800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
11 Sobic.003G339600 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
12 Sobic.003G116100 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
13 Sobic.001G356400 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.009G154100 expressed protein -
15 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
17 Sobic.001G267800 thaumatin-like protein 1 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G189400 expressed protein -
19 Sobic.003G300400 expressed protein -
20 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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