Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G035400.1
Synonym Sb08g003040
Functional annotation stress responsive A/B Barrel domain containing protein, expressed
UniProt C5YRQ5
Pfam PF07876
Panther DB PTHR33178 PTHR33178:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22580 : Stress responsive A/B Barrel Domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05290.1 : stress responsive A/B Barrel domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92277
Barley -
Wheat TraesCS5A02G130000 , TraesCS5B02G129900 , TraesCS5D02G137500 , TraesCS5D02G137600 , TraesCS5B02G130000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G068400 - -
2 Sobic.006G044200 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
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9 Sobic.010G077700 ZOS6-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
10 Sobic.007G094200 expressed protein -
11 Sobic.006G219100 expressed protein -
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16 Sobic.010G065700 expressed protein -
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18 Sobic.004G045500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G186800 strictosidine synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G035400 Sobic008G035400 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic008G035400--Sobic002G068400 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic008G035400--Sobic006G044200 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic008G035400--Sobic010G027700 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic008G035400--Sobic002G382500 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic008G035400--Sobic001G179400 Sobic004G248100 Sobic004G248100 Sobic008G035400--Sobic004G248100 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic008G035400--Sobic004G215000 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic008G035400--Sobic001G488400 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic008G035400--Sobic010G077700 Sobic002G068400--Sobic010G027700 Sobic002G068400--Sobic008G035400 Sobic002G068400--Sobic001G179400 Sobic002G068400--Sobic004G215000 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic002G068400--Sobic004G342000 Sobic002G068400--Sobic010G077700 Sobic002G068400--Sobic002G382500 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic002G068400--Sobic007G094200 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic002G068400--Sobic004G045500 Sobic006G044200--Sobic008G035400 Sobic006G044200--Sobic001G488400 Sobic005G188500 Sobic005G188500 Sobic006G044200--Sobic005G188500 Sobic006G044200--Sobic004G248100 Sobic006G032800 Sobic006G032800 Sobic006G044200--Sobic006G032800 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic006G044200--Sobic003G116100 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic006G044200--Sobic007G189400 Sobic006G044200--Sobic002G382500 Sobic006G044200--Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic002G068400 Sobic010G027700--Sobic004G215000 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic010G027700--Sobic001G438500 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic010G027700--Sobic007G125400 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic003G120600 Sobic010G027700--Sobic001G179400 Sobic010G027700--Sobic007G094200 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic010G027700--Sobic002G023700 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic010G027700--Sobic009G037300 Sobic002G382500--Sobic010G027700 Sobic002G382500--Sobic002G068400 Sobic002G382500--Sobic008G035400 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic002G382500--Sobic003G339600 Sobic002G382500--Sobic006G044200 Sobic002G382500--Sobic001G488400 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic002G382500--Sobic006G219100 Sobic002G382500--Sobic009G037300 Sobic002G382500--Sobic002G023700 Sobic001G179400--Sobic002G068400 Sobic001G179400--Sobic004G215000 Sobic001G179400--Sobic004G342000 Sobic001G179400--Sobic003G120600 Sobic001G179400--Sobic010G027700 Sobic001G179400--Sobic007G125400 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic001G179400--Sobic004G227900 Sobic001G179400--Sobic007G094200 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic001G179400--Sobic002G179200 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic004G248100--Sobic002G032500 Sobic003G113500 Sobic003G113500 Sobic004G248100--Sobic003G113500 Sobic010G020600 Sobic010G020600 Sobic004G248100--Sobic010G020600 Sobic004G357000 Sobic004G357000 Sobic004G248100--Sobic004G357000 Sobic003G309400 Sobic003G309400 Sobic004G248100--Sobic003G309400 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic004G248100--Sobic003G338200 Sobic004G248100--Sobic003G339600 Sobic004G248100--Sobic006G044200 Sobic004G248100--Sobic007G094200 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic001G488400--Sobic005G188500 Sobic001G488400--Sobic010G027700 Sobic001G488400--Sobic006G044200 Sobic008G187400 Sobic008G187400 Sobic001G488400--Sobic008G187400 Sobic001G488400--Sobic001G438500 Sobic001G488400--Sobic003G116100 Sobic001G488400--Sobic007G189400 Sobic001G488400--Sobic002G068400 Sobic001G488400--Sobic008G035400 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic010G077700--Sobic001G119200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic010G077700--Sobic009G254500 Sobic010G077700--Sobic002G068400 Sobic010G077700--Sobic004G342000 Sobic010G077700--Sobic004G215000 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic010G077700--Sobic002G011000 Sobic010G077700--Sobic001G438500 Sobic010G077700--Sobic010G065700 Sobic010G077700--Sobic001G179400
Octagon: transcription factors


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