Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G219100.3,Sobic.006G219100.2
Synonym Sb06g028860
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YG50
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g52880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009740
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G219100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G094200 expressed protein -
2 Sobic.004G215000 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G179400 glycosyl hydrolases family 16 protein, protein, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
4 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.008G154700 expressed protein -
6 Sobic.003G116100 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
7 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
8 Sobic.002G068400 - -
9 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase
10 Sobic.006G015900 thaumatin, putative, expressed -
11 Sobic.008G035400 stress responsive A/B Barrel domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G032500 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G045500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
14 Sobic.002G416400 basic helix-loop-helix domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G382500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G338200 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.010G065700 expressed protein -
19 Sobic.008G004200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
20 Sobic.008G110400 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor


Gene co-expression network
sample Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic006G219100--Sobic007G094200 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic006G219100--Sobic004G215000 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic006G219100--Sobic001G179400 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic006G219100--Sobic004G227900 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic006G219100--Sobic008G154700 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic006G219100--Sobic003G116100 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic006G219100--Sobic010G027700 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic006G219100--Sobic002G068400 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic006G219100--Sobic004G342000 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic007G094200--Sobic002G032500 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic007G094200--Sobic002G416400 Sobic007G094200--Sobic008G154700 Sobic003G178500 Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic004G342000 Sobic007G094200--Sobic010G027700 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic007G094200--Sobic001G438500 Sobic007G094200--Sobic004G227900 Sobic007G094200--Sobic006G219100 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic001G179400--Sobic002G068400 Sobic001G179400--Sobic004G215000 Sobic001G179400--Sobic004G342000 Sobic001G179400--Sobic003G120600 Sobic001G179400--Sobic010G027700 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic001G179400--Sobic007G125400 Sobic001G179400--Sobic004G227900 Sobic001G179400--Sobic007G094200 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic001G179400--Sobic002G179200 Sobic004G227900--Sobic008G004200 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic004G227900--Sobic001G334501 Sobic010G053300 Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic010G053300 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic004G227900--Sobic005G089700 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic004G227900--Sobic007G000600 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic004G227900--Sobic001G366000 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic004G227900--Sobic005G200700 Sobic003G016000 Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic003G016000 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic004G227900--Sobic008G032400 Sobic008G154700--Sobic007G094200 Sobic008G154700--Sobic002G416400 Sobic008G154700--Sobic006G219100 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic008G154700--Sobic003G300400 Sobic008G154700--Sobic010G027700 Sobic008G154700--Sobic001G438500 Sobic008G154700--Sobic002G032500 Sobic008G154700--Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic004G342000 Sobic002G419200 Sobic002G419200 Sobic003G116100--Sobic002G419200 Sobic003G116100--Sobic007G094200 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic003G116100--Sobic003G338200 Sobic003G116100--Sobic006G219100 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic003G116100--Sobic006G044200 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic003G116100--Sobic001G488400 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic003G116100--Sobic003G277200 Sobic003G116100--Sobic003G300400 Sobic008G187400 Sobic008G187400 Sobic003G116100--Sobic008G187400 Sobic010G027700--Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic004G215000 Sobic010G027700--Sobic001G438500 Sobic010G027700--Sobic007G125400 Sobic010G027700--Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic007G094200 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic002G023700 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic010G027700--Sobic009G037300 Sobic002G068400--Sobic010G027700 Sobic008G035400 Sobic008G035400 Sobic002G068400--Sobic008G035400 Sobic002G068400--Sobic001G179400 Sobic002G068400--Sobic004G215000 Sobic002G068400--Sobic004G342000 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic002G068400--Sobic010G077700 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic002G068400--Sobic002G382500 Sobic002G068400--Sobic007G094200 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic002G068400--Sobic004G045500 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic004G342000--Sobic005G218000 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic001G341700 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic004G342000--Sobic004G211700 Sobic002G029700 Sobic002G029700 Sobic004G342000--Sobic002G029700 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic007G076100 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic004G342000--Sobic008G012600 Sobic004G342000--Sobic002G416400 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic004G342000--Sobic006G151800 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic004G342000--Sobic006G089700
Octagon: transcription factors


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