Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G161300.3,Sobic.009G161300.4
Synonym Sb09g022390,
Functional annotation expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user) (PubMedID : 28697783)
Ribosomal protein( (PubMedID : 26759170,(PubMedID : 24597475)
40S ribosomal protein S15a, putative, expressed
UniProt A0A1B6P8T1 , A0A1Z5R302
Pfam PF00410
Panther DB PTHR11758 PTHR11758:SF16
NCBI CDD KOG1754; 40S ribosomal protein S15/S22
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G59850 : Ribosomal protein S8 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g27760.1 : 40S ribosomal protein S15a, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK05875 , KQK05876
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G161300 Sobic009G161300 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic009G161300--Sobic006G268500 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic009G161300--Sobic009G071000 Sobic006G099100 Sobic006G099100 Sobic009G161300--Sobic006G099100 Sobic004G239200 Sobic004G239200 Sobic009G161300--Sobic004G239200 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic009G161300--Sobic002G010900 Sobic006G253300 Sobic006G253300 Sobic009G161300--Sobic006G253300 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic009G161300--Sobic002G422300 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic009G161300--Sobic006G227750 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic009G161300--Sobic009G157450 Sobic006G268500--Sobic009G071000 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic006G268500--Sobic008G140900 Sobic006G268500--Sobic009G157450 Sobic006G268500--Sobic006G227750 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic006G268500--Sobic008G158332 Sobic006G268500--Sobic002G422300 Sobic006G268500--Sobic002G010900 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G268500--Sobic006G234900 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic006G268500--Sobic006G026500 Sobic009G071000--Sobic006G268500 Sobic009G071000--Sobic008G140900 Sobic009G071000--Sobic002G422300 Sobic009G071000--Sobic002G010900 Sobic009G071000--Sobic006G227750 Sobic009G071000--Sobic009G157450 Sobic009G071000--Sobic008G158332 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic006G234900 Sobic006G099100--Sobic006G253300 Sobic006G099100--Sobic004G239200 Sobic006G099100--Sobic009G161300 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G099100--Sobic002G363466 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic006G099100--Sobic002G130601 Sobic007G079500 Sobic007G079500 Sobic006G099100--Sobic007G079500 Sobic002G328250 Sobic002G328250 Sobic006G099100--Sobic002G328250 Sobic010G188700 Sobic010G188700 Sobic006G099100--Sobic010G188700 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic006G099100--Sobic003G277850 Sobic004G239200--Sobic002G328250 Sobic004G239200--Sobic006G099100 Sobic010G124300 Sobic010G124300 Sobic004G239200--Sobic010G124300 Sobic007G170000 Sobic007G170000 Sobic004G239200--Sobic007G170000 Sobic004G240600 Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic004G240600 Sobic004G239200--Sobic009G161300 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic004G239200--Sobic006G190700 Sobic010G079600 Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic010G079600 Sobic004G239200--Sobic002G130601 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic008G158332 Sobic006G253300--Sobic006G099100 Sobic006G253300--Sobic006G234900 Sobic006G253300--Sobic006G026500 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G253300--Sobic005G108601 Sobic006G253300--Sobic009G157450 Sobic006G253300--Sobic006G268500 Sobic006G253300--Sobic008G140900 Sobic006G253300--Sobic002G010900 Sobic006G253300--Sobic006G227750 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic006G227750--Sobic006G268500 Sobic006G227750--Sobic009G157450 Sobic006G227750--Sobic006G234900 Sobic006G227750--Sobic008G140900 Sobic006G227750--Sobic009G071000 Sobic006G227750--Sobic002G422300 Sobic006G227750--Sobic005G108601 Sobic006G227750--Sobic008G158332 Sobic006G227750--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic008G140900 Sobic009G157450--Sobic006G268500 Sobic009G157450--Sobic006G227750 Sobic009G157450--Sobic009G071000 Sobic009G157450--Sobic008G158332 Sobic009G157450--Sobic002G422300 Sobic009G157450--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic006G234900 Sobic009G157450--Sobic002G010900
Octagon: transcription factors


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