Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G300400.1
Synonym Sb03g034960
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XK78
Pfam PF04862
Panther DB PTHR31265 PTHR31265:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29980 : Protein of unknown function, DUF642
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040024 , Zm00025a027524
Brachypodium PNT72878 , KQK09806
Barley HORVU3Hr1G072860.6 , HORVU3Hr1G072860.7 , HORVU3Hr1G072860.4 , HORVU3Hr1G072860.5 , HORVU3Hr1G072860.2 , HORVU3Hr1G072860.3 , HORVU3Hr1G072860.1
Wheat TraesCS3B02G328900 , TraesCS3A02G294300 , TraesCS3D02G294100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G300400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G097700 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic003G309400 Sobic003G309400 Sobic003G300400--Sobic003G309400 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic003G300400--Sobic002G032500 Sobic002G419200 Sobic002G419200 Sobic003G300400--Sobic002G419200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic003G300400--Sobic009G254500 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic003G300400--Sobic007G094200 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic003G300400--Sobic003G339600 Sobic002G229700 Sobic002G229700 Sobic003G300400--Sobic002G229700 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic003G300400--Sobic008G154700 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic003G300400--Sobic009G141300 Sobic003G309400--Sobic003G300400 Sobic003G309400--Sobic002G032500 Sobic004G248100 Sobic004G248100 Sobic003G309400--Sobic004G248100 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic003G309400--Sobic003G338200 Sobic003G309400--Sobic009G254500 Sobic003G309400--Sobic007G094200 Sobic003G309400--Sobic002G229700 Sobic003G309400--Sobic009G141300 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic003G309400--Sobic002G011000 Sobic002G032500--Sobic003G309400 Sobic002G032500--Sobic007G094200 Sobic002G032500--Sobic003G300400 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic002G032500--Sobic007G211200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic002G032500--Sobic004G211700 Sobic003G089300 Sobic003G089300 Sobic002G032500--Sobic003G089300 Sobic002G032500--Sobic004G248100 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic002G032500--Sobic005G091000 Sobic002G032500--Sobic003G338200 Sobic002G419200--Sobic003G300400 Sobic002G419200--Sobic003G338200 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic002G419200--Sobic003G116100 Sobic002G419200--Sobic003G309400 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic002G419200--Sobic003G277200 Sobic001G285200 Sobic001G285200 Sobic002G419200--Sobic001G285200 Sobic002G419200--Sobic002G032500 Sobic002G419200--Sobic004G248100 Sobic002G419200--Sobic003G339600 Sobic009G254500--Sobic002G011000 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic009G254500--Sobic008G012600 Sobic009G254500--Sobic009G141300 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic009G254500--Sobic001G119200 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic009G254500--Sobic001G438500 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic009G254500--Sobic006G160800 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic009G254500--Sobic010G077700 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic009G254500--Sobic004G062100 Sobic009G254500--Sobic003G300400 Sobic007G094200--Sobic002G032500 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic007G094200--Sobic002G416400 Sobic007G094200--Sobic008G154700 Sobic003G178500 Sobic003G178500 Sobic007G094200--Sobic003G178500 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic007G094200--Sobic004G342000 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic007G094200--Sobic010G027700 Sobic007G094200--Sobic001G438500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic007G094200--Sobic004G227900 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic007G094200--Sobic006G219100 Sobic010G020600 Sobic010G020600 Sobic003G339600--Sobic010G020600 Sobic003G339600--Sobic003G300400 Sobic003G339600--Sobic009G254500 Sobic003G339600--Sobic004G248100 Sobic003G339600--Sobic002G229700 Sobic004G283800 Sobic004G283800 Sobic003G339600--Sobic004G283800 Sobic003G339600--Sobic003G309400 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic003G339600--Sobic002G382500 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic003G339600--Sobic007G189400 Sobic002G229700--Sobic003G300400 Sobic002G229700--Sobic003G309400 Sobic002G229700--Sobic003G339600 Sobic002G229700--Sobic004G283800 Sobic002G229700--Sobic002G032500 Sobic002G229700--Sobic004G342000 Sobic002G229700--Sobic003G338200 Sobic002G229700--Sobic009G254500 Sobic009G174100 Sobic009G174100 Sobic002G229700--Sobic009G174100 Sobic008G154700--Sobic007G094200 Sobic008G154700--Sobic002G416400 Sobic008G154700--Sobic006G219100 Sobic008G154700--Sobic003G300400 Sobic008G154700--Sobic010G027700 Sobic008G154700--Sobic001G438500 Sobic008G154700--Sobic002G032500 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic008G004200 Sobic008G154700--Sobic004G342000 Sobic009G141300--Sobic009G254500 Sobic009G141300--Sobic002G011000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic009G141300--Sobic001G135600 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic009G141300--Sobic004G302700 Sobic009G141300--Sobic001G119200 Sobic009G141300--Sobic003G309400 Sobic009G141300--Sobic004G211700 Sobic009G141300--Sobic004G342000 Sobic009G141300--Sobic002G416400
Octagon: transcription factors


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