Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G188700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YK64
Pfam PF12274
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g48730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G328250 - -
2 Sobic.006G099100 - -
3 Sobic.007G079500 hypothetical protein -
4 Sobic.004G239200 transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
5 Sobic.002G421501 - -
6 Sobic.006G163033 - -
7 Sobic.003G277850 - -
8 Sobic.003G034200 - -
9 Sobic.006G209200 transferase family domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G363466 - -
11 Sobic.001G173251 - -
12 Sobic.006G174000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cis-zeatin O-glucosyltransferase, putative, expressed K13495: cis-zeatin O-glucosyltransferase
13 Sobic.007G159300 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
14 Sobic.006G252532 - -
15 Sobic.002G242100 expressed protein -
16 Sobic.003G076100 limonoid UDP-glucosyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.007G002400 - -
18 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G047200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G161300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@Ribosomal protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@40S ribosomal protein S15a, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G188700 Sobic010G188700 Sobic002G328250 Sobic002G328250 Sobic010G188700--Sobic002G328250 Sobic006G099100 Sobic006G099100 Sobic010G188700--Sobic006G099100 Sobic007G079500 Sobic007G079500 Sobic010G188700--Sobic007G079500 Sobic004G239200 Sobic004G239200 Sobic010G188700--Sobic004G239200 Sobic002G421501 Sobic002G421501 Sobic010G188700--Sobic002G421501 Sobic006G163033 Sobic006G163033 Sobic010G188700--Sobic006G163033 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic010G188700--Sobic003G277850 Sobic003G034200 Sobic003G034200 Sobic010G188700--Sobic003G034200 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic010G188700--Sobic006G209200 Sobic002G328250--Sobic004G239200 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic002G328250--Sobic001G173251 Sobic002G328250--Sobic006G099100 Sobic002G328250--Sobic007G079500 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic002G328250--Sobic002G363466 Sobic002G328250--Sobic010G188700 Sobic002G328250--Sobic003G277850 Sobic007G170000 Sobic007G170000 Sobic002G328250--Sobic007G170000 Sobic010G030600 Sobic010G030600 Sobic002G328250--Sobic010G030600 Sobic006G253300 Sobic006G253300 Sobic006G099100--Sobic006G253300 Sobic006G099100--Sobic004G239200 Sobic009G161300 Sobic009G161300 Sobic006G099100--Sobic009G161300 Sobic006G099100--Sobic002G363466 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic006G099100--Sobic002G130601 Sobic006G099100--Sobic007G079500 Sobic006G099100--Sobic002G328250 Sobic006G099100--Sobic010G188700 Sobic006G099100--Sobic003G277850 Sobic007G079500--Sobic001G173251 Sobic007G079500--Sobic002G363466 Sobic007G079500--Sobic006G209200 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic007G079500--Sobic004G093300 Sobic007G079500--Sobic003G277850 Sobic003G079466 Sobic003G079466 Sobic007G079500--Sobic003G079466 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G079500--Sobic004G279900 Sobic003G223600 Sobic003G223600 Sobic007G079500--Sobic003G223600 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic007G079500--Sobic007G002400 Sobic004G239200--Sobic002G328250 Sobic004G239200--Sobic006G099100 Sobic010G124300 Sobic010G124300 Sobic004G239200--Sobic010G124300 Sobic004G239200--Sobic007G170000 Sobic004G240600 Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic009G161300 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic004G239200--Sobic006G190700 Sobic010G079600 Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic002G130601 Sobic004G349237 Sobic004G349237 Sobic002G421501--Sobic004G349237 Sobic003G265150 Sobic003G265150 Sobic002G421501--Sobic003G265150 Sobic002G372900 Sobic002G372900 Sobic002G421501--Sobic002G372900 Sobic002G361600 Sobic002G361600 Sobic002G421501--Sobic002G361600 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic002G421501--Sobic008G014601 Sobic002G421501--Sobic010G188700 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic002G421501--Sobic003G380700 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic002G421501--Sobic007G047200 Sobic002G247700 Sobic002G247700 Sobic002G421501--Sobic002G247700 Sobic006G163033--Sobic003G223600 Sobic007G159300 Sobic007G159300 Sobic006G163033--Sobic007G159300 Sobic006G163033--Sobic004G279900 Sobic006G174000 Sobic006G174000 Sobic006G163033--Sobic006G174000 Sobic006G163033--Sobic007G079500 Sobic007G122866 Sobic007G122866 Sobic006G163033--Sobic007G122866 Sobic006G163033--Sobic004G093300 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic006G163033--Sobic006G205800 Sobic006G163033--Sobic006G209200 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic004G093300 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic006G209200 Sobic003G277850--Sobic001G173251 Sobic003G277850--Sobic007G079500 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic003G277850--Sobic004G022700 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic003G277850--Sobic005G144900 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic003G277850--Sobic006G175100 Sobic003G034200--Sobic010G124300 Sobic003G034200--Sobic003G277850 Sobic003G034200--Sobic004G239200 Sobic003G034200--Sobic007G079500 Sobic003G034200--Sobic010G188700 Sobic003G034200--Sobic001G173251 Sobic003G076100 Sobic003G076100 Sobic003G034200--Sobic003G076100 Sobic003G034200--Sobic002G328250 Sobic003G377400 Sobic003G377400 Sobic003G034200--Sobic003G377400 Sobic006G209200--Sobic001G173251 Sobic006G209200--Sobic004G093300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic002G363466 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic003G123800 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic006G209200--Sobic005G120466 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic001G328850 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic006G209200--Sobic009G185601
Octagon: transcription factors


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