Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G145900.3,Sobic.009G145900.6,Sobic.009G145900.2,Sobic.009G145900.4,Sobic.009G145900.5,Sobic.009G145900.1
Synonym Sb09g021070
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
PB1 domain containing protein, expressed
UniProt C5YYA4
Pfam PF00564
Panther DB PTHR31066 PTHR31066:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G49920 : Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35260.1 : PB1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037345
Brachypodium KQK06123
Barley -
Wheat TraesCS1A02G266900 , TraesCS1B02G277800 , TraesCS1D02G267100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G032300 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
2 Sobic.005G076650 - -
3 Sobic.008G098098 - -
4 Sobic.008G119200 - -
5 Sobic.001G000900 expressed protein -
6 Sobic.009G088401 - -
7 Sobic.003G001550 - -
8 Sobic.006G123700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
9 Sobic.003G142900 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
10 Sobic.003G173032 - -
11 Sobic.010G136900 white-brown complex homolog protein 11, putative, expressed -
12 Sobic.003G028800 Protein of unknown function (DUF1677)(PubMedID : 26465154)@Protein of unknown function (DUF1677)(PubMedID : 26465154)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.003G283750 - -
14 Sobic.008G023000 expressed protein -
15 Sobic.002G422200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
17 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
19 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
20 Sobic.001G527400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G145900 Sobic009G145900 Sobic008G032300 Sobic008G032300 Sobic009G145900--Sobic008G032300 Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic009G145900--Sobic005G076650 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic009G145900--Sobic008G098098 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic009G145900--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic009G145900--Sobic001G000900 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic009G145900--Sobic009G088401 Sobic003G001550 Sobic003G001550 Sobic009G145900--Sobic003G001550 Sobic006G123700 Sobic006G123700 Sobic009G145900--Sobic006G123700 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic009G145900--Sobic003G142900 Sobic008G032300--Sobic008G098098 Sobic010G128900 Sobic010G128900 Sobic008G032300--Sobic010G128900 Sobic002G110800 Sobic002G110800 Sobic008G032300--Sobic002G110800 Sobic008G032300--Sobic009G145900 Sobic008G032300--Sobic001G000900 Sobic003G028800 Sobic003G028800 Sobic008G032300--Sobic003G028800 Sobic008G032300--Sobic008G119200 Sobic002G101800 Sobic002G101800 Sobic008G032300--Sobic002G101800 Sobic008G032300--Sobic006G123700 Sobic005G076650--Sobic008G098098 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic009G088401 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic004G043200 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic005G076650--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic008G119200 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic005G076650--Sobic001G516200 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic005G076650--Sobic006G273500 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic001G000900--Sobic008G098098 Sobic001G000900--Sobic008G119200 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic001G000900--Sobic010G029200 Sobic001G000900--Sobic003G142900 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic001G000900--Sobic010G040000 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic001G000900--Sobic009G039400 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic001G000900--Sobic010G208300 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic001G000900--Sobic002G188100 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic001G000900--Sobic006G133650 Sobic009G088401--Sobic008G023000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic005G209800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic008G002100 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic009G088401--Sobic003G173032 Sobic009G088401--Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic007G072400 Sobic009G088401--Sobic004G226300 Sobic009G088401--Sobic007G183000 Sobic003G001550--Sobic009G088401 Sobic005G098200 Sobic005G098200 Sobic003G001550--Sobic005G098200 Sobic003G001550--Sobic007G072400 Sobic003G001550--Sobic008G098098 Sobic003G001550--Sobic008G119200 Sobic003G001550--Sobic007G016000 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic003G001550--Sobic004G180600 Sobic003G001550--Sobic005G231800 Sobic003G001550--Sobic003G173032 Sobic006G123700--Sobic002G101800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic006G123700--Sobic004G224300 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G123700--Sobic001G137200 Sobic006G123700--Sobic002G048250 Sobic006G123700--Sobic003G173032 Sobic006G123700--Sobic005G209800 Sobic006G123700--Sobic008G002100 Sobic006G123700--Sobic001G527400 Sobic006G123700--Sobic007G183000 Sobic003G142900--Sobic010G029200 Sobic003G142900--Sobic008G023000 Sobic003G142900--Sobic008G002100 Sobic003G142900--Sobic001G527400 Sobic003G142900--Sobic004G226300 Sobic003G142900--Sobic007G183000 Sobic003G142900--Sobic005G209800 Sobic003G142900--Sobic003G173032 Sobic003G142900--Sobic005G231800
Octagon: transcription factors


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