Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G151700.1
Synonym Sb09g021550, LCV2
Functional annotation protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed
UniProt C5YYP7
Pfam PF04367
Panther DB PTHR31876 PTHR31876:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G43130 : like COV 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g64780.2 : COV1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026696 , Zm00025a043847 , Zm00025a039558 , Zm00025a037298
Brachypodium KQK06061 , KQK06060 , KQK10779 , KQK10780
Barley HORVU1Hr1G075030.6 , HORVU1Hr1G075030.7 , HORVU1Hr1G075030.4 , HORVU1Hr1G075030.5 , HORVU1Hr1G075030.2 , HORVU1Hr1G075030.3 , HORVU1Hr1G075030.1 , HORVU1Hr1G075030.8 , HORVU1Hr1G075030.9 , HORVU3Hr1G083110.3 , HORVU3Hr1G083110.1 , HORVU3Hr1G083110.6 , HORVU3Hr1G083110.7 , HORVU3Hr1G083110.4 , HORVU1Hr1G075030.10
Wheat TraesCS1A02G272400 , TraesCS3B02G412400 , TraesCS3A02G379800 , TraesCS1B02G282400 , TraesCS3D02G372800 , TraesCS3D02G372800 , TraesCS1D02G272500
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G267500 katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog 1, putative, expressed K18643: katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1
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Gene co-expression network
sample Sobic009G151700 Sobic009G151700 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic009G151700--Sobic006G267500 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic009G151700--Sobic009G206500 Sobic003G345200 Sobic003G345200 Sobic009G151700--Sobic003G345200 Sobic007G139500 Sobic007G139500 Sobic009G151700--Sobic007G139500 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic009G151700--Sobic009G246700 Sobic007G040301 Sobic007G040301 Sobic009G151700--Sobic007G040301 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic009G151700--Sobic009G061000 Sobic002G161700 Sobic002G161700 Sobic009G151700--Sobic002G161700 Sobic009G119700 Sobic009G119700 Sobic009G151700--Sobic009G119700 Sobic006G267500--Sobic009G061000 Sobic006G267500--Sobic009G206500 Sobic009G212100 Sobic009G212100 Sobic006G267500--Sobic009G212100 Sobic006G254500 Sobic006G254500 Sobic006G267500--Sobic006G254500 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic006G267500--Sobic001G437500 Sobic004G315700 Sobic004G315700 Sobic006G267500--Sobic004G315700 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic006G267500--Sobic010G090500 Sobic005G204700 Sobic005G204700 Sobic006G267500--Sobic005G204700 Sobic001G296800 Sobic001G296800 Sobic006G267500--Sobic001G296800 Sobic009G206500--Sobic007G139500 Sobic010G067800 Sobic010G067800 Sobic009G206500--Sobic010G067800 Sobic009G206500--Sobic006G267500 Sobic009G206500--Sobic001G437500 Sobic001G144200 Sobic001G144200 Sobic009G206500--Sobic001G144200 Sobic009G206500--Sobic007G040301 Sobic002G275500 Sobic002G275500 Sobic009G206500--Sobic002G275500 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic009G206500--Sobic009G026101 Sobic001G183600 Sobic001G183600 Sobic009G206500--Sobic001G183600 Sobic009G073400 Sobic009G073400 Sobic003G345200--Sobic009G073400 Sobic003G345200--Sobic009G151700 Sobic010G054600 Sobic010G054600 Sobic003G345200--Sobic010G054600 Sobic006G172200 Sobic006G172200 Sobic003G345200--Sobic006G172200 Sobic009G001200 Sobic009G001200 Sobic003G345200--Sobic009G001200 Sobic004G119700 Sobic004G119700 Sobic003G345200--Sobic004G119700 Sobic003G345200--Sobic009G206500 Sobic003G345200--Sobic010G067800 Sobic006G140100 Sobic006G140100 Sobic003G345200--Sobic006G140100 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic007G139500--Sobic001G196000 Sobic001G051300 Sobic001G051300 Sobic007G139500--Sobic001G051300 Sobic007G139500--Sobic009G206500 Sobic007G139500--Sobic001G437500 Sobic003G179500 Sobic003G179500 Sobic007G139500--Sobic003G179500 Sobic001G103000 Sobic001G103000 Sobic007G139500--Sobic001G103000 Sobic003G017500 Sobic003G017500 Sobic007G139500--Sobic003G017500 Sobic002G191000 Sobic002G191000 Sobic007G139500--Sobic002G191000 Sobic009G214100 Sobic009G214100 Sobic007G139500--Sobic009G214100 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic009G246700--Sobic001G133900 Sobic009G246700--Sobic009G026101 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic009G246700--Sobic001G406700 Sobic007G119500 Sobic007G119500 Sobic009G246700--Sobic007G119500 Sobic001G072600 Sobic001G072600 Sobic009G246700--Sobic001G072600 Sobic002G167600 Sobic002G167600 Sobic009G246700--Sobic002G167600 Sobic001G360700 Sobic001G360700 Sobic009G246700--Sobic001G360700 Sobic001G460400 Sobic001G460400 Sobic009G246700--Sobic001G460400 Sobic006G144600 Sobic006G144600 Sobic009G246700--Sobic006G144600 Sobic007G040301--Sobic009G206500 Sobic007G040301--Sobic001G437500 Sobic007G040301--Sobic009G026101 Sobic007G040301--Sobic001G144200 Sobic007G040301--Sobic001G406700 Sobic008G141200 Sobic008G141200 Sobic007G040301--Sobic008G141200 Sobic004G274800 Sobic004G274800 Sobic007G040301--Sobic004G274800 Sobic007G040301--Sobic009G151700 Sobic007G040301--Sobic006G267500 Sobic009G061000--Sobic006G267500 Sobic009G061000--Sobic009G073400 Sobic009G061000--Sobic001G437500 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic009G061000--Sobic002G276600 Sobic001G159800 Sobic001G159800 Sobic009G061000--Sobic001G159800 Sobic009G061000--Sobic010G090500 Sobic009G061000--Sobic009G206500 Sobic009G167100 Sobic009G167100 Sobic009G061000--Sobic009G167100 Sobic009G061000--Sobic001G051300 Sobic002G393200 Sobic002G393200 Sobic002G161700--Sobic002G393200 Sobic002G161700--Sobic009G206500 Sobic004G308100 Sobic004G308100 Sobic002G161700--Sobic004G308100 Sobic007G166800 Sobic007G166800 Sobic002G161700--Sobic007G166800 Sobic002G161700--Sobic009G151700 Sobic002G161700--Sobic009G061000 Sobic003G013000 Sobic003G013000 Sobic002G161700--Sobic003G013000 Sobic002G319200 Sobic002G319200 Sobic002G161700--Sobic002G319200 Sobic002G161700--Sobic006G254500 Sobic002G303800 Sobic002G303800 Sobic009G119700--Sobic002G303800 Sobic001G146900 Sobic001G146900 Sobic009G119700--Sobic001G146900 Sobic010G103700 Sobic010G103700 Sobic009G119700--Sobic010G103700 Sobic003G412800 Sobic003G412800 Sobic009G119700--Sobic003G412800 Sobic009G119700--Sobic001G051300 Sobic003G444300 Sobic003G444300 Sobic009G119700--Sobic003G444300 Sobic009G119700--Sobic003G179500 Sobic009G119700--Sobic007G139500 Sobic001G169800 Sobic001G169800 Sobic009G119700--Sobic001G169800
Octagon: transcription factors


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