Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G068400.1
Synonym Sb02g005740
Functional annotation -
UniProt C5XCJ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016025
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
2 Sobic.008G035400 stress responsive A/B Barrel domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G179400 glycosyl hydrolases family 16 protein, protein, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
4 Sobic.004G215000 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase
6 Sobic.010G077700 ZOS6-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.002G382500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G094200 expressed protein -
9 Sobic.004G045500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G041801 - -
11 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
12 Sobic.006G219100 expressed protein -
13 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.003G120600 transmembrane protein 136, putative, expressed -
15 Sobic.010G065700 expressed protein -
16 Sobic.007G125400 lysM domain containing protein, putative -
17 Sobic.001G488400 "PGL1(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012)"(PubMedID : 31659850)@bHLH family protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G044200 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
19 Sobic.004G248100 endoglucanase, putative, expressed -
20 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic002G068400--Sobic010G027700 Sobic008G035400 Sobic008G035400 Sobic002G068400--Sobic008G035400 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic002G068400--Sobic001G179400 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic002G068400--Sobic004G215000 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic002G068400--Sobic004G342000 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic002G068400--Sobic010G077700 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic002G068400--Sobic002G382500 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic002G068400--Sobic007G094200 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic002G068400--Sobic004G045500 Sobic010G027700--Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic004G215000 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic010G027700--Sobic001G438500 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic010G027700--Sobic007G125400 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic007G094200 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic002G023700 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic010G027700--Sobic009G037300 Sobic008G035400--Sobic002G068400 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic008G035400--Sobic006G044200 Sobic008G035400--Sobic010G027700 Sobic008G035400--Sobic002G382500 Sobic008G035400--Sobic001G179400 Sobic004G248100 Sobic004G248100 Sobic008G035400--Sobic004G248100 Sobic008G035400--Sobic004G215000 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic008G035400--Sobic001G488400 Sobic008G035400--Sobic010G077700 Sobic001G179400--Sobic002G068400 Sobic001G179400--Sobic004G215000 Sobic001G179400--Sobic004G342000 Sobic001G179400--Sobic003G120600 Sobic001G179400--Sobic010G027700 Sobic001G179400--Sobic007G125400 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic001G179400--Sobic004G227900 Sobic001G179400--Sobic007G094200 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic001G179400--Sobic002G179200 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic004G342000--Sobic005G218000 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic001G341700 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic004G342000--Sobic004G211700 Sobic002G029700 Sobic002G029700 Sobic004G342000--Sobic002G029700 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic007G076100 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic004G342000--Sobic008G012600 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic004G342000--Sobic002G416400 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic004G342000--Sobic006G151800 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic004G342000--Sobic006G089700 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic010G077700--Sobic001G119200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic010G077700--Sobic009G254500 Sobic010G077700--Sobic002G068400 Sobic010G077700--Sobic004G342000 Sobic010G077700--Sobic004G215000 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic010G077700--Sobic002G011000 Sobic010G077700--Sobic001G438500 Sobic010G077700--Sobic010G065700 Sobic010G077700--Sobic001G179400 Sobic002G382500--Sobic010G027700 Sobic002G382500--Sobic002G068400 Sobic002G382500--Sobic008G035400 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic002G382500--Sobic003G339600 Sobic002G382500--Sobic006G044200 Sobic002G382500--Sobic001G488400 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic002G382500--Sobic006G219100 Sobic002G382500--Sobic009G037300 Sobic002G382500--Sobic002G023700 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic007G094200--Sobic002G032500 Sobic007G094200--Sobic002G416400 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic007G094200--Sobic008G154700 Sobic003G178500 Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic004G342000 Sobic007G094200--Sobic010G027700 Sobic007G094200--Sobic001G438500 Sobic007G094200--Sobic004G227900 Sobic007G094200--Sobic006G219100 Sobic004G045500--Sobic004G342000 Sobic004G045500--Sobic010G027700 Sobic004G045500--Sobic001G179400 Sobic004G045500--Sobic002G068400 Sobic005G118700 Sobic005G118700 Sobic004G045500--Sobic005G118700 Sobic004G045500--Sobic003G120600 Sobic004G045500--Sobic005G218000 Sobic002G312200 Sobic002G312200 Sobic004G045500--Sobic002G312200 Sobic005G055400 Sobic005G055400 Sobic004G045500--Sobic005G055400
Octagon: transcription factors


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