Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G199632.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6G9
Pfam -
Panther DB PTHR34558 PTHR34558:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G09280 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g36360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006381
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G343300 3-beta-hydroxy-delta5-steroid dehydrogenase (At)(PubMedID : 27208977)@NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K07748: NSDHL, sterol-4alpha-carboxylate 3-dehydrogenase (decarboxylating)
2 Sobic.002G192700 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G342600 cytochrome c, putative, expressed K08906: cytochrome c6
4 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
5 Sobic.003G365900 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
6 Sobic.005G035100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G097000 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed K17744: L-galactose dehydrogenase
8 Sobic.007G003700 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.009G035601 - -
10 Sobic.003G064150 - -
11 Sobic.009G224900 ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain containing protein, expressed K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
12 Sobic.008G159150 - -
13 Sobic.006G069400 expressed protein -
14 Sobic.001G288601 - -
15 Sobic.004G263000 expressed protein -
16 Sobic.007G090424 - K01061: carboxymethylenebutenolidase
17 Sobic.001G519400 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G178400 - -
19 Sobic.005G050900 - -
20 Sobic.005G226450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G199632 Sobic001G199632 Sobic001G343300 Sobic001G343300 Sobic001G199632--Sobic001G343300 Sobic002G192700 Sobic002G192700 Sobic001G199632--Sobic002G192700 Sobic002G342600 Sobic002G342600 Sobic001G199632--Sobic002G342600 Sobic003G212800 Sobic003G212800 Sobic001G199632--Sobic003G212800 Sobic003G365900 Sobic003G365900 Sobic001G199632--Sobic003G365900 Sobic005G035100 Sobic005G035100 Sobic001G199632--Sobic005G035100 Sobic008G097000 Sobic008G097000 Sobic001G199632--Sobic008G097000 Sobic007G003700 Sobic007G003700 Sobic001G199632--Sobic007G003700 Sobic009G035601 Sobic009G035601 Sobic001G199632--Sobic009G035601 Sobic001G343300--Sobic001G199632 Sobic009G119400 Sobic009G119400 Sobic001G343300--Sobic009G119400 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic001G343300--Sobic008G163200 Sobic005G183300 Sobic005G183300 Sobic001G343300--Sobic005G183300 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic001G343300--Sobic002G329500 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic001G343300--Sobic004G060700 Sobic001G435600 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Octagon: transcription factors


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