Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G094200.1
Synonym Sb07g009350
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YJU4
Pfam -
Panther DB PTHR33124 PTHR33124:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30410 : sequence-specific DNA binding transcription factors
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g16030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054670
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G094200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G032500 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G416400 basic helix-loop-helix domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G154700 expressed protein -
4 Sobic.003G178500 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
5 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase
6 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
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9 Sobic.006G219100 expressed protein -
10 Sobic.003G300400 expressed protein -
11 Sobic.007G076100 transferase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G179400 glycosyl hydrolases family 16 protein, protein, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
13 Sobic.005G218000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
14 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
15 Sobic.008G187400 - -
16 Sobic.001G341700 "GS3(Ortholog in rice:Mao et al., 2010(PubMedID : 31659843)@ Li et al., 2010)"(PubMedID : 32497208)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
17 Sobic.002G068400 - -
18 Sobic.003G309400 OsSub4 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.004G318800 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
20 Sobic.004G248100 endoglucanase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic007G094200--Sobic002G032500 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic007G094200--Sobic002G416400 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic007G094200--Sobic008G154700 Sobic003G178500 Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic003G178500 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic007G094200--Sobic004G342000 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic007G094200--Sobic010G027700 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic007G094200--Sobic001G438500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic007G094200--Sobic004G227900 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic007G094200--Sobic006G219100 Sobic003G309400 Sobic003G309400 Sobic002G032500--Sobic003G309400 Sobic002G032500--Sobic007G094200 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic002G032500--Sobic003G300400 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic002G032500--Sobic007G211200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic002G032500--Sobic004G211700 Sobic003G089300 Sobic003G089300 Sobic002G032500--Sobic003G089300 Sobic004G248100 Sobic004G248100 Sobic002G032500--Sobic004G248100 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic002G032500--Sobic005G091000 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic002G032500--Sobic003G338200 Sobic002G416400--Sobic003G178500 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic002G416400--Sobic007G076100 Sobic004G318800 Sobic004G318800 Sobic002G416400--Sobic004G318800 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic002G416400--Sobic005G218000 Sobic002G416400--Sobic007G094200 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic002G416400--Sobic001G341700 Sobic002G416400--Sobic004G342000 Sobic006G079500 Sobic006G079500 Sobic002G416400--Sobic006G079500 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic002G416400--Sobic006G092300 Sobic008G154700--Sobic007G094200 Sobic008G154700--Sobic002G416400 Sobic008G154700--Sobic006G219100 Sobic008G154700--Sobic003G300400 Sobic008G154700--Sobic010G027700 Sobic008G154700--Sobic001G438500 Sobic008G154700--Sobic002G032500 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic004G342000 Sobic003G178500--Sobic007G076100 Sobic003G178500--Sobic002G416400 Sobic003G178500--Sobic005G218000 Sobic010G166300 Sobic010G166300 Sobic003G178500--Sobic010G166300 Sobic003G178500--Sobic004G318800 Sobic003G178500--Sobic001G341700 Sobic009G023900 Sobic009G023900 Sobic003G178500--Sobic009G023900 Sobic003G027100 Sobic003G027100 Sobic003G178500--Sobic003G027100 Sobic003G178500--Sobic004G211700 Sobic004G342000--Sobic005G218000 Sobic004G342000--Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic004G211700 Sobic002G029700 Sobic002G029700 Sobic004G342000--Sobic002G029700 Sobic004G342000--Sobic007G076100 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic004G342000--Sobic008G012600 Sobic004G342000--Sobic002G416400 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic004G342000--Sobic006G151800 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic004G342000--Sobic006G089700 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic002G068400 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic010G027700--Sobic004G215000 Sobic010G027700--Sobic001G438500 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic010G027700--Sobic007G125400 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic003G120600 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic007G094200 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic002G023700 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic010G027700--Sobic009G037300 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic001G438500--Sobic004G062100 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic001G438500--Sobic010G215700 Sobic001G438500--Sobic004G215000 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic001G438500--Sobic010G065700 Sobic005G042200 Sobic005G042200 Sobic001G438500--Sobic005G042200 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic001G438500--Sobic001G334501 Sobic002G047366 Sobic002G047366 Sobic001G438500--Sobic002G047366 Sobic001G438500--Sobic008G004200 Sobic002G251200 Sobic002G251200 Sobic001G438500--Sobic002G251200 Sobic004G227900--Sobic008G004200 Sobic004G227900--Sobic001G334501 Sobic010G053300 Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic010G053300 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic004G227900--Sobic005G089700 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic004G227900--Sobic007G000600 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic004G227900--Sobic001G366000 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic004G227900--Sobic005G200700 Sobic003G016000 Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic003G016000 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic004G227900--Sobic008G032400 Sobic006G219100--Sobic007G094200 Sobic006G219100--Sobic004G215000 Sobic006G219100--Sobic001G179400 Sobic006G219100--Sobic004G227900 Sobic006G219100--Sobic008G154700 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic006G219100--Sobic003G116100 Sobic006G219100--Sobic010G027700 Sobic006G219100--Sobic002G068400 Sobic006G219100--Sobic004G342000
Octagon: transcription factors


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