Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G159150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6W2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G005800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@laccase-23 precursor, putative, expressed K05909: laccase
2 Sobic.009G067200 expressed protein -
3 Sobic.007G003000 no apical meristem protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G058000 - -
5 Sobic.003G064150 - -
6 Sobic.010G272400 expressed protein -
7 Sobic.002G189800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G212600 WAX2, putative, expressed -
9 Sobic.004G072400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.001G199632 - -
11 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
12 Sobic.006G069400 expressed protein -
13 Sobic.001G510000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
14 Sobic.009G224900 ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain containing protein, expressed K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
15 Sobic.008G055000 - -
16 Sobic.001G086200 COBRA, putative, expressed -
17 Sobic.005G050900 - -
18 Sobic.001G392000 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.003G085200 expressed protein -
20 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G159150 Sobic008G159150 Sobic005G005800 Sobic005G005800 Sobic008G159150--Sobic005G005800 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic008G159150--Sobic009G067200 Sobic007G003000 Sobic007G003000 Sobic008G159150--Sobic007G003000 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic008G159150--Sobic001G058000 Sobic003G064150 Sobic003G064150 Sobic008G159150--Sobic003G064150 Sobic010G272400 Sobic010G272400 Sobic008G159150--Sobic010G272400 Sobic002G189800 Sobic002G189800 Sobic008G159150--Sobic002G189800 Sobic010G212600 Sobic010G212600 Sobic008G159150--Sobic010G212600 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic008G159150--Sobic004G072400 Sobic005G005800--Sobic004G072400 Sobic005G005800--Sobic001G058000 Sobic001G392000 Sobic001G392000 Sobic005G005800--Sobic001G392000 Sobic006G194700 Sobic006G194700 Sobic005G005800--Sobic006G194700 Sobic001G303600 Sobic001G303600 Sobic005G005800--Sobic001G303600 Sobic005G005800--Sobic007G003000 Sobic003G238200 Sobic003G238200 Sobic005G005800--Sobic003G238200 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic005G005800--Sobic009G133100 Sobic005G205550 Sobic005G205550 Sobic005G005800--Sobic005G205550 Sobic009G067200--Sobic010G212600 Sobic003G243400 Sobic003G243400 Sobic009G067200--Sobic003G243400 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic009G067200--Sobic004G290400 Sobic002G267050 Sobic002G267050 Sobic009G067200--Sobic002G267050 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic009G067200--Sobic001G022000 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic009G067200--Sobic002G044900 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic009G067200--Sobic001G152500 Sobic009G067200--Sobic010G272400 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic009G067200--Sobic002G384800 Sobic007G003000--Sobic005G005800 Sobic007G003000--Sobic001G058000 Sobic007G003000--Sobic006G194700 Sobic001G479600 Sobic001G479600 Sobic007G003000--Sobic001G479600 Sobic007G003000--Sobic004G072400 Sobic003G125000 Sobic003G125000 Sobic007G003000--Sobic003G125000 Sobic001G086200 Sobic001G086200 Sobic007G003000--Sobic001G086200 Sobic007G003000--Sobic001G392000 Sobic003G082700 Sobic003G082700 Sobic007G003000--Sobic003G082700 Sobic001G058000--Sobic004G072400 Sobic001G058000--Sobic009G133100 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic001G058000--Sobic004G233900 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic001G058000--Sobic001G364200 Sobic009G190900 Sobic009G190900 Sobic001G058000--Sobic009G190900 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic001G058000--Sobic005G050900 Sobic004G101100 Sobic004G101100 Sobic001G058000--Sobic004G101100 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic001G058000--Sobic007G131300 Sobic001G058000--Sobic005G005800 Sobic003G064150--Sobic005G050900 Sobic005G029866 Sobic005G029866 Sobic003G064150--Sobic005G029866 Sobic009G125700 Sobic009G125700 Sobic003G064150--Sobic009G125700 Sobic001G158966 Sobic001G158966 Sobic003G064150--Sobic001G158966 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic003G064150--Sobic003G190701 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic003G064150--Sobic004G184900 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic003G064150--Sobic005G201800 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic003G064150--Sobic001G234700 Sobic010G272400--Sobic010G212600 Sobic010G272400--Sobic002G267050 Sobic010G272400--Sobic003G243400 Sobic010G272400--Sobic009G067200 Sobic010G272400--Sobic001G152500 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic010G272400--Sobic005G135500 Sobic010G272400--Sobic005G201800 Sobic010G272400--Sobic002G044900 Sobic010G272400--Sobic005G029866 Sobic003G070300 Sobic003G070300 Sobic002G189800--Sobic003G070300 Sobic002G189800--Sobic003G243400 Sobic001G162900 Sobic001G162900 Sobic002G189800--Sobic001G162900 Sobic002G189800--Sobic010G212600 Sobic002G189800--Sobic009G067200 Sobic002G008000 Sobic002G008000 Sobic002G189800--Sobic002G008000 Sobic002G223100 Sobic002G223100 Sobic002G189800--Sobic002G223100 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic002G189800--Sobic009G053001 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic002G189800--Sobic004G303150 Sobic010G212600--Sobic003G243400 Sobic010G212600--Sobic002G267050 Sobic010G212600--Sobic009G067200 Sobic010G212600--Sobic001G152500 Sobic010G212600--Sobic002G044900 Sobic010G212600--Sobic005G135500 Sobic010G212600--Sobic010G272400 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic010G212600--Sobic008G053000 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic010G212600--Sobic002G401301 Sobic004G072400--Sobic009G133100 Sobic004G072400--Sobic001G058000 Sobic004G072400--Sobic001G364200 Sobic004G072400--Sobic007G131300 Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic004G072400--Sobic008G055650 Sobic004G072400--Sobic004G101100 Sobic004G072400--Sobic005G050900 Sobic004G072400--Sobic001G392000 Sobic004G072400--Sobic004G233900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.