Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G142400.1,Sobic.009G142400.3,Sobic.009G142400.2
Synonym GA5, ATGA20OX1, AT2301, Sb09g020760, GA20OX1
Functional annotation gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed
UniProt C5YY68 , A0A1Z5R3T1 , A0A1Z5R2N9
Pfam PF03171 PF14226 PF14226 PF03171
Panther DB PTHR10209 PTHR10209:SF115
NCBI CDD KOG0143; Iron/ascorbate family oxidoreductases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G25420 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein,gibberellin 20-oxidase 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g34854.2,LOC_Os05g34854.1 : gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK06181 , PNT71228 , PNT71226 , PNT71227
Barley HORVU1Hr1G063780.7 , HORVU1Hr1G063780.6 , HORVU1Hr1G063780.5 , HORVU1Hr1G063780.4 , HORVU1Hr1G063780.3 , HORVU1Hr1G063780.2 , HORVU1Hr1G063780.1
Wheat TraesCS1D02G263700 , TraesCS1A02G263600 , TraesCS1B02G274200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G142400 Sobic009G142400 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic009G142400--Sobic003G218000 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic009G142400--Sobic001G345500 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic009G142400--Sobic009G002100 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic009G142400--Sobic009G121200 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic009G142400--Sobic004G020200 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic009G142400--Sobic008G056600 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic009G142400--Sobic001G136000 Sobic002G001200 Sobic002G001200 Sobic009G142400--Sobic002G001200 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic009G142400--Sobic003G407700 Sobic003G218000--Sobic001G136000 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic003G218000--Sobic007G128000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic001G417700 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic003G218000--Sobic002G080450 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic003G218000--Sobic002G099700 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic003G218000--Sobic009G048700 Sobic003G218000--Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic003G218000--Sobic007G094700 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic001G345500--Sobic006G064450 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic001G345500--Sobic003G133600 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic001G345500--Sobic007G219601 Sobic001G345500--Sobic007G094700 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic001G345500--Sobic005G144500 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic001G345500--Sobic001G068066 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic001G345500--Sobic004G203150 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic001G345500--Sobic005G078000 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic001G345500--Sobic004G328200 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic009G002100--Sobic009G145000 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic009G002100--Sobic002G243400 Sobic009G002100--Sobic001G417700 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic009G002100--Sobic002G418300 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic009G002100--Sobic001G240600 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G002100--Sobic008G155700 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic009G002100--Sobic002G189500 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic009G002100--Sobic004G080800 Sobic001G220500 Sobic001G220500 Sobic009G002100--Sobic001G220500 Sobic004G057300 Sobic004G057300 Sobic009G121200--Sobic004G057300 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic009G121200--Sobic003G191350 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic009G121200--Sobic004G328500 Sobic009G121200--Sobic003G407700 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic009G121200--Sobic001G165901 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic009G121200--Sobic004G052600 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic009G121200--Sobic010G073900 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic009G121200--Sobic007G081100 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic009G121200--Sobic002G364700 Sobic004G020200--Sobic001G417700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic004G020200--Sobic009G008000 Sobic004G020200--Sobic007G094700 Sobic004G020200--Sobic009G048700 Sobic004G020200--Sobic007G219601 Sobic004G020200--Sobic001G136000 Sobic004G020200--Sobic008G155700 Sobic004G020200--Sobic002G418300 Sobic004G020200--Sobic009G145000 Sobic008G056600--Sobic002G418300 Sobic008G056600--Sobic001G417700 Sobic008G056600--Sobic007G094700 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic008G056600--Sobic002G101600 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic008G056600--Sobic001G029300 Sobic008G056600--Sobic009G048700 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic008G056600--Sobic006G266400 Sobic008G056600--Sobic007G128000 Sobic008G056600--Sobic003G133600 Sobic001G136000--Sobic007G128000 Sobic001G136000--Sobic001G417700 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic001G136000--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic001G136000--Sobic010G129450 Sobic001G136000--Sobic002G101600 Sobic001G136000--Sobic006G266400 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G136000--Sobic007G082100 Sobic001G136000--Sobic007G081100 Sobic001G136000--Sobic001G240600 Sobic005G093200 Sobic005G093200 Sobic002G001200--Sobic005G093200 Sobic005G172000 Sobic005G172000 Sobic002G001200--Sobic005G172000 Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic002G001200--Sobic002G104801 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic002G001200--Sobic004G228300 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic002G001200--Sobic009G089200 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic002G001200--Sobic010G166600 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic002G001200--Sobic006G143900 Sobic003G335700 Sobic003G335700 Sobic002G001200--Sobic003G335700 Sobic003G145300 Sobic003G145300 Sobic002G001200--Sobic003G145300 Sobic003G407700--Sobic010G073900 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic003G407700--Sobic002G199800 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic003G407700--Sobic004G349600 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic003G407700--Sobic009G238650 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic003G407700--Sobic006G239500 Sobic003G407700--Sobic009G121200 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic003G407700--Sobic009G098700 Sobic005G120400 Sobic005G120400 Sobic003G407700--Sobic005G120400 Sobic003G407700--Sobic001G165901
Octagon: transcription factors


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