Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G035601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1Y4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G365900 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
2 Sobic.001G099300 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.004G263000 expressed protein -
4 Sobic.008G066700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.001G519400 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G383800 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G314800 monocopper oxidase, putative, expressed -
8 Sobic.003G058600 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.009G185400 - -
10 Sobic.007G181000 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
11 Sobic.002G311700 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G199632 - -
13 Sobic.010G225001 - -
14 Sobic.006G249100 expressed protein -
15 Sobic.002G329500 Beta amylase BAM (Zm)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
16 Sobic.001G321200 armadillo, putative, expressed -
17 Sobic.009G206000 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.010G124200 expressed protein -
19 Sobic.002G033000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase


Gene co-expression network
sample Sobic009G035601 Sobic009G035601 Sobic003G365900 Sobic003G365900 Sobic009G035601--Sobic003G365900 Sobic001G099300 Sobic001G099300 Sobic009G035601--Sobic001G099300 Sobic004G263000 Sobic004G263000 Sobic009G035601--Sobic004G263000 Sobic008G066700 Sobic008G066700 Sobic009G035601--Sobic008G066700 Sobic001G519400 Sobic001G519400 Sobic009G035601--Sobic001G519400 Sobic003G383800 Sobic003G383800 Sobic009G035601--Sobic003G383800 Sobic002G314800 Sobic002G314800 Sobic009G035601--Sobic002G314800 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic009G035601--Sobic003G058600 Sobic009G185400 Sobic009G185400 Sobic009G035601--Sobic009G185400 Sobic004G253800 Sobic004G253800 Sobic003G365900--Sobic004G253800 Sobic003G365900--Sobic009G035601 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic003G365900--Sobic005G200600 Sobic006G249100 Sobic006G249100 Sobic003G365900--Sobic006G249100 Sobic002G141100 Sobic002G141100 Sobic003G365900--Sobic002G141100 Sobic009G119400 Sobic009G119400 Sobic003G365900--Sobic009G119400 Sobic002G033000 Sobic002G033000 Sobic003G365900--Sobic002G033000 Sobic010G219500 Sobic010G219500 Sobic003G365900--Sobic010G219500 Sobic003G365900--Sobic008G066700 Sobic001G099300--Sobic002G314800 Sobic010G110500 Sobic010G110500 Sobic001G099300--Sobic010G110500 Sobic010G037600 Sobic010G037600 Sobic001G099300--Sobic010G037600 Sobic005G214600 Sobic005G214600 Sobic001G099300--Sobic005G214600 Sobic010G246700 Sobic010G246700 Sobic001G099300--Sobic010G246700 Sobic001G099300--Sobic008G066700 Sobic001G099300--Sobic009G035601 Sobic001G099300--Sobic006G249100 Sobic001G099300--Sobic001G519400 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic004G263000--Sobic001G127700 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic004G263000--Sobic004G060700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic004G263000--Sobic007G009600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic004G263000--Sobic007G170800 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic004G263000--Sobic008G123600 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic004G263000--Sobic006G172700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic004G263000--Sobic001G003600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic004G263000--Sobic002G329500 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic004G263000--Sobic009G115050 Sobic008G066700--Sobic002G033000 Sobic008G066700--Sobic004G263000 Sobic008G066700--Sobic001G519400 Sobic008G066700--Sobic010G037600 Sobic008G066700--Sobic008G123600 Sobic008G066700--Sobic002G329500 Sobic001G357200 Sobic001G357200 Sobic008G066700--Sobic001G357200 Sobic008G066700--Sobic004G060700 Sobic008G066700--Sobic002G314800 Sobic001G394250 Sobic001G394250 Sobic001G519400--Sobic001G394250 Sobic001G519400--Sobic001G003600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G519400--Sobic005G110436 Sobic001G519400--Sobic009G115050 Sobic001G519400--Sobic002G329500 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic001G519400--Sobic003G096100 Sobic002G020000 Sobic002G020000 Sobic001G519400--Sobic002G020000 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic001G519400--Sobic004G076000 Sobic003G074600 Sobic003G074600 Sobic001G519400--Sobic003G074600 Sobic003G383800--Sobic004G263000 Sobic001G250200 Sobic001G250200 Sobic003G383800--Sobic001G250200 Sobic003G383800--Sobic002G033000 Sobic003G108000 Sobic003G108000 Sobic003G383800--Sobic003G108000 Sobic003G383800--Sobic005G110436 Sobic003G383800--Sobic001G519400 Sobic005G080050 Sobic005G080050 Sobic003G383800--Sobic005G080050 Sobic009G055900 Sobic009G055900 Sobic003G383800--Sobic009G055900 Sobic003G383800--Sobic001G127700 Sobic010G078300 Sobic010G078300 Sobic002G314800--Sobic010G078300 Sobic002G314800--Sobic001G099300 Sobic010G022000 Sobic010G022000 Sobic002G314800--Sobic010G022000 Sobic002G314800--Sobic008G066700 Sobic007G000700 Sobic007G000700 Sobic002G314800--Sobic007G000700 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic002G314800--Sobic010G228100 Sobic008G133200 Sobic008G133200 Sobic002G314800--Sobic008G133200 Sobic006G219200 Sobic006G219200 Sobic002G314800--Sobic006G219200 Sobic009G151100 Sobic009G151100 Sobic002G314800--Sobic009G151100 Sobic003G058600--Sobic004G060700 Sobic003G058600--Sobic001G003600 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic003G058600--Sobic001G435600 Sobic003G058600--Sobic009G115050 Sobic003G058600--Sobic007G009600 Sobic003G058600--Sobic002G329500 Sobic003G058600--Sobic006G172700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic003G058600--Sobic002G415400 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic003G058600--Sobic002G415300 Sobic009G185400--Sobic009G151100 Sobic004G000700 Sobic004G000700 Sobic009G185400--Sobic004G000700 Sobic001G249600 Sobic001G249600 Sobic009G185400--Sobic001G249600 Sobic003G230900 Sobic003G230900 Sobic009G185400--Sobic003G230900 Sobic003G365800 Sobic003G365800 Sobic009G185400--Sobic003G365800 Sobic010G197300 Sobic010G197300 Sobic009G185400--Sobic010G197300 Sobic006G253900 Sobic006G253900 Sobic009G185400--Sobic006G253900 Sobic009G185400--Sobic009G035601 Sobic009G130600 Sobic009G130600 Sobic009G185400--Sobic009G130600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.