Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G168600.1
Synonym
Functional annotation SET domain containing protein, expressed
UniProt C5YRX7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41900.1 : SET domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053804
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
2 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
3 Sobic.003G089650 - -
4 Sobic.005G054000 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
5 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
6 Sobic.008G091900 - -
7 Sobic.002G062300 expressed protein -
8 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
11 Sobic.001G267233 - -
12 Sobic.007G121400 YDG/SRA domain containing protein, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
13 Sobic.005G117801 - -
14 Sobic.008G068400 - -
15 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G124200 expressed protein -
17 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
18 Sobic.010G208500 - -
19 Sobic.009G026400 - -
20 Sobic.005G221425 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G168600 Sobic008G168600 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic008G168600--Sobic005G054300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic008G168600--Sobic005G054600 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic008G168600--Sobic003G089650 Sobic005G054000 Sobic005G054000 Sobic008G168600--Sobic005G054000 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic008G168600--Sobic009G004700 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic008G168600--Sobic008G091900 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G168600--Sobic002G062300 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G168600--Sobic001G253100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G168600--Sobic005G212600 Sobic005G054300--Sobic005G054600 Sobic005G054300--Sobic005G054000 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G054300--Sobic009G026400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G054300--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G054300--Sobic005G142200 Sobic005G054300--Sobic002G062300 Sobic005G054300--Sobic005G212600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G054300--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G054300--Sobic002G221200 Sobic005G054600--Sobic005G054300 Sobic005G054600--Sobic005G054000 Sobic005G054600--Sobic009G026400 Sobic005G054600--Sobic001G305400 Sobic005G054600--Sobic002G062300 Sobic005G054600--Sobic009G101600 Sobic005G054600--Sobic002G221200 Sobic005G054600--Sobic005G142200 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G054600--Sobic002G060500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic003G089650--Sobic009G113600 Sobic003G089650--Sobic002G062300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic003G089650--SobicK024000 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic003G089650--Sobic002G056100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic003G089650--Sobic008G009500 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic003G089650--Sobic005G221425 Sobic003G089650--Sobic001G253100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G089650--Sobic008G042250 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G089650--Sobic007G073400 Sobic005G054000--Sobic005G054300 Sobic005G054000--Sobic005G054600 Sobic005G054000--Sobic002G062300 Sobic005G054000--Sobic009G026400 Sobic005G054000--Sobic009G113600 Sobic005G054000--Sobic005G212600 Sobic005G054000--SobicK024000 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic005G054000--Sobic007G059300 Sobic005G054000--Sobic008G009500 Sobic009G004700--Sobic009G113600 Sobic009G004700--Sobic003G089650 Sobic009G004700--Sobic002G062300 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic007G059300 Sobic009G004700--Sobic009G026400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G004700--Sobic006G009400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic009G004700--Sobic005G212500 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G004700--Sobic003G031750 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic009G113600 Sobic002G062300--Sobic007G059300 Sobic002G062300--SobicK024000 Sobic002G062300--Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic003G031750 Sobic002G062300--Sobic008G009500 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic002G062300--Sobic008G108900 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic001G253100 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G253100--Sobic008G049701 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic008G009500 Sobic005G212600--SobicK024000
Octagon: transcription factors


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