Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G187400.1,Sobic.008G187400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PEJ1
Pfam -
Panther DB PTHR36885 PTHR36885:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ85650
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G094200 expressed protein -
2 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
3 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.001G488400 "PGL1(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012)"(PubMedID : 31659850)@bHLH family protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G011000 expressed protein -
6 Sobic.005G231400 cyclin, putative, expressed K18813: cyclin D7, plant
7 Sobic.003G300400 expressed protein -
8 Sobic.002G032500 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G309400 OsSub4 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
10 Sobic.002G139800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
11 Sobic.003G338200 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G116100 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
13 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
14 Sobic.004G062100 A tissue specific expression in primordial inflorescences(PubMedID : 27501690)@OsSPL5 - SBP-box gene family member, expressed -
15 Sobic.002G183800 L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G065700 expressed protein -
17 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.008G154700 expressed protein -
19 Sobic.001G345200 OsFBX94 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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